RNA–Protein interactions for RNA: YMR066W

SOV1, Transcript of Mitochondrial protein of unknown function, yeast

Gene SOV1, Length 2,697 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SOV1	YMR066W	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	0.24	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	PRE4	P30657	266 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	ZIP1	P31111	875 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	NDC1	P32500	655 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	TIM23	P32897	222 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	AFR1	P33304	620 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	AGP2	P38090	596 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	EHT1	P38295	451 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	DBP8	P38719	431 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	0.24	□□□□□ -2.37	RIP-Chip
SOV1	YMR066W	FPR3	P38911	411 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	0.24	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	TDA10	P42938	290 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	YJR096W	P47137	282 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	YGR237C	P50089	785 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	RAD33	Q04231	177 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	AAD4	Q07747	329 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	ENT4	Q07872	247 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	BAG7	Q12128	409 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	BSC1	Q12140	328 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	0.24	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	EDE1	P34216	1381 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	SWI6	P09959	803 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	ERR1	P0CX10	437 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	ERR2	P0CX11	437 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	YAR066W	P0CX18	203 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	YHR214W	P0CX19	203 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	PET122	P10355	254 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	GLN3	P18494	730 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.24	□□□□□ -2.37	not detected
SOV1	YMR066W	VMA16	P23968	213 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	SNC1	P31109	117 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	IES6	P32617	166 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	CNS1	P33313	385 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	TGL1	P34163	548 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	YKL133C	P36066	463 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	YEL068C	P39977	110 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	RGI2	P40188	164 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	PSF2	P40359	213 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	YIR035C	P40579	254 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	SMK1	P41808	388 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	YPI1	P43587	155 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	TAM41	P53230	385 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	SMA1	Q02651	245 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	MSS11	Q03825	758 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	0.24	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	NTG2	Q08214	380 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	YPQ1	Q12010	308 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	NUR1	Q12066	484 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	YLR108C	Q12259	485 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	0.24	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	YLR302C	O13544	120 aa		0.23	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	YPR096C	O13587	100 aa		0.23	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	NUC1	P08466	329 aa		0.23	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	ASP3-2	P0CX77	362 aa		0.23	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	ASP3-3	P0CX78	362 aa		0.23	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	ASP3-4	P0CX79	362 aa		0.23	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		0.23	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	BAR1	P12630	587 aa		0.23	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	CLN1	P20437	546 aa		0.23	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	GID7	P25569	745 aa		0.23	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	COX13	P32799	129 aa		0.23	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	SHP1	P34223	423 aa		0.23	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	MRPL10	P36520	322 aa		0.23	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	REG2	P38232	338 aa		0.23	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	STB5	P38699	743 aa		0.23	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	YHR218W	P38899	603 aa		0.23	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	TIM17	P39515	158 aa		0.23	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	SHO1	P40073	367 aa		0.23	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	YFR016C	P43597	1233 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	ASK10	P48361	1146 aa		0.23	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	SNF12	P53628	566 aa		0.23	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	TOF1	P53840	1238 aa		0.23	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	ECM9	Q02202	377 aa		0.23	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	AIM32	Q04689	311 aa		0.23	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	SWA2	Q06677	668 aa		0.23	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	YDL242W	Q07746	117 aa		0.23	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	REX4	Q08237	289 aa		0.23	□□□□□ -2.37
SOV1	YMR066W	FRE3	Q08905	711 aa		0.23	□□□□□ -2.37

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