RNA–Protein interactions for RNA: Q0143

Q0143, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene Q0143, Length 153 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
Q0143	Q0143	YGL081W	P53156	320 aa		0.37	□□□□□ -2.35
Q0143	Q0143	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	0.37	□□□□□ -2.35
Q0143	Q0143	HNT3	Q08702	217 aa		0.37	□□□□□ -2.35
Q0143	Q0143	HFI1	Q12060	488 aa		0.37	□□□□□ -2.35
Q0143	Q0143	TMS1	Q12116	473 aa		0.37	□□□□□ -2.35
Q0143	Q0143	VPS5	Q92331	675 aa		0.37	□□□□□ -2.35
Q0143	Q0143	PRB1	P09232	635 aa		0.36	□□□□□ -2.35
Q0143	Q0143	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35
Q0143	Q0143	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35
Q0143	Q0143	STV1	P37296	890 aa		0.36	□□□□□ -2.35
Q0143	Q0143	RGI2	P40188	164 aa		0.36	□□□□□ -2.35
Q0143	Q0143	YMR027W	Q04371	470 aa		0.36	□□□□□ -2.35
Q0143	Q0143	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35
Q0143	Q0143	PRM7	Q12459	698 aa		0.36	□□□□□ -2.35
Q0143	Q0143	RPB8	P20436	146 aa		0.35	□□□□□ -2.35
Q0143	Q0143	PDE1	P22434	369 aa		0.35	□□□□□ -2.35
Q0143	Q0143	MSH2	P25847	964 aa		0.35	□□□□□ -2.35
Q0143	Q0143	PTR2	P32901	601 aa		0.35	□□□□□ -2.35
Q0143	Q0143	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
Q0143	Q0143	CIA1	Q05583	330 aa		0.35	□□□□□ -2.35
Q0143	Q0143	YLR001C	Q07895	862 aa		0.35	□□□□□ -2.35
Q0143	Q0143	APM4	Q99186	491 aa		0.35	□□□□□ -2.35
Q0143	Q0143	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	0.34	□□□□□ -2.36
Q0143	Q0143	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	0.34	□□□□□ -2.36
Q0143	Q0143	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	0.34	□□□□□ -2.36
Q0143	Q0143	TIM23	P32897	222 aa		0.34	□□□□□ -2.36
Q0143	Q0143	SPC34	P36131	295 aa		0.34	□□□□□ -2.36
Q0143	Q0143	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	0.34	□□□□□ -2.36
Q0143	Q0143	SNG1	P46950	547 aa		0.34	□□□□□ -2.36
Q0143	Q0143	ARK1	P53974	638 aa		0.34	□□□□□ -2.36
Q0143	Q0143	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	0.34	□□□□□ -2.36
Q0143	Q0143	ECM9	Q02202	377 aa		0.34	□□□□□ -2.36
Q0143	Q0143	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	0.34	□□□□□ -2.36
Q0143	Q0143	SAL1	D6W196	494 aa		0.33	□□□□□ -2.36
Q0143	Q0143	CKB2	P38930	258 aa		0.33	□□□□□ -2.36
Q0143	Q0143	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	0.33	□□□□□ -2.36
Q0143	Q0143	RBA50	Q04418	439 aa		0.33	□□□□□ -2.36
Q0143	Q0143	YDL218W	Q07629	317 aa		0.33	□□□□□ -2.36
Q0143	Q0143	FMP45	Q07651	309 aa		0.33	□□□□□ -2.36
Q0143	Q0143	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	0.32	□□□□□ -2.36
Q0143	Q0143	URA3	P03962	267 aa		0.32	□□□□□ -2.36
Q0143	Q0143	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	0.32	□□□□□ -2.36
Q0143	Q0143	RER1	P25560	188 aa		0.32	□□□□□ -2.36
Q0143	Q0143	ACH1	P32316	526 aa		0.32	□□□□□ -2.36
Q0143	Q0143	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	0.32	□□□□□ -2.36
Q0143	Q0143	EMP65	P40085	556 aa		0.32	□□□□□ -2.36
Q0143	Q0143	WSC2	P53832	503 aa		0.32	□□□□□ -2.36
Q0143	Q0143	NUP100	Q02629	959 aa		0.32	□□□□□ -2.36
Q0143	Q0143	YDR109C	Q04585	715 aa		0.32	□□□□□ -2.36
Q0143	Q0143	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		0.32	□□□□□ -2.36
Q0143	Q0143	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	0.31	□□□□□ -2.36
Q0143	Q0143	MNT2	P53059	558 aa		0.31	□□□□□ -2.36
Q0143	Q0143	DIA1	P54005	336 aa		0.31	□□□□□ -2.36
Q0143	Q0143	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	0.31	□□□□□ -2.36
Q0143	Q0143	PFA5	Q03289	374 aa		0.31	□□□□□ -2.36
Q0143	Q0143	AAD4	Q07747	329 aa		0.31	□□□□□ -2.36
Q0143	Q0143	CDC45	Q08032	650 aa		0.31	□□□□□ -2.36
Q0143	Q0143	HOS1	Q12214	470 aa		0.31	□□□□□ -2.36
Q0143	Q0143	MRC1	P25588	1096 aa		0.3	□□□□□ -2.36
Q0143	Q0143	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	0.3	□□□□□ -2.36
Q0143	Q0143	PAH1	P32567	862 aa		0.3	□□□□□ -2.36
Q0143	Q0143	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	0.3	□□□□□ -2.36
Q0143	Q0143	TUL1	P36096	758 aa		0.3	□□□□□ -2.36
Q0143	Q0143	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	0.29	□□□□□ -2.36
Q0143	Q0143	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.29	□□□□□ -2.36	not detected
Q0143	Q0143	PHD1	P36093	366 aa		0.29	□□□□□ -2.36
Q0143	Q0143	CHK1	P38147	527 aa		0.29	□□□□□ -2.36
Q0143	Q0143	PHM8	P40025	321 aa		0.29	□□□□□ -2.36
Q0143	Q0143	MGS1	P40151	587 aa		0.29	□□□□□ -2.36
Q0143	Q0143	YJR096W	P47137	282 aa		0.29	□□□□□ -2.36
Q0143	Q0143	MSS11	Q03825	758 aa		0.29	□□□□□ -2.36
Q0143	Q0143	NSE3	Q05541	303 aa		0.29	□□□□□ -2.36
Q0143	Q0143	ERV2	Q12284	196 aa		0.29	□□□□□ -2.36
Q0143	Q0143	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
Q0143	Q0143	CHS6	P40955	746 aa		0.28	□□□□□ -2.36
Q0143	Q0143	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.27	□□□□□ -2.37	not detected
Q0143	Q0143	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
Q0143	Q0143	YGR079W	P53249	370 aa		0.27	□□□□□ -2.37
Q0143	Q0143	PBA1	Q05778	276 aa		0.27	□□□□□ -2.37
Q0143	Q0143	CHO1	P08456	276 aa		0.26	□□□□□ -2.37
Q0143	Q0143	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
Q0143	Q0143	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
Q0143	Q0143	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
Q0143	Q0143	VFA1	P40080	203 aa		0.26	□□□□□ -2.37
Q0143	Q0143	YTA12	P40341	825 aa		0.26	□□□□□ -2.37
Q0143	Q0143	TRS31	Q03337	283 aa		0.26	□□□□□ -2.37
Q0143	Q0143	VPS64	Q03944	604 aa		0.26	□□□□□ -2.37
Q0143	Q0143	MRPL35	Q06678	367 aa		0.26	□□□□□ -2.37
Q0143	Q0143	YOR378W	Q08902	515 aa		0.26	□□□□□ -2.37
Q0143	Q0143	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.26	□□□□□ -2.37	not detected
Q0143	Q0143	PHO8	P11491	566 aa		0.25	□□□□□ -2.37
Q0143	Q0143	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	0.25	□□□□□ -2.37
Q0143	Q0143	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
Q0143	Q0143	IRC5	P43610	853 aa		0.25	□□□□□ -2.37
Q0143	Q0143	YGL082W	P53155	381 aa		0.25	□□□□□ -2.37
Q0143	Q0143	ENT4	Q07872	247 aa		0.25	□□□□□ -2.37
Q0143	Q0143	YLR125W	Q12138	136 aa		0.25	□□□□□ -2.37
Q0143	Q0143	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
Q0143	Q0143	PCT1	P13259	424 aa		0.24	□□□□□ -2.37
Q0143	Q0143	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 31.6 ms