RNA–Protein interactions for RNA: YKR061W

KTR2, Transcript of Mannosyltransferase involved in N-linked protein glycosylation, yeast

Gene KTR2, Length 1,278 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KTR2	YKR061W	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	SNO4	Q04902	237 aa		4.51	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	GTB1	Q04924	702 aa		4.51	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	EST2	Q06163	884 aa		4.51	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	MET7	Q08645	548 aa		4.51	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	HSP32	Q08992	237 aa		4.51	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	RCN2	Q12044	265 aa		4.51	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	TAF3	Q12297	353 aa		4.51	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	PSY3	Q12318	242 aa		4.51	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	CLC1	P17891	233 aa		4.5	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	CLN1	P20437	546 aa		4.5	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	MIH1	P23748	554 aa		4.5	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	PEP3	P27801	918 aa		4.5	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	YJR061W	P40355	935 aa		4.5	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	LCL3	P53153	274 aa		4.5	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	INM2	Q05533	292 aa		4.5	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	RRT8	Q08219	342 aa		4.5	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	MCH5	Q08777	521 aa		4.5	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		4.5	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	CBP1	P07252	654 aa		4.49	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	BET2	P20133	325 aa		4.49	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	CWH43	P25618	953 aa		4.49	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	SEC65	P29478	273 aa		4.49	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.49	□□□□□ -1.69	not detected
KTR2	YKR061W	UBP11	P36026	717 aa		4.49	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	YKL077W	P36081	392 aa		4.49	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	PXL1	P36166	706 aa		4.49	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	FLR1	P38124	548 aa		4.49	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	YBL029W	P38201	376 aa		4.49	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	IFA38	P38286	347 aa		4.49	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	FET5	P43561	622 aa		4.49	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	TCB2	P48231	1178 aa		4.49	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	GIS1	Q03833	894 aa		4.49	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	CRN1	Q06440	651 aa		4.49	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	VPS54	Q12071	889 aa		4.49	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	GNT1	Q12096	491 aa		4.49	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	AHC1	Q12433	566 aa		4.49	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	NCB2	Q92317	146 aa		4.49	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	YOR111W	Q99210	232 aa		4.49	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	SOD2	P00447	233 aa		4.48	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	APE1	P14904	514 aa		4.48	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	CPR2	P23285	205 aa		4.48	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	SPS22	P25380	463 aa		4.48	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	DUR3	P33413	735 aa		4.48	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	SAP190	P36123	1033 aa		4.48	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	ATG14	P38270	344 aa		4.48	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	YSW1	P38280	609 aa		4.48	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	YHR054C	P38780	354 aa		4.48	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	PNT1	P38969	423 aa		4.48	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	PIB2	P53191	635 aa		4.48	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	MRPL22	P53881	309 aa		4.48	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	RRN11	Q04712	507 aa		4.48	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	TFC6	Q06339	672 aa		4.48	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	GPM3	Q12326	303 aa		4.48	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	4.47	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	ADH4	P10127	382 aa		4.47	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	PER1	P25625	357 aa		4.47	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	YCR051W	P25631	222 aa		4.47	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	SRB4	P32569	687 aa		4.47	□□□□□ -1.69
KTR2	YKR061W	SRP101	P32916	621 aa		4.47	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 18.6 ms