RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484908.1

ATP6AP1-208, Transcript of ATPase H+ transporting accessory protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene ATP6AP1, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1-208ENST00000484908 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
ATP6AP1-208ENST00000484908 TRPV1Q8NER1 839 aa21.46■■□□□ 1.03
ATP6AP1-208ENST00000484908 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP21.46■■□□□ 1.03
ATP6AP1-208ENST00000484908 MKNK2Q9HBH9 465 aa21.46■■□□□ 1.03
ATP6AP1-208ENST00000484908 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa21.46■■□□□ 1.03
ATP6AP1-208ENST00000484908 MINDY4BA8MYZ0 360 aa21.45■■□□□ 1.02
ATP6AP1-208ENST00000484908 ERC2O15083 957 aa21.45■■□□□ 1.02
ATP6AP1-208ENST00000484908 COBLO75128 1261 aa21.45■■□□□ 1.02
ATP6AP1-208ENST00000484908 RASA1P20936 1047 aa21.45■■□□□ 1.02
ATP6AP1-208ENST00000484908 TMEM132BQ14DG7 1078 aa21.45■■□□□ 1.02
ATP6AP1-208ENST00000484908 MYH4Q9Y623 1939 aa21.45■■□□□ 1.02
ATP6AP1-208ENST00000484908 FCER1AP12319 257 aa21.44■■□□□ 1.02
ATP6AP1-208ENST00000484908 SYN1P17600 705 aa21.44■■□□□ 1.02
ATP6AP1-208ENST00000484908 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
ATP6AP1-208ENST00000484908 FBXO28Q9NVF7 368 aa21.44■■□□□ 1.02
ATP6AP1-208ENST00000484908 NYAP2Q9P242 653 aa21.44■■□□□ 1.02
ATP6AP1-208ENST00000484908 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa21.44■■□□□ 1.02
ATP6AP1-208ENST00000484908 M0R2C6 588 aa21.43■■□□□ 1.02
ATP6AP1-208ENST00000484908 RAD21O60216 631 aa21.43■■□□□ 1.02
ATP6AP1-208ENST00000484908 TDO2P48775 406 aa21.43■■□□□ 1.02
ATP6AP1-208ENST00000484908 LRRC26Q2I0M4 334 aa21.43■■□□□ 1.02
ATP6AP1-208ENST00000484908 FAM83BQ5T0W9 1011 aa21.43■■□□□ 1.02
ATP6AP1-208ENST00000484908 RIOX2Q8IUF8 465 aa21.43■■□□□ 1.02
ATP6AP1-208ENST00000484908 STK11IPQ8N1F8 1099 aa21.43■■□□□ 1.02
ATP6AP1-208ENST00000484908 ZNF287Q9HBT7 754 aa21.43■■□□□ 1.02
ATP6AP1-208ENST00000484908 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa21.43■■□□□ 1.02
ATP6AP1-208ENST00000484908 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
ATP6AP1-208ENST00000484908 DNM1LO00429 736 aa21.42■■□□□ 1.02
ATP6AP1-208ENST00000484908 VWA5AO00534 786 aa21.42■■□□□ 1.02
ATP6AP1-208ENST00000484908 APPP05067 770 aa21.42■■□□□ 1.02
ATP6AP1-208ENST00000484908 COPB2P35606 906 aa21.42■■□□□ 1.02
ATP6AP1-208ENST00000484908 PI4K2BQ8TCG2 481 aa21.42■■□□□ 1.02
ATP6AP1-208ENST00000484908 MAML3Q96JK9 1138 aa21.42■■□□□ 1.02
ATP6AP1-208ENST00000484908 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
ATP6AP1-208ENST00000484908 SEPT4O43236 478 aa21.41■■□□□ 1.02
ATP6AP1-208ENST00000484908 STAT3P40763 770 aa21.41■■□□□ 1.02
ATP6AP1-208ENST00000484908 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
ATP6AP1-208ENST00000484908 RRP1P56182 461 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
ATP6AP1-208ENST00000484908 IFNL3Q8IZI9 196 aa21.41■■□□□ 1.02
ATP6AP1-208ENST00000484908 REPS2Q8NFH8 660 aa21.41■■□□□ 1.02
ATP6AP1-208ENST00000484908 MMP19Q99542 508 aa21.41■■□□□ 1.02
ATP6AP1-208ENST00000484908 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
ATP6AP1-208ENST00000484908 SMCHD1A6NHR9 2005 aa21.4■■□□□ 1.02
ATP6AP1-208ENST00000484908 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa21.4■■□□□ 1.02
ATP6AP1-208ENST00000484908 F5H6K3 240 aa21.4■■□□□ 1.02
ATP6AP1-208ENST00000484908 KLRC3Q07444 240 aa21.4■■□□□ 1.02
ATP6AP1-208ENST00000484908 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
ATP6AP1-208ENST00000484908 ARRDC4Q8NCT1 418 aa21.4■■□□□ 1.02
ATP6AP1-208ENST00000484908 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
ATP6AP1-208ENST00000484908 SLF1Q9BQI6 1058 aa21.4■■□□□ 1.02
ATP6AP1-208ENST00000484908 FSD1Q9BTV5 496 aa21.4■■□□□ 1.02
ATP6AP1-208ENST00000484908 NACAP1Q9BZK3 213 aa21.4■■□□□ 1.02
ATP6AP1-208ENST00000484908 NDUFB10O96000 172 aa21.39■■□□□ 1.01
ATP6AP1-208ENST00000484908 MX1P20591 662 aa21.39■■□□□ 1.01
ATP6AP1-208ENST00000484908 KCTD2Q14681 263 aa21.39■■□□□ 1.01
ATP6AP1-208ENST00000484908 MKL1Q969V6 931 aa21.39■■□□□ 1.01
ATP6AP1-208ENST00000484908 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
ATP6AP1-208ENST00000484908 CLIP2Q9UDT6 1046 aa21.39■■□□□ 1.01
ATP6AP1-208ENST00000484908 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
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ATP6AP1-208ENST00000484908 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa21.38■■□□□ 1.01
ATP6AP1-208ENST00000484908 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
ATP6AP1-208ENST00000484908 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
ATP6AP1-208ENST00000484908 NRBP1Q9UHY1 535 aa21.38■■□□□ 1.01
ATP6AP1-208ENST00000484908 LAMA3Q16787 3333 aa21.38■■□□□ 1.01
ATP6AP1-208ENST00000484908 KBTBD13C9JR72 458 aa21.37■■□□□ 1.01
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ATP6AP1-208ENST00000484908 ZNF792Q3KQV3 632 aa21.37■■□□□ 1.01
ATP6AP1-208ENST00000484908 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa21.37■■□□□ 1.01
ATP6AP1-208ENST00000484908 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
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ATP6AP1-208ENST00000484908 TEX13BQ9BXU2 312 aa21.37■■□□□ 1.01
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ATP6AP1-208ENST00000484908 NAPBQ9H115 298 aa21.37■■□□□ 1.01
ATP6AP1-208ENST00000484908 MTMR4Q9NYA4 1195 aa21.37■■□□□ 1.01
ATP6AP1-208ENST00000484908 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
ATP6AP1-208ENST00000484908 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa21.37■■□□□ 1.01
ATP6AP1-208ENST00000484908 DNAH12Q6ZR08 3092 aa21.37■■□□□ 1.01
ATP6AP1-208ENST00000484908 PLIN4Q96Q06 1357 aa21.36■■□□□ 1.01
ATP6AP1-208ENST00000484908 SALL3Q9BXA9 1300 aa21.36■■□□□ 1.01
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ATP6AP1-208ENST00000484908 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
ATP6AP1-208ENST00000484908 ANO1Q5XXA6 986 aa21.36■■□□□ 1.01
ATP6AP1-208ENST00000484908 TDHQ8IZJ6 230 aa21.36■■□□□ 1.01
ATP6AP1-208ENST00000484908 NEDD1Q8NHV4 660 aa21.36■■□□□ 1.01
ATP6AP1-208ENST00000484908 CEP95Q96GE4 821 aa21.36■■□□□ 1.01
ATP6AP1-208ENST00000484908 TINF2Q9BSI4 451 aa21.36■■□□□ 1.01
ATP6AP1-208ENST00000484908 TTLL1O95922 423 aa21.35■■□□□ 1.01
ATP6AP1-208ENST00000484908 LRIT3Q3SXY7 679 aa21.35■■□□□ 1.01
ATP6AP1-208ENST00000484908 ATP2A1O14983 1001 aa21.34■■□□□ 1.01
ATP6AP1-208ENST00000484908 ZBED4O75132 1171 aa21.34■■□□□ 1.01
ATP6AP1-208ENST00000484908 TSPY3P0CV98 308 aa21.34■■□□□ 1.01
ATP6AP1-208ENST00000484908 TSPY8P0CW00 308 aa21.34■■□□□ 1.01
ATP6AP1-208ENST00000484908 RTP1P59025 263 aa21.34■■□□□ 1.01
ATP6AP1-208ENST00000484908 PPARAQ07869 468 aa21.34■■□□□ 1.01
ATP6AP1-208ENST00000484908 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
ATP6AP1-208ENST00000484908 GPR153Q6NV75 609 aa21.34■■□□□ 1.01
ATP6AP1-208ENST00000484908 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa21.34■■□□□ 1.01
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