RNA–Protein interactions for RNA: YML038C

YMD8, Transcript of Putative nucleotide sugar transporter, yeast

Gene YMD8, Length 1,329 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMD8	YML038C	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	SDH1	Q00711	640 aa		5.4	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	VPS64	Q03944	604 aa		5.4	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	YPR196W	Q06595	470 aa		5.4	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	ARR1	Q06596	294 aa		5.4	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	5.4	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	YOR352W	Q08816	343 aa		5.4	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	GPM3	Q12326	303 aa		5.4	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	5.39	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	5.39	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	PRD1	P25375	712 aa		5.39	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	SPS22	P25380	463 aa		5.39	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	STE13	P33894	931 aa		5.39	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	SET3	P36124	751 aa		5.39	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	YHL012W	P38709	493 aa		5.39	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	MUP3	P38734	546 aa		5.39	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	YHR054C	P38780	354 aa		5.39	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	GIP4	P39732	760 aa		5.39	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	MRX1	P40050	688 aa		5.39	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	TCB2	P48231	1178 aa		5.39	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	VPS4	P52917	437 aa		5.39	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	LCL3	P53153	274 aa		5.39	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	RRP46	P53256	223 aa	Predicted RBP	5.39	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	5.39	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	TAF3	Q12297	353 aa		5.39	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	5.38	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	BIK1	P11709	440 aa		5.38	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	CLC1	P17891	233 aa		5.38	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	SNF5	P18480	905 aa		5.38	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	YCL002C	P25565	263 aa		5.38	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	PXL1	P36166	706 aa		5.38	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	YBR138C	P38277	524 aa		5.38	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	LYS9	P38999	446 aa		5.38	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	5.38	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	YER158C	P40095	573 aa		5.38	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	YNL144C	P53907	740 aa		5.38	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	5.38	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	SKG3	Q06315	1026 aa		5.38	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	CIR2	Q08822	631 aa		5.38	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	GRX6	Q12438	231 aa		5.38	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	AVL9	Q12500	764 aa		5.38	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		5.38	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	5.37	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	CLN1	P20437	546 aa		5.37	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	CTF13	P35203	478 aa		5.37	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	UBP11	P36026	717 aa		5.37	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	HEL1	P36113	551 aa		5.37	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	ECM4	P36156	370 aa		5.37	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	YBL029W	P38201	376 aa		5.37	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	PSD1	P39006	500 aa		5.37	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	NPP2	P39997	493 aa		5.37	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	YIL089W	P40500	205 aa		5.37	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	SDS3	P40505	327 aa		5.37	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	TNA1	P53322	534 aa		5.37	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	YNL050C	P53952	270 aa		5.37	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	YSA1	Q01976	231 aa		5.37	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	SSY1	Q03770	852 aa		5.37	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	ECM18	Q04623	453 aa		5.37	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	CRR1	Q05790	422 aa		5.37	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	FMP45	Q07651	309 aa		5.37	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	5.37	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	VPS54	Q12071	889 aa		5.37	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	TY3A-G	Q12173	290 aa		5.37	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	TY3A-I	Q99219	290 aa		5.37	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	CBS1	P14066	229 aa		5.36	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.36	□□□□□ -1.55	not detected
YMD8	YML038C	SIR1	P21691	654 aa		5.36	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	CPR2	P23285	205 aa		5.36	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	YCR051W	P25631	222 aa		5.36	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	SRP101	P32916	621 aa		5.36	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	TCD1	P38756	429 aa		5.36	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	SMF1	P38925	575 aa		5.36	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	FLC2	P39719	783 aa		5.36	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55

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