RNA–Protein interactions for RNA: YCL028W

RNQ1, Transcript of [PIN(+)] prion, yeast

Gene RNQ1, Length 1,218 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RNQ1	YCL028W	HSM3	P38348	480 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	YDR089W	P38966	869 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	MRX1	P40050	688 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	YIR007W	P40566	764 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	TEL2	P53038	688 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	BOL2	P53082	120 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	PEX13	P80667	386 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	YMR155W	Q03795	547 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	NOB1	Q08444	459 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	TGL5	Q12043	749 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	UBX3	Q12229	455 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	SBP1	P10080	294 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	BAS1	P22035	811 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	PHO3	P24031	467 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	VAC17	P25591	423 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	RPH1	P39956	796 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	SER33	P40510	469 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	IRR1	P40541	1150 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	IME4	P41833	600 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	MAD3	P47074	515 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	COG7	P53195	279 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	SPP2	Q02521	185 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	YDR131C	Q03899	556 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	IRC10	Q08118	586 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	MDY2	Q12285	212 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	MPH2	P0CD99	609 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.12	□□□□□ -0.63	RIP-Chip
RNQ1	YCL028W	STN1	P38960	494 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	AXL1	P40851	1208 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	PET130	P47065	347 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	OSH6	Q02201	448 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	NHP10	Q03435	203 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	VTA1	Q06263	330 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	YPT6	Q99260	215 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	RAD3	P06839	778 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	SFP1	P32432	683 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	DCW1	P36091	449 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	MUP3	P38734	546 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	FRE4	P53746	719 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	VPS16	Q03308	798 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	TAF12	Q03761	539 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	TVP15	Q03860	143 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	CIA1	Q05583	330 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	SEC10	Q06245	871 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	YPR084W	Q06821	456 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	BUD7	Q08754	746 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	STB3	Q12427	513 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	YPR089W	O13585	888 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	PTM1	P32857	523 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	CAB3	P36076	571 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	EFM1	P38732	585 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	PCL5	P38794	229 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	GDH3	P39708	457 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	PRM2	P40534	656 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	SWC4	P53201	476 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	BLS1	Q06071	122 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	ALR1	Q08269	859 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	ICT1	Q12385	394 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	SEM1	O94742	89 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	RHO2	P06781	192 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	SNT1	P25357	1226 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	CSE1	P33307	960 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	GCD14	P46959	383 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	AIF1	P52923	378 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	MRM2	P53123	320 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	NPY1	P53164	384 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	CLD1	P53264	445 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RNQ1	YCL028W	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
RNQ1	YCL028W	GAL11	P19659	1081 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RNQ1	YCL028W	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
RNQ1	YCL028W	SEC15	P22224	910 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RNQ1	YCL028W	VAN1	P23642	535 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RNQ1	YCL028W	CLB1	P24868	471 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RNQ1	YCL028W	NPP1	P25353	742 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RNQ1	YCL028W	PMT1	P33775	817 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RNQ1	YCL028W	PTH2	P34222	208 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RNQ1	YCL028W	EDS1	P38073	919 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RNQ1	YCL028W	PPX1	P38698	397 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RNQ1	YCL028W	SHU2	P38957	223 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RNQ1	YCL028W	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
RNQ1	YCL028W	TIM17	P39515	158 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RNQ1	YCL028W	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64

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