RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635861.1

CLN3-241, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 5

Gene CLN3, Length 1,404 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-241ENST00000635861 GPR153Q6NV75 609 aa22.06■■□□□ 1.12
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CLN3-241ENST00000635861 FCER1AP12319 257 aa22.06■■□□□ 1.12
CLN3-241ENST00000635861 ZNF287Q9HBT7 754 aa22.06■■□□□ 1.12
CLN3-241ENST00000635861 GSG1L2A8MUP6 293 aa22.05■■□□□ 1.12
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CLN3-241ENST00000635861 OSBP2Q969R2 916 aa22.04■■□□□ 1.12
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CLN3-241ENST00000635861 TDHQ8IZJ6 230 aa22.03■■□□□ 1.12
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CLN3-241ENST00000635861 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
CLN3-241ENST00000635861 MINDY4BA8MYZ0 360 aa22■■□□□ 1.11
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CLN3-241ENST00000635861 KCTD2Q14681 263 aa22■■□□□ 1.11
CLN3-241ENST00000635861 FAM83BQ5T0W9 1011 aa22■■□□□ 1.11
CLN3-241ENST00000635861 MMP19Q99542 508 aa22■■□□□ 1.11
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CLN3-241ENST00000635861 REPS2Q8NFH8 660 aa21.99■■□□□ 1.11
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CLN3-241ENST00000635861 MX1P20591 662 aa21.94■■□□□ 1.1
CLN3-241ENST00000635861 RTP1P59025 263 aa21.94■■□□□ 1.1
CLN3-241ENST00000635861 LRRC41Q15345 812 aa21.94■■□□□ 1.1
CLN3-241ENST00000635861 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa21.94■■□□□ 1.1
CLN3-241ENST00000635861 FEM1BQ9UK73 627 aa21.94■■□□□ 1.1
CLN3-241ENST00000635861 ZBED4O75132 1171 aa21.93■■□□□ 1.1
CLN3-241ENST00000635861 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
CLN3-241ENST00000635861 OAZ1P54368 228 aa21.93■■□□□ 1.1
CLN3-241ENST00000635861 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa21.93■■□□□ 1.1
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