RNA–Protein interactions for RNA: YGL009C

LEU1, Transcript of Isopropylmalate isomerase, yeast

Gene LEU1, Length 2,340 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LEU1	YGL009C	CDC15	P27636	974 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	NUP133	P36161	1157 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	CHK1	P38147	527 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	SPO22	P40511	975 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	4.81	□□□□□ -1.64	not detected
LEU1	YGL009C	THI6	P41835	540 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	SDH1	Q00711	640 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	MGR3	Q04472	501 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	SNO4	Q04902	237 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	TRI1	Q05024	226 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	HSP32	Q08992	237 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	SRP101	P32916	621 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	YRB2	P40517	327 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	YGR012W	P53206	393 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	YNR071C	P53757	342 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	EOS1	P53938	366 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	GCR2	Q01722	534 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	YMR210W	Q03649	449 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	YLR346C	Q06139	101 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	BOP2	Q06150	570 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	YPS7	Q06325	596 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	MLP1	Q02455	1875 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	LAM4	P38800	1345 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	DNF2	Q12675	1612 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	DAP2	P18962	818 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	BET2	P20133	325 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	PHO91	P27514	894 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	TRK2	P28584	889 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	GPT2	P36148	743 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	UME6	P39001	836 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	DSN1	P40568	576 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	LYS14	P40971	790 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	SMA1	Q02651	245 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	MSC3	Q05812	728 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	YLR456W	Q06199	204 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	MMR1	Q06324	491 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	STP4	Q07351	490 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	DSE3	Q08729	430 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	YRF1-4	O13559	1382 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	YLL067C	Q07888	1374 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	TRP3	P00937	484 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	CLB3	P24870	427 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	HXT1	P32465	570 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	RPD3	P32561	433 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	HEL1	P36113	551 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	AGE2	P40529	298 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	MSS2	P40990	351 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	PCD1	Q12524	340 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	ISN1	Q99312	450 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	DRS2	P39524	1355 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	GAL7	P08431	366 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	SAM35	P14693	329 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	MUP3	P38734	546 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	GIP4	P39732	760 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	PRM2	P40534	656 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	IMA1	P53051	589 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	RMR1	P53060	241 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	RSN1	Q03516	953 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	LDB17	Q12342	491 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	SFI1	Q12369	946 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	SNF2	P22082	1703 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	PSD1	P39006	500 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	UBP7	P40453	1071 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	TAF4	P50105	388 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	CGR1	P53188	120 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	SCW11	P53189	542 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	DIP5	P53388	608 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	ESBP6	P53918	673 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	FCP1	Q03254	732 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	PDR8	Q06149	701 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	VIK1	Q12045	647 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64

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