RNA–Protein interactions for RNA: YNL014W

HEF3, Transcript of Translational elongation factor EF-3, yeast

Gene HEF3, Length 3,135 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HEF3	YNL014W	TRS85	P46944	698 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	YJL181W	P46987	611 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	NET1	P47035	1189 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	GUP1	P53154	560 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	MPS1	P54199	764 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	YML131W	Q03102	365 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	YDR514C	Q04408	483 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	GIM5	Q04493	163 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	UFO1	Q04511	668 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	PSR2	Q07949	397 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	BDS1	Q08347	646 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	YDR056C	Q12025	205 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	GET4	Q12125	312 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	GIT1	P25346	518 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	MCM10	P32354	571 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	CTF13	P35203	478 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	EDS1	P38073	919 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	PAC11	P40960	533 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	RPN14	P53196	417 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	COS6	P53344	381 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	YMD8	Q03697	442 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	RAD30	Q04049	632 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	SWF1	Q04629	336 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	FMP42	Q04991	504 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	HRQ1	Q05549	1077 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	YLR345W	Q06137	509 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	MHR1	Q06630	226 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	YLR001C	Q07895	862 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	ESA1	Q08649	445 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	YLR125W	Q12138	136 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	ATG34	Q12292	412 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	POM152	P39685	1337 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	RPO41	P13433	1351 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	YRF1-3	P0CX14	1859 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	YRF1-7	P0CX15	1859 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	YRF1-6	P53819	1859 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	CIT1	P00890	479 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	PDC1	P06169	563 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	RIT1	P23796	513 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	CLB2	P24869	491 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	DBF20	P32328	564 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	MDJ1	P35191	511 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	PTC4	P38089	393 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	NEM1	P38757	446 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	RFX1	P48743	811 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	TUB4	P53378	473 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	TBF1	Q02457	562 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	NHP10	Q03435	203 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	NHX1	Q04121	633 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	VPS38	Q05919	439 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	YLR455W	Q06188	304 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	THI3	Q07471	609 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	YOL019W	Q08157	551 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	YAP7	Q08182	245 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	NUR1	Q12066	484 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	NCA2	Q12374	616 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	ADR1	P07248	1323 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	GAL4	P04386	881 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	MRP7	P12687	371 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	SNA3	P14359	133 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	CDC23	P16522	626 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	AFT1	P22149	690 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	SCJ1	P25303	377 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	FUN30	P31380	1131 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	CSE4	P36012	229 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	SUL1	P38359	859 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	ICE2	P40499	491 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	LOH1	P47055	219 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	ROM1	P53046	1155 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	PIB2	P53191	635 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	SNF12	P53628	566 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	CAF120	P53836	1060 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	IRC4	Q03036	179 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	BNA7	Q04066	261 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	RRT8	Q08219	342 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	AIM41	Q12032	185 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	BAG7	Q12128	409 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HEF3	YNL014W	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 21.3 ms