RNA–Protein interactions for RNA: YER103W

SSA4, Transcript of Heat shock protein that is highly induced upon stress, yeastyeast

Gene SSA4, Length 1,929 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSA4YER103W TWF1P53250 332 aa12.78□□□□□ -0.36
SSA4YER103W IES4Q08561 116 aa12.78□□□□□ -0.36
SSA4YER103W HIR2P32480 875 aa12.77□□□□□ -0.37
SSA4YER103W PRP19P32523 503 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
SSA4YER103W IST2P38250 946 aa12.77□□□□□ -0.37
SSA4YER103W YHR078WP38799 552 aa12.77□□□□□ -0.37
SSA4YER103W DSS1P39112 969 aa12.77□□□□□ -0.37
SSA4YER103W YNL108CP53929 270 aa12.77□□□□□ -0.37
SSA4YER103W ECM9Q02202 377 aa12.77□□□□□ -0.37
SSA4YER103W DOT1Q04089 582 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
SSA4YER103W ATG29Q12092 213 aa12.77□□□□□ -0.37
SSA4YER103W HSP42Q12329 375 aa12.77□□□□□ -0.37
SSA4YER103W PMA1P05030 918 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
SSA4YER103W CLB3P24870 427 aa12.76□□□□□ -0.37
SSA4YER103W ERG6P25087 383 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
SSA4YER103W KIN82P25341 720 aa12.76□□□□□ -0.37
SSA4YER103W UBC8P28263 218 aa12.76□□□□□ -0.37
SSA4YER103W YJU2P28320 278 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
SSA4YER103W SMY2P32909 740 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
SSA4YER103W JLP2P40206 208 aa12.76□□□□□ -0.37
SSA4YER103W ECL1P48235 211 aa12.76□□□□□ -0.37
SSA4YER103W AIF1P52923 378 aa12.76□□□□□ -0.37
SSA4YER103W CDC123Q05791 360 aa12.76□□□□□ -0.37
SSA4YER103W MCP2Q06567 569 aa12.76□□□□□ -0.37
SSA4YER103W YPR196WQ06595 470 aa12.76□□□□□ -0.37
SSA4YER103W NGL1Q08213 363 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
SSA4YER103W SPE3Q12074 293 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
SSA4YER103W CCA1P21269 546 aa12.76□□□□□ -0.37
SSA4YER103W DMC1P25453 334 aa12.76□□□□□ -0.37
SSA4YER103W RGT1P32862 1170 aa12.76□□□□□ -0.37
SSA4YER103W UTP30P36144 274 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
SSA4YER103W MND2P40577 368 aa12.76□□□□□ -0.37
SSA4YER103W GUS1P46655 708 aaKnown RBP RIP-Chip data12.76□□□□□ -0.37not detected
SSA4YER103W RTT101P47050 842 aa12.76□□□□□ -0.37
SSA4YER103W DIE2P50076 525 aa12.76□□□□□ -0.37
SSA4YER103W CWC23P52868 283 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
SSA4YER103W SLD5Q03406 294 aa12.76□□□□□ -0.37
SSA4YER103W RRG1Q12167 365 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
SSA4YER103W GPM1P00950 247 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
SSA4YER103W TPK1P06244 397 aa12.75□□□□□ -0.37
SSA4YER103W BEM3P32873 1128 aa12.75□□□□□ -0.37
SSA4YER103W ATG14P38270 344 aa12.75□□□□□ -0.37
SSA4YER103W GCV2P49095 1034 aa12.75□□□□□ -0.37
SSA4YER103W DML1Q03652 475 aa12.75□□□□□ -0.37
SSA4YER103W CSN9Q03981 162 aa12.75□□□□□ -0.37
SSA4YER103W YMR111CQ04461 462 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
SSA4YER103W HDA3Q06623 655 aa12.75□□□□□ -0.37
SSA4YER103W YOL159CQ08300 171 aa12.75□□□□□ -0.37
SSA4YER103W PCD1Q12524 340 aa12.75□□□□□ -0.37
SSA4YER103W TOP3P13099 656 aa12.74□□□□□ -0.37
SSA4YER103W CLN2P20438 545 aa12.74□□□□□ -0.37
SSA4YER103W PEX3P28795 441 aa12.74□□□□□ -0.37
SSA4YER103W YHL012WP38709 493 aa12.74□□□□□ -0.37
SSA4YER103W CEM1P39525 442 aa12.74□□□□□ -0.37
SSA4YER103W PRM2P40534 656 aa12.74□□□□□ -0.37
SSA4YER103W MET12P46151 657 aa12.74□□□□□ -0.37
SSA4YER103W YGL036WP53185 909 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
SSA4YER103W VPS9P54787 451 aa12.74□□□□□ -0.37
SSA4YER103W BAG7Q12128 409 aa12.74□□□□□ -0.37
SSA4YER103W DCP1Q12517 231 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
SSA4YER103W MET16P18408 261 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
SSA4YER103W PHO3P24031 467 aa12.74□□□□□ -0.37
SSA4YER103W YCL068CP25593 260 aa12.74□□□□□ -0.37
SSA4YER103W ASK1P35734 292 aa12.74□□□□□ -0.37
SSA4YER103W HXT6P39003 570 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
SSA4YER103W HXT7P39004 570 aa12.74□□□□□ -0.37
SSA4YER103W SWD1P39706 426 aa12.74□□□□□ -0.37
SSA4YER103W SLD3P53135 668 aa12.74□□□□□ -0.37
SSA4YER103W RRP17Q04031 235 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
SSA4YER103W RSC2Q06488 889 aa12.74□□□□□ -0.37
SSA4YER103W TPO1Q07824 586 aa12.74□□□□□ -0.37
SSA4YER103W YLL032CQ07834 825 aaKnown RBP RIP-Chip data12.74□□□□□ -0.37not detected
SSA4YER103W OSW2Q12202 724 aa12.74□□□□□ -0.37
SSA4YER103W IZH4Q99393 312 aa12.74□□□□□ -0.37
SSA4YER103W MEI5P32489 222 aa12.73□□□□□ -0.37
SSA4YER103W TOM20P35180 183 aa12.73□□□□□ -0.37
SSA4YER103W YBL029WP38201 376 aa12.73□□□□□ -0.37
SSA4YER103W SLX1P38324 304 aa12.73□□□□□ -0.37
SSA4YER103W IMA5P40884 581 aa12.73□□□□□ -0.37
SSA4YER103W HAM1P47119 197 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
SSA4YER103W IMA1P53051 589 aa12.73□□□□□ -0.37
SSA4YER103W NOG1Q02892 647 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
SSA4YER103W YDR090CQ03193 310 aa12.73□□□□□ -0.37
SSA4YER103W VPS54Q12071 889 aa12.73□□□□□ -0.37
SSA4YER103W SEN2P16658 377 aa12.72□□□□□ -0.37
SSA4YER103W UTR2P32623 467 aa12.72□□□□□ -0.37
SSA4YER103W SPC34P36131 295 aa12.72□□□□□ -0.37
SSA4YER103W YAT2P40017 923 aa12.72□□□□□ -0.37
SSA4YER103W FET5P43561 622 aa12.72□□□□□ -0.37
SSA4YER103W SCD6P45978 349 aaKnown RBP RIP-Chip data12.72□□□□□ -0.37not detected
SSA4YER103W ASG7P46993 209 aa12.72□□□□□ -0.37
SSA4YER103W YNL146WP53906 100 aa12.72□□□□□ -0.37
SSA4YER103W ENT2Q05785 613 aa12.72□□□□□ -0.37
SSA4YER103W MDM36Q06820 579 aa12.72□□□□□ -0.37
SSA4YER103W VPS5Q92331 675 aa12.72□□□□□ -0.37
SSA4YER103W ERG12P07277 443 aa12.72□□□□□ -0.37
SSA4YER103W KGD1P20967 1014 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
SSA4YER103W ECM13P38195 257 aa12.72□□□□□ -0.37
SSA4YER103W GPB2P39717 880 aa12.72□□□□□ -0.37
SSA4YER103W IML2P47031 731 aa12.72□□□□□ -0.37
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