RNA–Protein interactions for RNA: YOL003C

PFA4, Transcript of Palmitoyltransferase with autoacylation activity, yeast

Gene PFA4, Length 1,137 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PFA4	YOL003C	MTF2	P10849	440 aa		5.27	□□□□□ -1.57
PFA4	YOL003C	SIP1	P32578	815 aa		5.27	□□□□□ -1.57
PFA4	YOL003C	YGR079W	P53249	370 aa		5.27	□□□□□ -1.57
PFA4	YOL003C	ATG16	Q03818	150 aa		5.27	□□□□□ -1.57
PFA4	YOL003C	BLS1	Q06071	122 aa		5.27	□□□□□ -1.57
PFA4	YOL003C	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
PFA4	YOL003C	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
PFA4	YOL003C	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
PFA4	YOL003C	BEM3	P32873	1128 aa		5.26	□□□□□ -1.57
PFA4	YOL003C	HES1	P35843	434 aa		5.26	□□□□□ -1.57
PFA4	YOL003C	FTH1	P38310	465 aa		5.26	□□□□□ -1.57
PFA4	YOL003C	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	5.26	□□□□□ -1.57
PFA4	YOL003C	ERR3	P42222	437 aa		5.26	□□□□□ -1.57
PFA4	YOL003C	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
PFA4	YOL003C	AAT1	Q01802	451 aa		5.26	□□□□□ -1.57
PFA4	YOL003C	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	5.26	□□□□□ -1.57
PFA4	YOL003C	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
PFA4	YOL003C	TFC6	Q06339	672 aa		5.26	□□□□□ -1.57
PFA4	YOL003C	VAM6	Q07468	1049 aa		5.26	□□□□□ -1.57
PFA4	YOL003C	NUP170	P38181	1502 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PFA4	YOL003C	MDM10	P18409	493 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PFA4	YOL003C	GEX2	P36173	615 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PFA4	YOL003C	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
PFA4	YOL003C	SAP185	P40856	1058 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PFA4	YOL003C	SKP2	P42843	763 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PFA4	YOL003C	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
PFA4	YOL003C	MRPL13	Q02204	264 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PFA4	YOL003C	ATG23	Q06671	453 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PFA4	YOL003C	PSR2	Q07949	397 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PFA4	YOL003C	SNT2	P53127	1403 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PFA4	YOL003C	COX1	P00401	534 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PFA4	YOL003C	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
PFA4	YOL003C	LAC1	P28496	418 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PFA4	YOL003C	GSH1	P32477	678 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PFA4	YOL003C	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
PFA4	YOL003C	UBP7	P40453	1071 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PFA4	YOL003C	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
PFA4	YOL003C	CIN1	P40987	1014 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PFA4	YOL003C	ZAP1	P47043	880 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PFA4	YOL003C	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
PFA4	YOL003C	RSC9	Q03124	581 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PFA4	YOL003C	TPO3	Q06451	622 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PFA4	YOL003C	YML003W	P0CF16	290 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PFA4	YOL003C	XRS2	P33301	854 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PFA4	YOL003C	FUI1	P38196	639 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PFA4	YOL003C	EXO84	P38261	753 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PFA4	YOL003C	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
PFA4	YOL003C	PHM8	P40025	321 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PFA4	YOL003C	PSF2	P40359	213 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PFA4	YOL003C	SNO3	P43544	222 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PFA4	YOL003C	MSY1	P48527	492 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PFA4	YOL003C	YGR021W	P53212	290 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PFA4	YOL003C	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
PFA4	YOL003C	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
PFA4	YOL003C	YPL071C	Q02864	156 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PFA4	YOL003C	BAG7	Q12128	409 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PFA4	YOL003C	TY3B-G	Q99315	1547 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PFA4	YOL003C	RPA190	P10964	1664 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
PFA4	YOL003C	NTE1	Q04958	1679 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PFA4	YOL003C	DNF1	P32660	1571 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PFA4	YOL003C	NUC1	P08466	329 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PFA4	YOL003C	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
PFA4	YOL003C	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
PFA4	YOL003C	PTC6	P25646	442 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PFA4	YOL003C	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
PFA4	YOL003C	MRPL36	P36531	177 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PFA4	YOL003C	ERV46	P39727	415 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PFA4	YOL003C	XBP1	P40489	647 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PFA4	YOL003C	DJP1	P40564	432 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PFA4	YOL003C	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
PFA4	YOL003C	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
PFA4	YOL003C	IFA38	P38286	347 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PFA4	YOL003C	STP3	Q05937	343 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PFA4	YOL003C	RPO21	P04050	1733 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
PFA4	YOL003C	SMK1	P41808	388 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PFA4	YOL003C	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
PFA4	YOL003C	IRC7	P43623	340 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PFA4	YOL003C	UBX6	P47049	396 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PFA4	YOL003C	CTF18	P49956	741 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PFA4	YOL003C	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
PFA4	YOL003C	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
PFA4	YOL003C	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
PFA4	YOL003C	YOR389W	Q08912	624 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PFA4	YOL003C	YBT1	P32386	1661 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PFA4	YOL003C	VPS15	P22219	1454 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PFA4	YOL003C	GEA2	P39993	1459 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
PFA4	YOL003C	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
PFA4	YOL003C	PCT1	P13259	424 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PFA4	YOL003C	SPO16	P17122	198 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PFA4	YOL003C	YSP3	P25036	478 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PFA4	YOL003C	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
PFA4	YOL003C	NUP120	P35729	1037 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PFA4	YOL003C	BNA1	P47096	177 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PFA4	YOL003C	YDR109C	Q04585	715 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PFA4	YOL003C	SWT1	Q12104	458 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PFA4	YOL003C	COX17	Q12287	69 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PFA4	YOL003C	PCD1	Q12524	340 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PFA4	YOL003C	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
PFA4	YOL003C	PTP1	P25044	335 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PFA4	YOL003C	PSY4	P38193	441 aa		5.18	□□□□□ -1.58

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