RNA–Protein interactions for RNA: YKR080W

MTD1, Transcript of NAD-dependent 5,10-methylenetetrahydrafolate dehydrogenase, yeast

Gene MTD1, Length 963 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MTD1	YKR080W	APD1	P38281	316 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	SAE2	P46946	345 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	RAV1	P47104	1357 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	TRM8	Q12009	286 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	SWT1	Q12104	458 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	TY2A-B	Q12260	438 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	IKI3	Q06706	1349 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	RTC1	Q08281	1341 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	YML003W	P0CF16	290 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	RER1	P25560	188 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	HES1	P35843	434 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	RRN3	P36070	627 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	ATF1	P40353	525 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	DJP1	P40564	432 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	ASE1	P50275	885 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	YNL058C	P53947	316 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	YAT1	P80235	687 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	ENT1	Q12518	454 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	ERG11	P10614	530 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	RIC1	P40395	1056 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	YMR018W	Q04364	514 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	YDR109C	Q04585	715 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	BSP1	Q06604	576 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	RAD34	Q06665	692 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	TMA16	Q08687	178 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	BAG7	Q12128	409 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	NDJ1	Q12366	352 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	YIL177C	P40434	1758 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	YJL225C	P40889	1758 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	ORC2	P32833	620 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	AXL2	P38928	823 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	YER010C	P40011	234 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	ATP23	P53722	227 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	REG1	Q00816	1014 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	ORM2	Q06144	216 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	IRC3	Q06683	689 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	OPY2	Q06810	360 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	YOR389W	Q08912	624 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	YLR302C	O13544	120 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	GEX2	P36173	615 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	FTH1	P38310	465 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	VID27	P40157	782 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	MSY1	P48527	492 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	YPL071C	Q02864	156 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	PTC6	P25646	442 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	SNO4	Q04902	237 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	COQ11	Q05892	277 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	HSP32	Q08992	237 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	YLR111W	Q12528	110 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	NUP1	P20676	1076 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	MCM10	P32354	571 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	GSH1	P32477	678 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	TFC3	P34111	1160 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	MEP3	P53390	489 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	CBK1	P53894	756 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	TPO3	Q06451	622 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	YDL121C	Q07541	149 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	NKP1	Q12493	238 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	VCX1	Q99385	411 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MTD1	YKR080W	APN1	P22936	367 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MTD1	YKR080W	MAK32	P23060	363 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MTD1	YKR080W	MBR1	P23493	339 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MTD1	YKR080W	CBF2	P32504	956 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MTD1	YKR080W	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MTD1	YKR080W	PSD1	P39006	500 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MTD1	YKR080W	PHM8	P40025	321 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MTD1	YKR080W	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MTD1	YKR080W	VPS4	P52917	437 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MTD1	YKR080W	THI7	Q05998	598 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MTD1	YKR080W	SWA2	Q06677	668 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MTD1	YKR080W	NUS1	Q12063	375 aa		4.52	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 49.7 ms