RNA–Protein interactions for RNA: YHL005C

YHL005C, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YHL005C, Length 393 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YHL005C	YHL005C	SHE9	Q04172	456 aa		3	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	YDR109C	Q04585	715 aa		3	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	RSC2	Q06488	889 aa		3	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	YDL121C	Q07541	149 aa		3	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	LDB18	Q07887	179 aa		3	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	PGC1	Q08959	321 aa		3	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	MCD1	Q12158	566 aa		3	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	NSI1	Q12457	570 aa		3	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	YOL087C	Q99247	1116 aa		3	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		3	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.99	□□□□□ -1.93	not detected
YHL005C	YHL005C	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	ATP12	P22135	325 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	EMC1	P25574	760 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	YCL068C	P25593	260 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	RAD16	P31244	790 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	SRP101	P32916	621 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	CTF13	P35203	478 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	MRPL40	P36534	297 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	YBR225W	P38321	900 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	STB5	P38699	743 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	RIM4	P38741	713 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	MEF2	P39677	819 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	UFE1	P41834	346 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	TDA10	P42938	290 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	BST1	P43571	1029 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	RSM26	P47141	266 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	TEL2	P53038	688 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	PEX8	P53248	589 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	YGR127W	P53275	312 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	YTP1	P53584	459 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	UBX4	P54730	416 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	DOS2	P54858	310 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	PET117	Q02771	107 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	NSE5	Q03718	556 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	NHX1	Q04121	633 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	ARA2	Q04212	335 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	SPC24	Q04477	213 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	CDC123	Q05791	360 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	YLR177W	Q06251	628 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	PUN1	Q06991	263 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	YLR012C	Q07927	99 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	YOL019W	Q08157	551 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	PEX15	Q08215	383 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	YLR053C	Q12026	108 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.99	□□□□□ -1.93	not detected
YHL005C	YHL005C	LCB4	Q12246	624 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	ATG34	Q12292	412 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	RGS2	Q99188	309 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	RIF1	P29539	1916 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	SEM1	O94742	89 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	PRC1	P00729	532 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	NMT1	P14743	455 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	MIH1	P23748	554 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	YSP3	P25036	478 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	GID7	P25569	745 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	ADY2	P25613	283 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	PHA2	P32452	334 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	CYM1	P32898	989 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	TOM20	P35180	183 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	RDH54	P38086	958 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	KTR4	P38131	464 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	APM3	P38153	483 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	MRP21	P38175	177 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	YBR032W	P38223	100 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	FZO1	P38297	855 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	MNN1	P39106	762 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	FRT2	P39734	528 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	MEP1	P40260	492 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	ELO3	P40319	345 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	YJR061W	P40355	935 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	ATM1	P40416	690 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	LEM3	P42838	414 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	YJL107C	P42947	387 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	SNG1	P46950	547 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	GCD14	P46959	383 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	ATG36	P46983	293 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	PET130	P47065	347 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YHL005C	YHL005C	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93

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