RNA–Protein interactions for RNA: YOR299W

BUD7, Transcript of Member of the ChAPs family (Chs5p-Arf1p-binding proteins), yeast

Gene BUD7, Length 2,241 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BUD7	YOR299W	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	VPS54	Q12071	889 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	PET123	P17558	318 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	URK1	P27515	501 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	BEM3	P32873	1128 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	SIT1	P39980	628 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	NDC80	P40460	691 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	QRI7	P43122	407 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	MEP3	P53390	489 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	SLG1	P54867	378 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	CIA1	Q05583	330 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	NBP2	Q12163	236 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	SLP1	Q12232	587 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	AI1	P03875	834 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	PMS1	P14242	873 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	DSS4	P32601	143 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	SWC5	P38326	303 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	BIT2	P38346	545 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	LYS9	P38999	446 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	FHL1	P39521	936 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	YEL075C	P39972	122 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	ASG1	P40467	964 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.95	□□□□□ -1.62	not detected
BUD7	YOR299W	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	INP52	P50942	1183 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	PRM6	Q04705	352 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	IVY1	Q04934	453 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	TAF9	Q05027	157 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	HRT3	Q12347	344 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	RMP1	Q12530	201 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	YLR462W	O13556	202 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	SRB2	P34162	210 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	SEG2	P34250	1132 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	GCS1	P35197	352 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	NUP120	P35729	1037 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	RRT2	P38332	387 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	YHL049C	P38722	271 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	TMN3	P40071	706 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	YER189W	P40104	122 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	YFL064C	P43540	174 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	CAF16	P43569	289 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	CNN1	P43618	361 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	GUF1	P46943	645 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	IML2	P47031	731 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	YNR014W	P53719	212 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	SPC19	Q03954	165 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	AIM32	Q04689	311 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	YBL111C	Q3E7Y5	667 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	MAS1	P10507	462 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	GYP6	P32806	458 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	MMS21	P38632	267 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	MPH1	P40562	993 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	PEX31	P53203	462 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	VPS60	Q03390	229 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	PIG1	Q06216	648 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	YLR352W	Q06479	807 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	HMG2	P12684	1045 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	BYE1	P36106	594 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	YKR051W	P36142	418 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	SHU2	P38957	223 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	SAK1	P38990	1142 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	CEP3	P40969	608 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	LEM3	P42838	414 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	BUD9	P53226	547 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	HOL1	P53389	586 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	RPL22B	P56628	122 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	GTR1	Q00582	310 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	SPS1	P08458	490 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	MCM7	P38132	845 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	YBR053C	P38235	358 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	PCA1	P38360	1216 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	APE4	P38821	490 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	YIR016W	P40572	265 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	PRY1	P47032	299 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	MRX6	P48564	524 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62

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