RNA–Protein interactions for RNA: YGR167W

CLC1, Transcript of Clathrin light chain, yeast

Gene CLC1, Length 702 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CLC1	YGR167W	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CLC1	YGR167W	CDC15	P27636	974 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLC1	YGR167W	MGM1	P32266	881 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLC1	YGR167W	CBF2	P32504	956 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLC1	YGR167W	ASK1	P35734	292 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLC1	YGR167W	SPC97	P38863	823 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLC1	YGR167W	FMP10	P40098	244 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLC1	YGR167W	ESL1	P40456	1118 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLC1	YGR167W	CTK2	P46962	323 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLC1	YGR167W	MRPL1	Q04599	285 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLC1	YGR167W	SWF1	Q04629	336 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLC1	YGR167W	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CLC1	YGR167W	ALY1	P36117	915 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLC1	YGR167W	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CLC1	YGR167W	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CLC1	YGR167W	SNM1	P40993	198 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLC1	YGR167W	YFR020W	P43600	232 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLC1	YGR167W	ASI1	P54074	624 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLC1	YGR167W	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.58	□□□□□ -1.68	not detected
CLC1	YGR167W	ENT1	Q12518	454 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLC1	YGR167W	STE50	P25344	346 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLC1	YGR167W	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CLC1	YGR167W	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CLC1	YGR167W	YIR016W	P40572	265 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLC1	YGR167W	MDV1	P47025	714 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLC1	YGR167W	VPS25	P47142	202 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLC1	YGR167W	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CLC1	YGR167W	MPS1	P54199	764 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLC1	YGR167W	MUB1	Q03162	620 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLC1	YGR167W	YLR112W	Q12130	139 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLC1	YGR167W	YBR085C-A	O43137	85 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLC1	YGR167W	RAP1	P11938	827 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLC1	YGR167W	ESL2	P36168	1195 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLC1	YGR167W	SLZ1	P40167	298 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLC1	YGR167W	YJR061W	P40355	935 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLC1	YGR167W	VTC2	P43585	828 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLC1	YGR167W	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CLC1	YGR167W	INN1	P53901	409 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLC1	YGR167W	CAC2	Q04199	468 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLC1	YGR167W	GSH2	Q08220	491 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLC1	YGR167W	NBP2	Q12163	236 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLC1	YGR167W	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CLC1	YGR167W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CLC1	YGR167W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CLC1	YGR167W	SAN1	P22470	610 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLC1	YGR167W	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CLC1	YGR167W	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CLC1	YGR167W	SIP4	P46954	829 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLC1	YGR167W	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CLC1	YGR167W	POS5	Q06892	414 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLC1	YGR167W	YOL159C	Q08300	171 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLC1	YGR167W	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CLC1	YGR167W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CLC1	YGR167W	MRP7	P12687	371 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLC1	YGR167W	YTP1	P53584	459 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLC1	YGR167W	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CLC1	YGR167W	YPL068C	Q02749	293 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLC1	YGR167W	SKG3	Q06315	1026 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLC1	YGR167W	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CLC1	YGR167W	ENT4	Q07872	247 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLC1	YGR167W	SDH5	Q08230	162 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLC1	YGR167W	CIR2	Q08822	631 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLC1	YGR167W	UBX3	Q12229	455 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLC1	YGR167W	YEL068C	P39977	110 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLC1	YGR167W	AAD10	P47182	288 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLC1	YGR167W	NNF2	P53253	936 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLC1	YGR167W	IZH1	Q03419	316 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLC1	YGR167W	ATG9	Q12142	997 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLC1	YGR167W	PAH1	P32567	862 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CLC1	YGR167W	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CLC1	YGR167W	BUR6	P40096	142 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CLC1	YGR167W	VRG4	P40107	337 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CLC1	YGR167W	PKP1	P40530	394 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CLC1	YGR167W	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CLC1	YGR167W	IRC8	P47046	822 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CLC1	YGR167W	SGM1	P47166	707 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CLC1	YGR167W	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CLC1	YGR167W	BSC5	P53755	489 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CLC1	YGR167W	SNA4	Q07549	140 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CLC1	YGR167W	SKM1	Q12469	655 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CLC1	YGR167W	AAC3	P18238	307 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CLC1	YGR167W	OPI1	P21957	404 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CLC1	YGR167W	CLB2	P24869	491 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CLC1	YGR167W	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
CLC1	YGR167W	ATO2	P32907	282 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CLC1	YGR167W	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
CLC1	YGR167W	LEU5	P38702	357 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CLC1	YGR167W	HXT9	P40885	567 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CLC1	YGR167W	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
CLC1	YGR167W	SGF73	P53165	657 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CLC1	YGR167W	BOP3	P53958	396 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CLC1	YGR167W	INA17	Q02888	182 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CLC1	YGR167W	RAD30	Q04049	632 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CLC1	YGR167W	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
CLC1	YGR167W	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
CLC1	YGR167W	CBP1	P07252	654 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CLC1	YGR167W	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
CLC1	YGR167W	SWI3	P32591	825 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CLC1	YGR167W	YIL152W	P40455	235 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CLC1	YGR167W	LYS14	P40971	790 aa		4.5	□□□□□ -1.69

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