RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575573.1

GGT6-206, Transcript of gamma-glutamyltransferase 6, humanhuman

TSL 4

Gene GGT6, Length 556 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGT6-206ENST00000575573 SH2D4AQ9H788 454 aa24.6■■□□□ 1.53
GGT6-206ENST00000575573 GJD2Q9UKL4 321 aa24.6■■□□□ 1.53
GGT6-206ENST00000575573 TMX2Q9Y320 296 aa24.6■■□□□ 1.53
GGT6-206ENST00000575573 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa24.6■■□□□ 1.53
GGT6-206ENST00000575573 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
GGT6-206ENST00000575573 PLXNB2O15031 1838 aa24.59■■□□□ 1.53
GGT6-206ENST00000575573 EEF2P13639 858 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
GGT6-206ENST00000575573 CHD1LQ86WJ1 897 aa24.59■■□□□ 1.53
GGT6-206ENST00000575573 NACAP1Q9BZK3 213 aa24.59■■□□□ 1.53
GGT6-206ENST00000575573 RNF208Q9H0X6 261 aa24.59■■□□□ 1.53
GGT6-206ENST00000575573 UNC93B1Q9H1C4 597 aa24.59■■□□□ 1.53
GGT6-206ENST00000575573 VCPKMTQ9H867 229 aa24.59■■□□□ 1.53
GGT6-206ENST00000575573 MKNK2Q9HBH9 465 aa24.59■■□□□ 1.53
GGT6-206ENST00000575573 MAPK4P31152 587 aa24.58■■□□□ 1.53
GGT6-206ENST00000575573 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
GGT6-206ENST00000575573 NUCB1Q02818 461 aa24.58■■□□□ 1.53
GGT6-206ENST00000575573 LBX2Q6XYB7 198 aa24.58■■□□□ 1.53
GGT6-206ENST00000575573 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
GGT6-206ENST00000575573 LPAR1Q92633 364 aa24.58■■□□□ 1.53
GGT6-206ENST00000575573 SHISA4Q96DD7 197 aa24.58■■□□□ 1.53
GGT6-206ENST00000575573 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP24.58■■□□□ 1.53
GGT6-206ENST00000575573 KANSL2Q9H9L4 492 aa24.58■■□□□ 1.53
GGT6-206ENST00000575573 GPR142Q7Z601 462 aa24.57■■□□□ 1.52
GGT6-206ENST00000575573 SOCS4Q8WXH5 440 aa24.57■■□□□ 1.52
GGT6-206ENST00000575573 NAPBQ9H115 298 aa24.57■■□□□ 1.52
GGT6-206ENST00000575573 BTBD7Q9P203 1132 aa24.57■■□□□ 1.52
GGT6-206ENST00000575573 FOXP2O15409 715 aa24.56■■□□□ 1.52
GGT6-206ENST00000575573 PRDM1O75626 825 aa24.56■■□□□ 1.52
GGT6-206ENST00000575573 NUDT12Q9BQG2 462 aa24.56■■□□□ 1.52
GGT6-206ENST00000575573 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
GGT6-206ENST00000575573 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa24.55■■□□□ 1.52
GGT6-206ENST00000575573 CYP2B6P20813 491 aa24.55■■□□□ 1.52
GGT6-206ENST00000575573 CCNA1P78396 465 aa24.55■■□□□ 1.52
GGT6-206ENST00000575573 PLEKHH3Q7Z736 793 aa24.55■■□□□ 1.52
GGT6-206ENST00000575573 FAM227BQ96M60 508 aa24.55■■□□□ 1.52
GGT6-206ENST00000575573 A0A0G2JMZ2 1700 aa24.55■■□□□ 1.52
GGT6-206ENST00000575573 A0A0D9SFI3 127 aa24.54■■□□□ 1.52
GGT6-206ENST00000575573 WDR46O15213 610 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
GGT6-206ENST00000575573 FLOT1O75955 427 aa24.54■■□□□ 1.52
GGT6-206ENST00000575573 HMGCRP04035 888 aa24.54■■□□□ 1.52
GGT6-206ENST00000575573 GJB1P08034 283 aa24.54■■□□□ 1.52
GGT6-206ENST00000575573 PPARAQ07869 468 aa24.54■■□□□ 1.52
GGT6-206ENST00000575573 COG2Q14746 738 aa24.54■■□□□ 1.52
GGT6-206ENST00000575573 WDR78Q5VTH9 848 aa24.54■■□□□ 1.52
GGT6-206ENST00000575573 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa24.54■■□□□ 1.52
GGT6-206ENST00000575573 RLFQ13129 1914 aa24.54■■□□□ 1.52
GGT6-206ENST00000575573 RAD21O60216 631 aa24.53■■□□□ 1.52
GGT6-206ENST00000575573 GJA8P48165 433 aa24.53■■□□□ 1.52
GGT6-206ENST00000575573 TRIM32Q13049 653 aa24.53■■□□□ 1.52
GGT6-206ENST00000575573 VPS53Q5VIR6 699 aa24.53■■□□□ 1.52
GGT6-206ENST00000575573 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
GGT6-206ENST00000575573 NKX2-3Q8TAU0 364 aa24.53■■□□□ 1.52
GGT6-206ENST00000575573 TRIB2Q92519 343 aa24.53■■□□□ 1.52
GGT6-206ENST00000575573 RILPL2Q969X0 211 aa24.53■■□□□ 1.52
GGT6-206ENST00000575573 ZNF287Q9HBT7 754 aa24.53■■□□□ 1.52
GGT6-206ENST00000575573 GOPCQ9HD26 462 aa24.53■■□□□ 1.52
GGT6-206ENST00000575573 HELLSQ9NRZ9 838 aa24.53■■□□□ 1.52
GGT6-206ENST00000575573 MORN1Q5T089 497 aa24.52■■□□□ 1.52
GGT6-206ENST00000575573 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
GGT6-206ENST00000575573 ATG4CQ96DT6 458 aa24.52■■□□□ 1.52
GGT6-206ENST00000575573 HOXC10Q9NYD6 342 aa24.52■■□□□ 1.52
GGT6-206ENST00000575573 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa24.51■■□□□ 1.51
GGT6-206ENST00000575573 DSG3P32926 999 aa24.51■■□□□ 1.51
GGT6-206ENST00000575573 RGS2P41220 211 aa24.51■■□□□ 1.51
GGT6-206ENST00000575573 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
GGT6-206ENST00000575573 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
GGT6-206ENST00000575573 USP6NLQ92738 828 aa24.51■■□□□ 1.51
GGT6-206ENST00000575573 PARP14Q460N5 1801 aa24.51■■□□□ 1.51
GGT6-206ENST00000575573 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
GGT6-206ENST00000575573 PDE4BQ07343 736 aa24.5■■□□□ 1.51
GGT6-206ENST00000575573 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa24.5■■□□□ 1.51
GGT6-206ENST00000575573 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
GGT6-206ENST00000575573 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
GGT6-206ENST00000575573 APBA2Q99767 749 aa24.5■■□□□ 1.51
GGT6-206ENST00000575573 OSBPL3Q9H4L5 887 aa24.5■■□□□ 1.51
GGT6-206ENST00000575573 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
GGT6-206ENST00000575573 NYAP2Q9P242 653 aa24.5■■□□□ 1.51
GGT6-206ENST00000575573 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
GGT6-206ENST00000575573 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
GGT6-206ENST00000575573 CTDSPL2Q05D32 466 aa24.49■■□□□ 1.51
GGT6-206ENST00000575573 FAM47AQ5JRC9 791 aa24.49■■□□□ 1.51
GGT6-206ENST00000575573 FAM83BQ5T0W9 1011 aa24.49■■□□□ 1.51
GGT6-206ENST00000575573 CEP95Q96GE4 821 aa24.49■■□□□ 1.51
GGT6-206ENST00000575573 DEFB118Q96PH6 123 aa24.49■■□□□ 1.51
GGT6-206ENST00000575573 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
GGT6-206ENST00000575573 SPATC1LQ9H0A9 340 aa24.49■■□□□ 1.51
GGT6-206ENST00000575573 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP24.49■■□□□ 1.51
GGT6-206ENST00000575573 FBXO28Q9NVF7 368 aa24.49■■□□□ 1.51
GGT6-206ENST00000575573 PLIN4Q96Q06 1357 aa24.49■■□□□ 1.51
GGT6-206ENST00000575573 TSPY3P0CV98 308 aa24.48■■□□□ 1.51
GGT6-206ENST00000575573 TSPY8P0CW00 308 aa24.48■■□□□ 1.51
GGT6-206ENST00000575573 MAP2K5Q13163 448 aa24.48■■□□□ 1.51
GGT6-206ENST00000575573 PLS1Q14651 629 aa24.48■■□□□ 1.51
GGT6-206ENST00000575573 CCL14Q16627 93 aa24.48■■□□□ 1.51
GGT6-206ENST00000575573 MB21D1Q8N884 522 aa24.48■■□□□ 1.51
GGT6-206ENST00000575573 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
GGT6-206ENST00000575573 CLIP2Q9UDT6 1046 aa24.48■■□□□ 1.51
GGT6-206ENST00000575573 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa24.48■■□□□ 1.51
GGT6-206ENST00000575573 MYH4Q9Y623 1939 aa24.47■■□□□ 1.51
GGT6-206ENST00000575573 SGPL1O95470 568 aa24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.9 ms