RNA–Protein interactions for RNA: YJL177W

RPL17B, Transcript of Ribosomal 60S subunit protein L17B, yeastyeast

Gene RPL17B, Length 555 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPL17BYJL177W MRP2P10663 115 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
RPL17BYJL177W YCR006CP25350 157 aa3.34□□□□□ -1.87
RPL17BYJL177W RPT3P33298 428 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
RPL17BYJL177W CNS1P33313 385 aa3.34□□□□□ -1.87
RPL17BYJL177W TFC3P34111 1160 aa3.34□□□□□ -1.87
RPL17BYJL177W OCT1P35999 772 aa3.34□□□□□ -1.87
RPL17BYJL177W ADE17P38009 592 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
RPL17BYJL177W NAB3P38996 802 aaKnown RBP RIP-Chip data3.34□□□□□ -1.87not detected
RPL17BYJL177W GAT1P43574 510 aa3.34□□□□□ -1.87
RPL17BYJL177W IML2P47031 731 aa3.34□□□□□ -1.87
RPL17BYJL177W VID22Q05934 901 aa3.34□□□□□ -1.87
RPL17BYJL177W MCH4Q08268 501 aa3.34□□□□□ -1.87
RPL17BYJL177W TRM8Q12009 286 aa3.34□□□□□ -1.87
RPL17BYJL177W RRI1Q12468 440 aa3.34□□□□□ -1.87
RPL17BYJL177W YPR089WO13585 888 aa3.33□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W YER190C-BP0CX94 160 aa3.33□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W YEL077W-AP0CX95 160 aa3.33□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W YGR296C-BP0CX96 160 aa3.33□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W YPL283W-BP0CX97 160 aa3.33□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W YPR204C-AP0CX98 160 aa3.33□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W SRP54P20424 541 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W CNA1P23287 553 aa3.33□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W TMT1P32643 299 aa3.33□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W SLC1P33333 303 aa3.33□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W UBP13P38187 747 aa3.33□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W YMR124WP39523 943 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W TPA1P40032 644 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W SEC5P89102 971 aa3.33□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W REG1Q00816 1014 aa3.33□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W ECM16Q04217 1267 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W ECM22Q05958 814 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W RLP24Q07915 199 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W GEP3Q08622 556 aa3.33□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W YLR302CO13544 120 aa3.32□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W ERG8P24521 451 aa3.32□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W SRB5P32585 307 aa3.32□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W LHS1P36016 881 aa3.32□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W AAP1P37898 856 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W SCO2P38072 301 aa3.32□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W TOM71P38825 639 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W SPC97P38863 823 aa3.32□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W MRX1P40050 688 aa3.32□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W KAP123P40069 1113 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W RIC1P40395 1056 aa3.32□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W PFK26P40433 827 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W PCI8P40512 444 aa3.32□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W SNM1P40993 198 aa3.32□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W YNL144CP53907 740 aa3.32□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W VTC3Q02725 835 aa3.32□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W YML131WQ03102 365 aa3.32□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W FCP1Q03254 732 aa3.32□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W PIG1Q06216 648 aa3.32□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W YAP7Q08182 245 aa3.32□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W YLR049CQ12110 428 aa3.32□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W HER1Q12276 1246 aa3.32□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W TOP2P06786 1428 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W RKR1Q04781 1562 aa3.32□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W POL1P13382 1468 aa3.31□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W CHD1P32657 1468 aa3.31□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W YER145C-AA0A023PYF4 145 aa3.31□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W DPB3P27344 201 aa3.31□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W MGM1P32266 881 aa3.31□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W SOF1P33750 489 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W NTR2P36118 322 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W VPS41P38959 992 aa3.31□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W SEC31P38968 1273 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W PSD1P39006 500 aa3.31□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W SWP82P43554 623 aa3.31□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W UBP8P50102 471 aa3.31□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W SCW4P53334 386 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W MRPL1Q04599 285 aa3.31□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W YLR455WQ06188 304 aa3.31□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W BUD21Q08492 214 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W FRE3Q08905 711 aa3.31□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W NUS1Q12063 375 aa3.31□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W ATX2Q12067 313 aa3.31□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W VCX1Q99385 411 aa3.31□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W CDC25P04821 1589 aa3.3□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W STU1P38198 1513 aa3.3□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W PET111P08468 800 aa3.3□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W GPA1P08539 472 aa3.3□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W GUK1P15454 187 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W AIM17P23180 465 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W CDC15P27636 974 aa3.3□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W RPS0AP32905 252 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W ASK1P35734 292 aa3.3□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W RRN3P36070 627 aa3.3□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W AXL2P38928 823 aa3.3□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W YER010CP40011 234 aa3.3□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W YPT11P48559 417 aa3.3□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W VPS4P52917 437 aa3.3□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W EAF7P53911 425 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W RPL15BP54780 204 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W PFA5Q03289 374 aa3.3□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W RSM28Q03430 361 aa3.3□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W YOR019WQ99248 730 aa3.3□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W PAN1P32521 1480 aa3.29□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W MMS22Q06164 1454 aa3.29□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W TRM732Q03496 1420 aa3.29□□□□□ -1.88
RPL17BYJL177W SMC4Q12267 1418 aa3.29□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 33.8 ms