RNA–Protein interactions for RNA: YGR209C

TRX2, Transcript of Cytoplasmic thioredoxin isoenzyme, yeast

Gene TRX2, Length 315 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRX2	YGR209C	PSF2	P40359	213 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRX2	YGR209C	MAM33	P40513	266 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRX2	YGR209C	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TRX2	YGR209C	MAF1	P41910	395 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRX2	YGR209C	SUM1	P46676	1062 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRX2	YGR209C	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TRX2	YGR209C	RTT101	P47050	842 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRX2	YGR209C	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TRX2	YGR209C	PEX8	P53248	589 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRX2	YGR209C	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
TRX2	YGR209C	SLM2	P53955	656 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRX2	YGR209C	SIW14	P53965	281 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRX2	YGR209C	INA17	Q02888	182 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRX2	YGR209C	YMR155W	Q03795	547 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRX2	YGR209C	YDR444W	Q04093	687 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRX2	YGR209C	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TRX2	YGR209C	SWC7	Q06707	132 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRX2	YGR209C	SYT1	Q06836	1226 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRX2	YGR209C	ENT4	Q07872	247 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRX2	YGR209C	SLD7	Q08457	257 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRX2	YGR209C	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TRX2	YGR209C	SVS1	Q12254	260 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRX2	YGR209C	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TRX2	YGR209C	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TRX2	YGR209C	UBR2	Q07963	1872 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRX2	YGR209C	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	YAK1	P14680	807 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	NMT1	P14743	455 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	APE1	P14904	514 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	not detected
TRX2	YGR209C	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	SEC15	P22224	910 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	ATP7	P30902	174 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	AEP1	P32493	518 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	MKS1	P34072	584 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	YBR284W	P38150	797 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	MRP21	P38175	177 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	YHR202W	P38887	602 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	SHU2	P38957	223 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	SEO1	P39709	593 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	VAC8	P39968	578 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	HAT2	P39984	401 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	SNG1	P46950	547 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	VPS25	P47142	202 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	YGR035C	P53222	116 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	CDC14	Q00684	551 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	RSC4	Q02206	625 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	RPM2	Q02773	1202 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	SEC10	Q06245	871 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	GGA1	Q06336	557 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	HDA3	Q06623	655 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	APC9	Q12107	265 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	NSL1	Q12143	216 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	not detected
TRX2	YGR209C	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	YOR131C	Q12486	218 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	SRF1	Q12516	437 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	COX5A	P00424	153 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	CIT2	P08679	460 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	CSM1	P25651	190 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	PHO91	P27514	894 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	ZIP1	P31111	875 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	PEP7	P32609	515 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	TOM20	P35180	183 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	RIM4	P38741	713 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	AFG3	P39925	761 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	AAD14	P42884	376 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	SPO74	P45819	413 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	NUP85	P46673	744 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	GCD14	P46959	383 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	BFA1	P47113	574 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	NCS6	P53088	359 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	YGR016W	P53209	190 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	GND2	P53319	492 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	YTP1	P53584	459 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	EFM6	P53970	246 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	PET117	Q02771	107 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	TRS31	Q03337	283 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	NHP10	Q03435	203 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	CSN9	Q03981	162 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	ATG26	Q06321	1198 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	ATG17	Q06410	417 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRX2	YGR209C	LDB18	Q07887	179 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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