RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255304.8

USPL1-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USPL1, Length 3,814 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1-201ENST00000255304 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
USPL1-201ENST00000255304 NUP98P52948 1817 aa8.6□□□□□ -1.03
USPL1-201ENST00000255304 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
USPL1-201ENST00000255304 SORBS3O60504 671 aa8.6□□□□□ -1.03
USPL1-201ENST00000255304 APBA3O96018 575 aa8.6□□□□□ -1.03
USPL1-201ENST00000255304 PPARAQ07869 468 aa8.6□□□□□ -1.03
USPL1-201ENST00000255304 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
USPL1-201ENST00000255304 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
USPL1-201ENST00000255304 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
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USPL1-201ENST00000255304 ZNF287Q9HBT7 754 aa8.6□□□□□ -1.03
USPL1-201ENST00000255304 ZSWIM5Q9P217 1185 aa8.6□□□□□ -1.03
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USPL1-201ENST00000255304 C4BP0C0L5 1744 aa8.6□□□□□ -1.03
USPL1-201ENST00000255304 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
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USPL1-201ENST00000255304 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa8.6□□□□□ -1.03
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USPL1-201ENST00000255304 LAMB4A4D0S4 1761 aa8.6□□□□□ -1.03
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USPL1-201ENST00000255304 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
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USPL1-201ENST00000255304 USP17L8P0C7I0 530 aa8.59□□□□□ -1.03
USPL1-201ENST00000255304 CCDC40Q4G0X9 1142 aa8.59□□□□□ -1.03
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USPL1-201ENST00000255304 POLD4Q9HCU8 107 aa8.59□□□□□ -1.03
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USPL1-201ENST00000255304 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
USPL1-201ENST00000255304 CCDC70Q6NSX1 233 aa8.59□□□□□ -1.03
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USPL1-201ENST00000255304 KCNG1Q9UIX4 513 aa8.59□□□□□ -1.03
USPL1-201ENST00000255304 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa8.59□□□□□ -1.03
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USPL1-201ENST00000255304 H7C1W4 665 aa8.58□□□□□ -1.04
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USPL1-201ENST00000255304 PACS2Q86VP3 889 aa8.58□□□□□ -1.04
USPL1-201ENST00000255304 TBC1D10CQ8IV04 446 aa8.58□□□□□ -1.04
USPL1-201ENST00000255304 CALML4Q96GE6 196 aa8.58□□□□□ -1.04
USPL1-201ENST00000255304 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
USPL1-201ENST00000255304 ADAM21Q9UKJ8 722 aa8.58□□□□□ -1.04
USPL1-201ENST00000255304 CTNND2Q9UQB3 1225 aa8.58□□□□□ -1.04
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USPL1-201ENST00000255304 TMEM266Q2M3C6 531 aa8.57□□□□□ -1.04
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USPL1-201ENST00000255304 SENP2Q9HC62 589 aa8.57□□□□□ -1.04
USPL1-201ENST00000255304 PRM3Q9NNZ6 103 aa8.57□□□□□ -1.04
USPL1-201ENST00000255304 ARFGAP3Q9NP61 516 aa8.57□□□□□ -1.04
USPL1-201ENST00000255304 GUCA1BQ9UMX6 200 aa8.57□□□□□ -1.04
USPL1-201ENST00000255304 USP17L3A6NCW0 530 aa8.57□□□□□ -1.04
USPL1-201ENST00000255304 USP17L4A6NCW7 530 aa8.57□□□□□ -1.04
USPL1-201ENST00000255304 SLC16A2P36021 539 aa8.57□□□□□ -1.04
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