RNA–Protein interactions for RNA: YOR328W

PDR10, Transcript of ATP-binding cassette (ABC) transporter, yeast

Gene PDR10, Length 4,695 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PDR10	YOR328W	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	ARG2	P40360	574 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	YMR102C	Q03177	834 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	VTA1	Q06263	330 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	HDA2	Q06629	674 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	IZH4	Q99393	312 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	SGF29	P25554	259 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	BEM1	P29366	551 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	YHL041W	P38730	149 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	YNL260C	P53846	198 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	CDC14	Q00684	551 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	HCS1	P34243	683 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	YBR225W	P38321	900 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	VPS16	Q03308	798 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	SEG1	Q04279	960 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	CBF1	P17106	351 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	VPS33	P20795	691 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	YBR259W	P38338	688 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	TAH11	P47112	604 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	TEL2	P53038	688 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	SIW14	P53965	281 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	CSN9	Q03981	162 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	MDJ1	P35191	511 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	EXO84	P38261	753 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	FZO1	P38297	855 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	YRB2	P40517	327 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	PRM2	P40534	656 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	YNL108C	P53929	270 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	EAR1	Q03212	550 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	NHP10	Q03435	203 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	NRT1	Q08485	598 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	YLF2	P38746	405 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	MOB1	P40484	314 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	ERP6	P53198	216 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	TAF12	Q03761	539 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	ACL4	Q03771	387 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	SWC7	Q06707	132 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	CCP1	P00431	361 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	DAL81	P21657	970 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	MIH1	P23748	554 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	VAC17	P25591	423 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	URK1	P27515	501 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	MET4	P32389	672 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	NPL6	P32832	435 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	PTC3	P34221	468 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	MSR1	P38714	643 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	EFM1	P38732	585 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	ILM1	P47155	203 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	BIO4	P53630	237 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	SPP1	Q03012	353 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	MED4	Q12343	284 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	YMR085W	P0CF18	432 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	HMT1	P38074	348 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	MEF2	P39677	819 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	YGR035C	P53222	116 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
PDR10	YOR328W	OSH6	Q02201	448 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	YET3	Q07451	203 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	APM4	Q99186	491 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	HMG2	P12684	1045 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	RTT101	P47050	842 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	YJR039W	P47107	1121 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	FAR8	Q05040	523 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	SFH1	Q06168	426 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	RDH54	P38086	958 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	STN1	P38960	494 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	SPC105	P53148	917 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	VAC7	P53950	1165 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	MSH2	P25847	964 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	UTR2	P32623	467 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	DOM34	P33309	386 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	HSE1	P38753	452 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	SMX2	P40204	77 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	CHS6	P40955	746 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62

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