RNA–Protein interactions for RNA: YLL047W

YLL047W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YLL047W, Length 384 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLL047WYLL047W IFA38P38286 347 aa4.8□□□□□ -1.64
YLL047WYLL047W VPS4P52917 437 aa4.8□□□□□ -1.64
YLL047WYLL047W ECM22Q05958 814 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
YLL047WYLL047W CRN1Q06440 651 aa4.8□□□□□ -1.64
YLL047WYLL047W YLR049CQ12110 428 aa4.8□□□□□ -1.64
YLL047WYLL047W VCX1Q99385 411 aa4.8□□□□□ -1.64
YLL047WYLL047W STE50P25344 346 aa4.79□□□□□ -1.64
YLL047WYLL047W CDC15P27636 974 aa4.79□□□□□ -1.64
YLL047WYLL047W SOF1P33750 489 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
YLL047WYLL047W PXL1P36166 706 aa4.79□□□□□ -1.64
YLL047WYLL047W ADE17P38009 592 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
YLL047WYLL047W SCO2P38072 301 aa4.79□□□□□ -1.64
YLL047WYLL047W FLO5P38894 1075 aa4.79□□□□□ -1.64
YLL047WYLL047W UME6P39001 836 aa4.79□□□□□ -1.64
YLL047WYLL047W YIL152WP40455 235 aa4.79□□□□□ -1.64
YLL047WYLL047W CTK2P46962 323 aa4.79□□□□□ -1.64
YLL047WYLL047W VPS25P47142 202 aa4.79□□□□□ -1.64
YLL047WYLL047W BOP3P53958 396 aa4.79□□□□□ -1.64
YLL047WYLL047W NUP53Q03790 475 aa4.79□□□□□ -1.64
YLL047WYLL047W ECI1Q05871 280 aa4.79□□□□□ -1.64
YLL047WYLL047W TMA16Q08687 178 aa4.79□□□□□ -1.64
YLL047WYLL047W PCL6P40038 420 aa4.78□□□□□ -1.64
YLL047WYLL047W YIR016WP40572 265 aa4.78□□□□□ -1.64
YLL047WYLL047W LYS20P48570 428 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
YLL047WYLL047W YGR021WP53212 290 aa4.78□□□□□ -1.64
YLL047WYLL047W RTS3P53289 263 aa4.78□□□□□ -1.64
YLL047WYLL047W YLR281CQ05863 155 aa4.78□□□□□ -1.64
YLL047WYLL047W MLH2Q07980 695 aa4.78□□□□□ -1.64
YLL047WYLL047W GSH2Q08220 491 aa4.78□□□□□ -1.64
YLL047WYLL047W DSE3Q08729 430 aa4.78□□□□□ -1.64
YLL047WYLL047W PFK2P16862 959 aaKnown RBP RIP-Chip data4.77□□□□□ -1.65not detected
YLL047WYLL047W YCR006CP25350 157 aa4.77□□□□□ -1.65
YLL047WYLL047W DPB3P27344 201 aa4.77□□□□□ -1.65
YLL047WYLL047W ECM10P39987 644 aa4.77□□□□□ -1.65
YLL047WYLL047W RIC1P40395 1056 aa4.77□□□□□ -1.65
YLL047WYLL047W SWP82P43554 623 aa4.77□□□□□ -1.65
YLL047WYLL047W IST1P53843 298 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
YLL047WYLL047W GTR1Q00582 310 aa4.77□□□□□ -1.65
YLL047WYLL047W RCO1Q04779 684 aa4.77□□□□□ -1.65
YLL047WYLL047W VID22Q05934 901 aa4.77□□□□□ -1.65
YLL047WYLL047W PCD1Q12524 340 aa4.77□□□□□ -1.65
YLL047WYLL047W UBP13P38187 747 aa4.76□□□□□ -1.65
YLL047WYLL047W GND1P38720 489 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
YLL047WYLL047W KAP123P40069 1113 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
YLL047WYLL047W BNA1P47096 177 aa4.76□□□□□ -1.65
YLL047WYLL047W RSM28Q03430 361 aa4.76□□□□□ -1.65
YLL047WYLL047W POS5Q06892 414 aa4.76□□□□□ -1.65
YLL047WYLL047W SRL1Q08673 210 aa4.76□□□□□ -1.65
YLL047WYLL047W NUS1Q12063 375 aa4.76□□□□□ -1.65
YLL047WYLL047W CLB2P24869 491 aa4.75□□□□□ -1.65
YLL047WYLL047W YUR1P26725 428 aa4.75□□□□□ -1.65
YLL047WYLL047W SAC1P32368 623 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
YLL047WYLL047W CNS1P33313 385 aa4.75□□□□□ -1.65
YLL047WYLL047W PFK26P40433 827 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
YLL047WYLL047W PKP1P40530 394 aa4.75□□□□□ -1.65
YLL047WYLL047W RRT6P53117 311 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
YLL047WYLL047W LSC1P53598 329 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
YLL047WYLL047W ASI1P54074 624 aa4.75□□□□□ -1.65
YLL047WYLL047W ECM16Q04217 1267 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
YLL047WYLL047W FRE3Q08905 711 aa4.75□□□□□ -1.65
YLL047WYLL047W NEW1Q08972 1196 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
YLL047WYLL047W PET111P08468 800 aa4.74□□□□□ -1.65
YLL047WYLL047W RPB2P08518 1224 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
YLL047WYLL047W KRS1P15180 591 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
YLL047WYLL047W CBF2P32504 956 aa4.74□□□□□ -1.65
YLL047WYLL047W FUI1P38196 639 aa4.74□□□□□ -1.65
YLL047WYLL047W FCP1Q03254 732 aa4.74□□□□□ -1.65
YLL047WYLL047W BUD7Q08754 746 aa4.74□□□□□ -1.65
YLL047WYLL047W NBP2Q12163 236 aa4.74□□□□□ -1.65
YLL047WYLL047W SNF1P06782 633 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
YLL047WYLL047W CHO1P08456 276 aa4.73□□□□□ -1.65
YLL047WYLL047W RAP1P11938 827 aa4.73□□□□□ -1.65
YLL047WYLL047W IML2P47031 731 aa4.73□□□□□ -1.65
YLL047WYLL047W SMC3P47037 1230 aa4.73□□□□□ -1.65
YLL047WYLL047W YGL036WP53185 909 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
YLL047WYLL047W REG1Q00816 1014 aa4.73□□□□□ -1.65
YLL047WYLL047W PFA5Q03289 374 aa4.73□□□□□ -1.65
YLL047WYLL047W ARP9Q05123 467 aa4.73□□□□□ -1.65
YLL047WYLL047W PSK2Q08217 1101 aa4.73□□□□□ -1.65
YLL047WYLL047W PUF2Q12221 1075 aaKnown RBP RIP-Chip data4.73□□□□□ -1.65not detected
YLL047WYLL047W YLR302CO13544 120 aa4.72□□□□□ -1.65
YLL047WYLL047W HXK2P04807 486 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
YLL047WYLL047W YFL068WP0CX99 160 aa4.72□□□□□ -1.65
YLL047WYLL047W YLL066W-AP0CY00 160 aa4.72□□□□□ -1.65
YLL047WYLL047W YLL067W-AP0CY01 160 aa4.72□□□□□ -1.65
YLL047WYLL047W ERG8P24521 451 aa4.72□□□□□ -1.65
YLL047WYLL047W SLC1P33333 303 aa4.72□□□□□ -1.65
YLL047WYLL047W MNN2P38069 597 aa4.72□□□□□ -1.65
YLL047WYLL047W RKM3P38222 552 aa4.72□□□□□ -1.65
YLL047WYLL047W ARC40P38328 384 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
YLL047WYLL047W LEU5P38702 357 aa4.72□□□□□ -1.65
YLL047WYLL047W UIP3P39547 235 aa4.72□□□□□ -1.65
YLL047WYLL047W YER010CP40011 234 aa4.72□□□□□ -1.65
YLL047WYLL047W YNL181WP53878 407 aa4.72□□□□□ -1.65
YLL047WYLL047W INA17Q02888 182 aa4.72□□□□□ -1.65
YLL047WYLL047W ARP10Q04549 284 aa4.72□□□□□ -1.65
YLL047WYLL047W MCP2Q06567 569 aa4.72□□□□□ -1.65
YLL047WYLL047W GPN2Q08726 347 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
YLL047WYLL047W TRM8Q12009 286 aa4.72□□□□□ -1.65
YLL047WYLL047W YER145C-AA0A023PYF4 145 aa4.71□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 49.4 ms