RNA–Protein interactions for RNA: YMR001C-A

YMR001C-A, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YMR001C-A, Length 231 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR001C-AYMR001C-A YDR415CQ04033 374 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
YMR001C-AYMR001C-A MCP2Q06567 569 aa2.88□□□□□ -1.95
YMR001C-AYMR001C-A GUK1P15454 187 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
YMR001C-AYMR001C-A MCM3P24279 971 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
YMR001C-AYMR001C-A ARP2P32381 391 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
YMR001C-AYMR001C-A PAF1P38351 445 aa2.87□□□□□ -1.95
YMR001C-AYMR001C-A ROK1P45818 564 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
YMR001C-AYMR001C-A RSA1Q08932 381 aa2.87□□□□□ -1.95
YMR001C-AYMR001C-A YOL114CQ12322 202 aa2.87□□□□□ -1.95
YMR001C-AYMR001C-A PET111P08468 800 aa2.86□□□□□ -1.95
YMR001C-AYMR001C-A PRP16P15938 1071 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
YMR001C-AYMR001C-A TKL1P23254 680 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
YMR001C-AYMR001C-A MOT3P54785 490 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
YMR001C-AYMR001C-A SWA2Q06677 668 aa2.86□□□□□ -1.95
YMR001C-AYMR001C-A CSR2Q12734 1121 aa2.86□□□□□ -1.95
YMR001C-AYMR001C-A YBR298C-AQ8TGK4 73 aa2.86□□□□□ -1.95
YMR001C-AYMR001C-A EDE1P34216 1381 aa2.86□□□□□ -1.95
YMR001C-AYMR001C-A PRO3P32263 286 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
YMR001C-AYMR001C-A GCD7P32502 381 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
YMR001C-AYMR001C-A RTS2P40962 232 aa2.85□□□□□ -1.95
YMR001C-AYMR001C-A AZF1P41696 914 aa2.85□□□□□ -1.95
YMR001C-AYMR001C-A TGL2P54857 326 aa2.85□□□□□ -1.95
YMR001C-AYMR001C-A ARP10Q04549 284 aa2.85□□□□□ -1.95
YMR001C-AYMR001C-A IWR1Q07532 353 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
YMR001C-AYMR001C-A GLN3P18494 730 aa2.84□□□□□ -1.95
YMR001C-AYMR001C-A SRP54P20424 541 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
YMR001C-AYMR001C-A YIR014WP40570 242 aa2.84□□□□□ -1.95
YMR001C-AYMR001C-A FET5P43561 622 aa2.84□□□□□ -1.95
YMR001C-AYMR001C-A ZAP1P47043 880 aa2.84□□□□□ -1.95
YMR001C-AYMR001C-A YTP1P53584 459 aa2.84□□□□□ -1.95
YMR001C-AYMR001C-A CTL1Q03220 320 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
YMR001C-AYMR001C-A MPD2Q99316 277 aa2.84□□□□□ -1.95
YMR001C-AYMR001C-A LRE1P25579 583 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
YMR001C-AYMR001C-A CPR3P25719 182 aa2.83□□□□□ -1.96
YMR001C-AYMR001C-A MSH1P25846 959 aa2.83□□□□□ -1.96
YMR001C-AYMR001C-A APM3P38153 483 aa2.83□□□□□ -1.96
YMR001C-AYMR001C-A RFC1P38630 861 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
YMR001C-AYMR001C-A YHR218WP38899 603 aa2.83□□□□□ -1.96
YMR001C-AYMR001C-A TEP1P53916 434 aa2.83□□□□□ -1.96
YMR001C-AYMR001C-A MAK10Q02197 733 aa2.83□□□□□ -1.96
YMR001C-AYMR001C-A SMA2Q04658 369 aa2.83□□□□□ -1.96
YMR001C-AYMR001C-A RSF1Q05043 376 aa2.83□□□□□ -1.96
YMR001C-AYMR001C-A ATG23Q06671 453 aa2.83□□□□□ -1.96
YMR001C-AYMR001C-A PGI1P12709 554 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
YMR001C-AYMR001C-A GEX2P36173 615 aa2.82□□□□□ -1.96
YMR001C-AYMR001C-A EXO84P38261 753 aa2.82□□□□□ -1.96
YMR001C-AYMR001C-A SEC31P38968 1273 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
YMR001C-AYMR001C-A IAH1P41734 238 aa2.82□□□□□ -1.96
YMR001C-AYMR001C-A DCP2P53550 970 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
YMR001C-AYMR001C-A FCP1Q03254 732 aa2.82□□□□□ -1.96
YMR001C-AYMR001C-A BIK1P11709 440 aa2.81□□□□□ -1.96
YMR001C-AYMR001C-A MRC1P25588 1096 aa2.81□□□□□ -1.96
YMR001C-AYMR001C-A STV1P37296 890 aa2.81□□□□□ -1.96
YMR001C-AYMR001C-A RPT2P40327 437 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
YMR001C-AYMR001C-A IMA1P53051 589 aa2.81□□□□□ -1.96
YMR001C-AYMR001C-A EIS1Q05050 843 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
YMR001C-AYMR001C-A HIM1Q06674 414 aa2.81□□□□□ -1.96
YMR001C-AYMR001C-A YDL218WQ07629 317 aa2.81□□□□□ -1.96
YMR001C-AYMR001C-A TLG2Q08144 397 aa2.81□□□□□ -1.96
YMR001C-AYMR001C-A SWT1Q12104 458 aa2.81□□□□□ -1.96
YMR001C-AYMR001C-A RAP1P11938 827 aa2.8□□□□□ -1.96
YMR001C-AYMR001C-A RPB8P20436 146 aa2.8□□□□□ -1.96
YMR001C-AYMR001C-A SAC1P32368 623 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
YMR001C-AYMR001C-A LHS1P36016 881 aa2.8□□□□□ -1.96
YMR001C-AYMR001C-A YBR138CP38277 524 aa2.8□□□□□ -1.96
YMR001C-AYMR001C-A SPC72P39723 622 aa2.8□□□□□ -1.96
YMR001C-AYMR001C-A ERR3P42222 437 aa2.8□□□□□ -1.96
YMR001C-AYMR001C-A CRN1Q06440 651 aa2.8□□□□□ -1.96
YMR001C-AYMR001C-A SST2P11972 698 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
YMR001C-AYMR001C-A REV1P12689 985 aa2.79□□□□□ -1.96
YMR001C-AYMR001C-A CLB2P24869 491 aa2.79□□□□□ -1.96
YMR001C-AYMR001C-A YIL060WP40519 144 aa2.79□□□□□ -1.96
YMR001C-AYMR001C-A CTK2P46962 323 aa2.79□□□□□ -1.96
YMR001C-AYMR001C-A CPR6P53691 371 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
YMR001C-AYMR001C-A BRE1Q07457 700 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
YMR001C-AYMR001C-A CYB2P00175 591 aa2.78□□□□□ -1.96
YMR001C-AYMR001C-A PIF1P07271 859 aa2.78□□□□□ -1.96
YMR001C-AYMR001C-A MIS1P09440 975 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
YMR001C-AYMR001C-A MRS3P10566 314 aa2.78□□□□□ -1.96
YMR001C-AYMR001C-A GID7P25569 745 aa2.78□□□□□ -1.96
YMR001C-AYMR001C-A BUD14P27637 709 aa2.78□□□□□ -1.96
YMR001C-AYMR001C-A AVT5P38176 459 aa2.78□□□□□ -1.96
YMR001C-AYMR001C-A FSH1P38777 243 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
YMR001C-AYMR001C-A RTS1P38903 757 aa2.78□□□□□ -1.96
YMR001C-AYMR001C-A MRX1P40050 688 aa2.78□□□□□ -1.96
YMR001C-AYMR001C-A SWP82P43554 623 aa2.78□□□□□ -1.96
YMR001C-AYMR001C-A PPT2Q12036 173 aa2.78□□□□□ -1.96
YMR001C-AYMR001C-A ATP2P00830 511 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
YMR001C-AYMR001C-A SOF1P33750 489 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
YMR001C-AYMR001C-A NTR2P36118 322 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
YMR001C-AYMR001C-A ERG7P38604 731 aa2.77□□□□□ -1.97
YMR001C-AYMR001C-A YJL068CP40363 299 aa2.77□□□□□ -1.97
YMR001C-AYMR001C-A YFR020WP43600 232 aa2.77□□□□□ -1.97
YMR001C-AYMR001C-A NUP100Q02629 959 aa2.77□□□□□ -1.97
YMR001C-AYMR001C-A PSR2Q07949 397 aa2.77□□□□□ -1.97
YMR001C-AYMR001C-A AAP1P37898 856 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
YMR001C-AYMR001C-A ECM10P39987 644 aa2.76□□□□□ -1.97
YMR001C-AYMR001C-A YJR061WP40355 935 aa2.76□□□□□ -1.97
YMR001C-AYMR001C-A YIL161WP40449 235 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
YMR001C-AYMR001C-A PKP2P53170 491 aa2.76□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12 ms