RNA–Protein interactions for RNA: YOR288C

MPD1, Transcript of Member of the protein disulfide isomerase (PDI) family, yeast

Gene MPD1, Length 957 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MPD1	YOR288C	AAD10	P47182	288 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	WAR1	Q03631	944 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	RAD33	Q04231	177 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	FOB1	O13329	566 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	YCK1	P23291	538 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	MRPL9	P31334	269 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	EMP70	P32802	667 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	NPR2	P39923	615 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	SLZ1	P40167	298 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	DJP1	P40564	432 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	IME4	P41833	600 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	MSY1	P48527	492 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	COG2	P53271	262 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	MUB1	Q03162	620 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	TMN2	Q04562	672 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	MFB1	Q04922	465 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	HRD3	Q05787	833 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	CIR2	Q08822	631 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	HUA2	Q12134	243 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	TFC3	P34111	1160 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	MTH1	P35198	433 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	MUP3	P38734	546 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	JHD1	P40034	492 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	UBX6	P47049	396 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	NGL3	Q03210	505 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	PLM2	Q04383	521 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	YDR109C	Q04585	715 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	TAH18	Q12181	623 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	KAR3	P17119	729 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	CDC43	P18898	376 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	PMA2	P19657	947 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	DMC1	P25453	334 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	LAC1	P28496	418 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	SWP82	P43554	623 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	IRC6	P43615	237 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	DSD1	P53095	428 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	MRPL19	P53875	158 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	ARG7	Q04728	441 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	CRN1	Q06440	651 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	BAG7	Q12128	409 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	PCT1	P13259	424 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	PRE8	P23639	250 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	YBL029W	P38201	376 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	RTS1	P38903	757 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	MRX6	P48564	524 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	FCP1	Q03254	732 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	GIS1	Q03833	894 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	SWA2	Q06677	668 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	YPL191C	Q08930	360 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	YBR085C-A	O43137	85 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	VPS75	P53853	264 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	YAT1	P80235	687 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	TAF11	Q04226	346 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	ARP9	Q05123	467 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	SKG3	Q06315	1026 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	NMD4	Q12129	218 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MPD1	YOR288C	RTC1	Q08281	1341 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MPD1	YOR288C	GCN4	P03069	281 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MPD1	YOR288C	ARG3	P05150	338 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MPD1	YOR288C	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MPD1	YOR288C	YMC1	P32331	307 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MPD1	YOR288C	NFU1	P32860	256 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MPD1	YOR288C	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MPD1	YOR288C	MAL33	P38157	468 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MPD1	YOR288C	FLC2	P39719	783 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MPD1	YOR288C	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MPD1	YOR288C	TDA10	P42938	290 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MPD1	YOR288C	RMD8	P43620	662 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MPD1	YOR288C	STU2	P46675	888 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MPD1	YOR288C	SGM1	P47166	707 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MPD1	YOR288C	CYK3	Q07533	885 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MPD1	YOR288C	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.83	□□□□□ -1.64	not detected
MPD1	YOR288C	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MPD1	YOR288C	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64

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