Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVP2

GNL3, Guanine nucleotide-binding protein-like 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNL3Q9BVP2 SGPL1-204ENST00000486993 537 ntTSL 1 (best)24.55■■□□□ 1.521e-323■■■■■ 245.1
GNL3Q9BVP2 SGPL1-202ENST00000373202 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.411e-323■■■■■ 245.1
GNL3Q9BVP2 HOXC10-205ENST00000515593 526 ntTSL 49.49□□□□□ -0.897e-22■■■■■ 158.9
GNL3Q9BVP2 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.826e-17■■■■■ 149.9
GNL3Q9BVP2 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.516e-17■■■■■ 149.9
GNL3Q9BVP2 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.516e-17■■■■■ 149.9
GNL3Q9BVP2 PRKN-207ENST00000479615 904 ntTSL 517.93■□□□□ 0.466e-17■■■■■ 149.9
GNL3Q9BVP2 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.286e-17■■■■■ 149.9
GNL3Q9BVP2 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.086e-17■■■■■ 149.9
GNL3Q9BVP2 PRKN-206ENST00000366898 4180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.376e-17■■■■■ 149.9
GNL3Q9BVP2 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.022e-15■■■■■ 147.3
GNL3Q9BVP2 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.022e-32■■■■■ 144.3
GNL3Q9BVP2 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.85e-16■■■■■ 141.6
GNL3Q9BVP2 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.145e-16■■■■■ 141.6
GNL3Q9BVP2 EGR2-206ENST00000639815 1075 ntTSL 515.47■□□□□ 0.075e-16■■■■■ 141.6
GNL3Q9BVP2 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.075e-16■■■■■ 141.6
GNL3Q9BVP2 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC8.31□□□□□ -1.082e-22■■■■■ 133.1
GNL3Q9BVP2 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC4.7□□□□□ -1.669e-22■■■■■ 129.1
GNL3Q9BVP2 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.973e-9■■■■■ 111.9
GNL3Q9BVP2 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.733e-9■■■■■ 111.9
GNL3Q9BVP2 GUCY1A2-203ENST00000526355 16205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.613e-9■■■■■ 111.9
GNL3Q9BVP2 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.364e-11■■■■■ 90.6
GNL3Q9BVP2 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.224e-11■■■■■ 90.6
GNL3Q9BVP2 AC004801.4-201ENST00000546738 3112 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.271e-9■■■■■ 77
GNL3Q9BVP2 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.482e-8■■■■■ 75
GNL3Q9BVP2 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.322e-8■■■■■ 75
GNL3Q9BVP2 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.082e-8■■■■■ 75
GNL3Q9BVP2 AC112484.1-203ENST00000511204 532 ntAPPRIS ALT2 TSL 413.57□□□□□ -0.242e-8■■■■■ 75
GNL3Q9BVP2 COQ8A-208ENST00000485677 449 ntTSL 28.75□□□□□ -1.012e-8■■■■■ 75
GNL3Q9BVP2 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC8.42□□□□□ -1.061e-323■■■■■ 61.5
GNL3Q9BVP2 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC7.84□□□□□ -1.151e-323■■■■■ 59.4
GNL3Q9BVP2 WDR82-203ENST00000469000 587 ntTSL 519.63■□□□□ 0.733e-12■■■■■ 58.3
GNL3Q9BVP2 WDR82-202ENST00000463624 574 ntTSL 416.27■□□□□ 0.23e-12■■■■■ 58.3
GNL3Q9BVP2 WDR82-201ENST00000296490 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.273e-12■■■■■ 58.3
GNL3Q9BVP2 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.5□□□□□ -2.013e-12■■■■■ 58.3
GNL3Q9BVP2 GREB1-210ENST00000628795 438 ntTSL 55.41□□□□□ -1.549e-9■■■■■ 52.4
GNL3Q9BVP2 ANAPC2-208ENST00000618649 1565 ntTSL 223.35■■□□□ 1.331e-5■■■■■ 50
GNL3Q9BVP2 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.81e-5■■■■■ 50
GNL3Q9BVP2 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.541e-5■■■■■ 50
GNL3Q9BVP2 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.491e-5■■■■■ 50
GNL3Q9BVP2 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.31e-5■■■■■ 50
GNL3Q9BVP2 NEU3-204ENST00000531509 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.121e-5■■■■■ 50
GNL3Q9BVP2 PNP-201ENST00000361505 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.081e-5■■■■■ 50
GNL3Q9BVP2 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.121e-5■■■■■ 50
GNL3Q9BVP2 SULF1-202ENST00000402687 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.21e-5■■■■■ 50
GNL3Q9BVP2 PNP-204ENST00000554056 1635 ntTSL 513.06□□□□□ -0.321e-5■■■■■ 50
GNL3Q9BVP2 SULF1-223ENST00000616868 3381 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.341e-5■■■■■ 50
GNL3Q9BVP2 PNP-207ENST00000556754 2573 ntTSL 211.88□□□□□ -0.511e-5■■■■■ 50
GNL3Q9BVP2 SULF1-203ENST00000419716 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.621e-5■■■■■ 50
GNL3Q9BVP2 SULF1-205ENST00000521946 3004 ntTSL 1 (best)9.64□□□□□ -0.871e-5■■■■■ 50
GNL3Q9BVP2 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.251e-5■■■■■ 50
GNL3Q9BVP2 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.521e-5■■■■■ 50
GNL3Q9BVP2 C10orf90-208ENST00000488181 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 214.4□□□□□ -0.12e-16■■■■■ 47.9
GNL3Q9BVP2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.522e-7■■■■■ 44.4
GNL3Q9BVP2 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.242e-7■■■■■ 44.4
GNL3Q9BVP2 RSPO3-202ENST00000368317 1290 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -12e-7■■■■■ 44.4
GNL3Q9BVP2 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC6.96□□□□□ -1.35e-14■■■■■ 41.8
GNL3Q9BVP2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.811e-8■■■■■ 41.7
GNL3Q9BVP2 PCBD2-202ENST00000504352 961 ntTSL 511.31□□□□□ -0.61e-8■■■■■ 41.7
GNL3Q9BVP2 PCBD2-204ENST00000512783 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.971e-8■■■■■ 41.7
GNL3Q9BVP2 PCBD2-203ENST00000510013 361 ntTSL 56.4□□□□□ -1.381e-8■■■■■ 41.7
GNL3Q9BVP2 SLC26A5-215ENST00000487407 2098 ntTSL 228.01■■■□□ 2.072e-11■■■■■ 40.5
GNL3Q9BVP2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.632e-11■■■■■ 40.5
GNL3Q9BVP2 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.622e-11■■■■■ 40.5
GNL3Q9BVP2 SLC26A5-203ENST00000354356 2686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.022e-11■■■■■ 40.5
GNL3Q9BVP2 SLC26A5-201ENST00000306312 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.012e-11■■■■■ 40.5
GNL3Q9BVP2 SLC26A5-211ENST00000432958 2588 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.112e-11■■■■■ 40.5
GNL3Q9BVP2 SLC26A5-204ENST00000356767 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.152e-11■■■■■ 40.5
GNL3Q9BVP2 SLC26A5-212ENST00000445809 2324 ntTSL 29.97□□□□□ -0.812e-11■■■■■ 40.5
GNL3Q9BVP2 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.922e-11■■■■■ 40.5
GNL3Q9BVP2 SLC26A5-213ENST00000454864 2242 ntTSL 29.28□□□□□ -0.922e-11■■■■■ 40.5
GNL3Q9BVP2 SLC26A5-206ENST00000393727 2270 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.032e-11■■■■■ 40.5
GNL3Q9BVP2 SLC26A5-210ENST00000423416 2374 ntTSL 28.44□□□□□ -1.062e-11■■■■■ 40.5
GNL3Q9BVP2 SLC26A5-205ENST00000393723 2174 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.182e-11■■■■■ 40.5
GNL3Q9BVP2 SLC26A5-214ENST00000456463 2370 ntTSL 57.44□□□□□ -1.222e-11■■■■■ 40.5
GNL3Q9BVP2 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.372e-11■■■■■ 40.5
GNL3Q9BVP2 SOS2-205ENST00000556452 398 ntTSL 325.57■■□□□ 1.689e-7■■■■■ 40.3
GNL3Q9BVP2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.399e-7■■■■■ 40.3
GNL3Q9BVP2 SOS2-203ENST00000555666 679 ntTSL 410.88□□□□□ -0.679e-7■■■■■ 40.3
GNL3Q9BVP2 SOS2-206ENST00000556469 633 ntTSL 310.45□□□□□ -0.749e-7■■■■■ 40.3
GNL3Q9BVP2 SOS2-202ENST00000543680 3960 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.049e-7■■■■■ 40.3
GNL3Q9BVP2 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.812e-14■■■■■ 37.5
GNL3Q9BVP2 FAM238C-202ENST00000639963 1787 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.052e-14■■■■■ 37.5
GNL3Q9BVP2 FAM238C-201ENST00000638416 868 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.262e-14■■■■■ 37.5
GNL3Q9BVP2 FAM238C-203ENST00000640121 3620 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.472e-14■■■■■ 37.5
GNL3Q9BVP2 FAM238C-205ENST00000640641 391 ntBASIC10.6□□□□□ -0.712e-14■■■■■ 37.5
GNL3Q9BVP2 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.866e-8■■■■■ 37.1
GNL3Q9BVP2 MIPEP-202ENST00000433710 494 ntTSL 317.67■□□□□ 0.426e-8■■■■■ 37.1
GNL3Q9BVP2 MIPEP-203ENST00000464194 543 ntTSL 217.67■□□□□ 0.426e-8■■■■■ 37.1
GNL3Q9BVP2 UGP2-212ENST00000480679 505 ntTSL 524.83■■□□□ 1.574e-6■■■■■ 36.3
GNL3Q9BVP2 UGP2-223ENST00000493222 864 ntTSL 324.83■■□□□ 1.574e-6■■■■■ 36.3
GNL3Q9BVP2 UGP2-227ENST00000497510 722 ntTSL 424.06■■□□□ 1.444e-6■■■■■ 36.3
GNL3Q9BVP2 UGP2-219ENST00000487469 1015 ntTSL 522.23■■□□□ 1.154e-6■■■■■ 36.3
GNL3Q9BVP2 UGP2-213ENST00000482668 645 ntTSL 322.15■■□□□ 1.144e-6■■■■■ 36.3
GNL3Q9BVP2 UGP2-215ENST00000483461 495 ntTSL 421.59■■□□□ 1.054e-6■■■■■ 36.3
GNL3Q9BVP2 UGP2-205ENST00000466642 1023 ntTSL 421.3■■□□□ 14e-6■■■■■ 36.3
GNL3Q9BVP2 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.814e-6■■■■■ 36.3
GNL3Q9BVP2 UGP2-217ENST00000484142 553 ntTSL 419.43■□□□□ 0.74e-6■■■■■ 36.3
GNL3Q9BVP2 UGP2-214ENST00000483108 598 ntTSL 419.43■□□□□ 0.74e-6■■■■■ 36.3
GNL3Q9BVP2 UGP2-206ENST00000467400 717 ntTSL 519.07■□□□□ 0.644e-6■■■■■ 36.3
Retrieved 100 of 598 protein–RNA pairs in 21.6 ms