RNA–Protein interactions for RNA: YHR143W-A

RPC10, Transcript of RNA polymerase subunit ABC10-alpha, found in RNA pol I, II, and III, yeastyeast

Gene RPC10, Length 213 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPC10YHR143W-A IST3P40565 148 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A RPN11P43588 306 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A LSC1P53598 329 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A IOC4Q04213 475 aa2.64□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A ECI1Q05871 280 aa2.64□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A TFC6Q06339 672 aa2.64□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A CRN1Q06440 651 aa2.64□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A PSR2Q07949 397 aa2.64□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A MLH2Q07980 695 aa2.64□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A PUF2Q12221 1075 aaKnown RBP RIP-Chip data2.64□□□□□ -1.99not detected
RPC10YHR143W-A ERG27Q12452 347 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A SRP54P20424 541 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A STE50P25344 346 aa2.63□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A YUR1P26725 428 aa2.63□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A CDC15P27636 974 aa2.63□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A SRB5P32585 307 aa2.63□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A TEF4P36008 412 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A UBP13P38187 747 aa2.63□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A IFA38P38286 347 aa2.63□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A SEC31P38968 1273 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A UME6P39001 836 aa2.63□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A PCL6P40038 420 aa2.63□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A CTK2P46962 323 aa2.63□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A PSP1P50896 841 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A SCS3P53012 380 aa2.63□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A YGL036WP53185 909 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A PFA5Q03289 374 aa2.63□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A YLR281CQ05863 155 aa2.63□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A POS5Q06892 414 aa2.63□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A SNA4Q07549 140 aa2.63□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A SRL1Q08673 210 aa2.63□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A TMA16Q08687 178 aa2.63□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A BUD7Q08754 746 aa2.63□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A SSM4P40318 1319 aa2.63□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A PFK2P16862 959 aaKnown RBP RIP-Chip data2.62□□□□□ -1.99not detected
RPC10YHR143W-A PWP2P25635 923 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A VPS24P36095 224 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A MNN2P38069 597 aa2.62□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A PSY4P38193 441 aa2.62□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A ECM10P39987 644 aa2.62□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A IES5P40060 125 aa2.62□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A PFK26P40433 827 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A SWP82P43554 623 aa2.62□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A FCP1Q03254 732 aa2.62□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A ATG16Q03818 150 aa2.62□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A FRE3Q08905 711 aa2.62□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A PCD1Q12524 340 aa2.62□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A VCX1Q99385 411 aa2.62□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A YER145C-AA0A023PYF4 145 aa2.61□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A PET111P08468 800 aa2.61□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A RAP1P11938 827 aa2.61□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A SAC1P32368 623 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A CNS1P33313 385 aa2.61□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A ARC40P38328 384 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A RIC1P40395 1056 aa2.61□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A STB2P46679 850 aa2.61□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A VPS4P52917 437 aa2.61□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A IST1P53843 298 aaPredicted RBP2.61□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A YNL181WP53878 407 aa2.61□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A GTR1Q00582 310 aa2.61□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A REG1Q00816 1014 aa2.61□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A IZH1Q03419 316 aa2.61□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A RSM28Q03430 361 aa2.61□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A TDA9Q04545 1251 aa2.61□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A ARP9Q05123 467 aa2.61□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A YMR034CQ05131 434 aaPredicted RBP2.61□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A UTP21Q06078 939 aaPredicted RBP2.61□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A MCP2Q06567 569 aa2.61□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A YLR302CO13544 120 aa2.6□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A RPL42AP0CX27 106 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A RPL42BP0CX28 106 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A YFL068WP0CX99 160 aa2.6□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A YLL066W-AP0CY00 160 aa2.6□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A YLL067W-AP0CY01 160 aa2.6□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A KRS1P15180 591 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A CLB2P24869 491 aa2.6□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A YCR043CP25361 127 aa2.6□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A RKM3P38222 552 aa2.6□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A IML2P47031 731 aa2.6□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A RRT6P53117 311 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A YGR021WP53212 290 aa2.6□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A ASI1P54074 624 aa2.6□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A BET4Q00618 327 aa2.6□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A RCO1Q04779 684 aa2.6□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A VID22Q05934 901 aa2.6□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A GRS2Q06817 618 aa2.6□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A NUS1Q12063 375 aa2.6□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A YLR112WQ12130 139 aa2.6□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A HXK2P04807 486 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A CHO1P08456 276 aa2.59□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A ERG8P24521 451 aa2.59□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A ESL2P36168 1195 aa2.59□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A MET30P39014 640 aa2.59□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A KAP123P40069 1113 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A VRG4P40107 337 aa2.59□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A YIL169CP40442 995 aa2.59□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A PKP1P40530 394 aa2.59□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A TES1P41903 349 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A MEP2P41948 499 aa2.59□□□□□ -1.99
RPC10YHR143W-A BNA1P47096 177 aa2.59□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 23.4 ms