RNA–Protein interactions for RNA: YMR228W

MTF1, Transcript of Mitochondrial RNA polymerase specificity factor, yeast

Gene MTF1, Length 1,026 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MTF1	YMR228W	NUP60	P39705	539 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	FLC2	P39719	783 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	LRO1	P40345	661 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	AMA1	P50082	593 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	MEH1	Q02205	184 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	YAP6	Q03935	383 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	ENT4	Q07872	247 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	MET17	P06106	444 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	PRP28	P23394	588 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	ROX1	P25042	368 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	PEP3	P27801	918 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	NTH1	P32356	751 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	THI80	P35202	319 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	TDP1	P38319	544 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	LYS9	P38999	446 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	YIR042C	P40586	236 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	FKH2	P41813	862 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	MRX6	P48564	524 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	MRPS35	P53292	345 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	YMR155W	Q03795	547 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	RAD30	Q04049	632 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	HOF1	Q05080	669 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	DUS4	Q06063	367 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	SLM3	Q12093	417 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	NMD4	Q12129	218 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	RTN2	Q12443	393 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	RSF2	P46974	1380 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.74	□□□□□ -1.49	not detected
MTF1	YMR228W	KAR4	P25583	335 aa		5.74	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	YCR015C	P25616	317 aa		5.74	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	BCS1	P32839	456 aa		5.74	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	FMO1	P38866	432 aa		5.74	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	TMN3	P40071	706 aa		5.74	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	FMP10	P40098	244 aa		5.74	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	SPO22	P40511	975 aa		5.74	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	BAP3	P41815	604 aa		5.74	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	AAD10	P47182	288 aa		5.74	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	COS12	P53053	380 aa		5.74	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	TMA16	Q08687	178 aa		5.74	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	ROM2	P51862	1356 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	YLR358C	O13565	187 aa		5.73	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	YCK1	P23291	538 aa		5.73	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	ERG8	P24521	451 aa		5.73	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	JEM1	P40358	645 aa		5.73	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	DJP1	P40564	432 aa		5.73	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	RFX1	P48743	811 aa		5.73	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	DSD1	P53095	428 aa		5.73	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	TAM41	P53230	385 aa		5.73	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	YNR061C	P53747	219 aa		5.73	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	YDR132C	Q03900	495 aa		5.73	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	ARR3	Q06598	404 aa		5.73	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	CIR2	Q08822	631 aa		5.73	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	ISA2	Q12425	185 aa		5.73	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	VCX1	Q99385	411 aa		5.73	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	ALY1	P36117	915 aa		5.72	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	PSD1	P39006	500 aa		5.72	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.72	□□□□□ -1.49	not detected
MTF1	YMR228W	PLB1	P39105	664 aa		5.72	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	YLR224W	Q05947	369 aa		5.72	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	ESC8	Q08119	714 aa		5.72	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
MTF1	YMR228W	YRF1-4	O13559	1382 aa		5.71	□□□□□ -1.5
MTF1	YMR228W	MET3	P08536	511 aa		5.71	□□□□□ -1.5
MTF1	YMR228W	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
MTF1	YMR228W	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
MTF1	YMR228W	CBS1	P14066	229 aa		5.71	□□□□□ -1.5
MTF1	YMR228W	YCR061W	P25639	631 aa		5.71	□□□□□ -1.5
MTF1	YMR228W	CDC20	P26309	610 aa		5.71	□□□□□ -1.5
MTF1	YMR228W	ANP1	P32629	500 aa		5.71	□□□□□ -1.5
MTF1	YMR228W	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
MTF1	YMR228W	RTS1	P38903	757 aa		5.71	□□□□□ -1.5
MTF1	YMR228W	CAJ1	P39101	391 aa		5.71	□□□□□ -1.5
MTF1	YMR228W	SLZ1	P40167	298 aa		5.71	□□□□□ -1.5
MTF1	YMR228W	YJL068C	P40363	299 aa		5.71	□□□□□ -1.5
MTF1	YMR228W	NNF2	P53253	936 aa		5.71	□□□□□ -1.5
MTF1	YMR228W	VPS9	P54787	451 aa		5.71	□□□□□ -1.5
MTF1	YMR228W	MUB1	Q03162	620 aa		5.71	□□□□□ -1.5
MTF1	YMR228W	RMT2	Q03305	412 aa		5.71	□□□□□ -1.5
MTF1	YMR228W	CRF1	Q04930	467 aa		5.71	□□□□□ -1.5
MTF1	YMR228W	ENB1	Q08299	606 aa		5.71	□□□□□ -1.5
MTF1	YMR228W	PMS1	P14242	873 aa		5.7	□□□□□ -1.5

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