RNA–Protein interactions for RNA: YMR196W

YMR196W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YMR196W, Length 3,267 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR196WYMR196W DSS4P32601 143 aa4.75□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W UTR2P32623 467 aa4.75□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W PPQ1P32945 549 aa4.75□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W AFR1P33304 620 aa4.75□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W HSP78P33416 811 aa4.75□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W WHI3P34761 661 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W PEX32P38292 413 aa4.75□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W PRM9P39551 298 aa4.75□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W STL1P39932 569 aa4.75□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W ORM1P53224 222 aa4.75□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W YGR127WP53275 312 aa4.75□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W TEP1P53916 434 aa4.75□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W RPM2Q02773 1202 aa4.75□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W BUD22Q04347 519 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W AAD4Q07747 329 aa4.75□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W SAM3Q08986 587 aa4.75□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W ERR1P0CX10 437 aa4.75□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W ERR2P0CX11 437 aa4.75□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W MSD1P15179 658 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W RGR1P19263 1082 aa4.75□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W HSP60P19882 572 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W ETR1P38071 380 aa4.75□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W YRO2P38079 344 aa4.75□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W BIT2P38346 545 aa4.75□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W YJR061WP40355 935 aa4.75□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W ATM1P40416 690 aa4.75□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W NEO1P40527 1151 aa4.75□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W ERR3P42222 437 aa4.75□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W YFL052WP43551 465 aa4.75□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W YFL012WP43580 148 aa4.75□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W NUT1P53114 1132 aa4.75□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W KTR5P53966 522 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W VPS9P54787 451 aa4.75□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W RSC58Q07979 502 aa4.75□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W NRT1Q08485 598 aa4.75□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W LEA1Q08963 238 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W REX3Q12090 404 aa4.75□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W ACF2Q12168 779 aa4.75□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W MET16P18408 261 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W GID7P25569 745 aa4.74□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W YIH1P25637 258 aa4.74□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W YAT2P40017 923 aa4.74□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W YJL107CP42947 387 aa4.74□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W SNG1P46950 547 aa4.74□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W MDE1P47095 244 aa4.74□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W YML108WQ03759 105 aa4.74□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W ECM22Q05958 814 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W PHO92Q06390 306 aa4.74□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W TRM8Q12009 286 aa4.74□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W MED4Q12343 284 aa4.74□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W ARP7Q12406 477 aa4.74□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W YEL077CQ3E7X8 1277 aa4.74□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W ATP1P07251 545 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W SSC1P0CS90 654 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W PRP16P15938 1071 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W VPH2P32341 215 aa4.74□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W SSO1P32867 290 aa4.74□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W SRP101P32916 621 aa4.74□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W ALG3P38179 458 aa4.74□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W MBP1P39678 833 aa4.74□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W RRD1P40454 393 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W MNN11P46985 422 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W PCL10P53124 433 aa4.74□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W LSG1P53145 640 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W HOT1Q03213 719 aa4.74□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W YET3Q07451 203 aa4.74□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W EFG1Q3E705 233 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W HIS3P06633 220 aa4.73□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W FUS1P11710 512 aa4.73□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W YAP1P19880 650 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W NIP1P32497 812 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W SSE1P32589 693 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W OAF1P39720 1047 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W PFK26P40433 827 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W PKP1P40530 394 aa4.73□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W COP1P53622 1201 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W UBX4P54730 416 aa4.73□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W YDR131CQ03899 556 aa4.73□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W VAM6Q07468 1049 aa4.73□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W YBL113CQ7M4S9 792 aa4.73□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W KAR9P32526 644 aa4.73□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W EDC3P39998 551 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W FIR1P40020 876 aa4.73□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W BNA6P43619 295 aa4.73□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W YJL049WP47048 450 aa4.73□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W NRD1P53617 575 aaKnown RBP RIP-Chip data4.73□□□□□ -1.65not detected
YMR196WYMR196W BIO4P53630 237 aa4.73□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W IPI3P53877 555 aa4.73□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W GRX8Q05926 109 aa4.73□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W MRI1Q06489 411 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W YMR085WP0CF18 432 aa4.73□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W KES1P35844 434 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W YEL028WP39989 153 aa4.73□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W YFL040WP43562 540 aa4.73□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W RPS10BP46784 105 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W MPS2P53159 387 aa4.73□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W GND2P53319 492 aa4.73□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W MTD1Q02046 320 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W HER2Q03557 464 aa4.73□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W SLD7Q08457 257 aa4.73□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 24.9 ms