RNA–Protein interactions for RNA: YMR025W

CSI1, Transcript of Subunit of the Cop9 signalosome, yeast

Gene CSI1, Length 888 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CSI1	YMR025W	SND1	Q04007	877 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CSI1	YMR025W	SWF1	Q04629	336 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CSI1	YMR025W	TMA17	Q12513	150 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CSI1	YMR025W	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
CSI1	YMR025W	YEN1	P40028	759 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CSI1	YMR025W	UBX6	P47049	396 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CSI1	YMR025W	COG6	P53959	839 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CSI1	YMR025W	YMR254C	Q04838	102 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CSI1	YMR025W	TAH18	Q12181	623 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CSI1	YMR025W	GPA1	P08539	472 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CSI1	YMR025W	SDS22	P36047	338 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CSI1	YMR025W	YBR139W	P38109	508 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CSI1	YMR025W	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
CSI1	YMR025W	SWD1	P39706	426 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CSI1	YMR025W	YDR109C	Q04585	715 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CSI1	YMR025W	ICL2	Q12031	575 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CSI1	YMR025W	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
CSI1	YMR025W	TFC4	P33339	1025 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSI1	YMR025W	SAW1	P39735	261 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSI1	YMR025W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CSI1	YMR025W	HNM1	P19807	563 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CSI1	YMR025W	CBP1	P07252	654 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CSI1	YMR025W	CUL3	P53202	744 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CSI1	YMR025W	CRZ1	P53968	678 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CSI1	YMR025W	IML2	P47031	731 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSI1	YMR025W	YLR352W	Q06479	807 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSI1	YMR025W	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CSI1	YMR025W	LEU5	P38702	357 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CSI1	YMR025W	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CSI1	YMR025W	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CSI1	YMR025W	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CSI1	YMR025W	MSY1	P48527	492 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CSI1	YMR025W	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CSI1	YMR025W	GTB1	Q04924	702 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CSI1	YMR025W	MGR1	P25573	417 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CSI1	YMR025W	URK1	P27515	501 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CSI1	YMR025W	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
CSI1	YMR025W	RAD24	P32641	659 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CSI1	YMR025W	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
CSI1	YMR025W	YJL070C	P40361	888 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CSI1	YMR025W	ASK10	P48361	1146 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CSI1	YMR025W	PEX14	P53112	341 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CSI1	YMR025W	YNL181W	P53878	407 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CSI1	YMR025W	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
CSI1	YMR025W	YLR455W	Q06188	304 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CSI1	YMR025W	YML002W	P0CF17	737 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CSI1	YMR025W	PHM8	P40025	321 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CSI1	YMR025W	ATG27	P46989	271 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CSI1	YMR025W	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
CSI1	YMR025W	SMA1	Q02651	245 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CSI1	YMR025W	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
CSI1	YMR025W	YLR049C	Q12110	428 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CSI1	YMR025W	PCT1	P13259	424 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CSI1	YMR025W	BAR1	P12630	587 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSI1	YMR025W	PMS1	P14242	873 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSI1	YMR025W	TAM41	P53230	385 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSI1	YMR025W	ARP7	Q12406	477 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSI1	YMR025W	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CSI1	YMR025W	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CSI1	YMR025W	GRX4	P32642	244 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CSI1	YMR025W	BUD16	P39988	312 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CSI1	YMR025W	CAB2	P40506	365 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CSI1	YMR025W	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CSI1	YMR025W	YNL234W	P53857	426 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CSI1	YMR025W	ASI1	P54074	624 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CSI1	YMR025W	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CSI1	YMR025W	BAG7	Q12128	409 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CSI1	YMR025W	PDR3	P33200	976 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CSI1	YMR025W	KRE9	P39005	276 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CSI1	YMR025W	MAD3	P47074	515 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CSI1	YMR025W	BSC1	Q12140	328 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CSI1	YMR025W	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
CSI1	YMR025W	YPK3	P38070	525 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CSI1	YMR025W	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
CSI1	YMR025W	MCP2	Q06567	569 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CSI1	YMR025W	RSA1	Q08932	381 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CSI1	YMR025W	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CSI1	YMR025W	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CSI1	YMR025W	STE50	P25344	346 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CSI1	YMR025W	TRS65	P32893	560 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CSI1	YMR025W	RIM2	P38127	377 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CSI1	YMR025W	DJP1	P40564	432 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CSI1	YMR025W	SMA2	Q04658	369 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CSI1	YMR025W	DAP1	Q12091	152 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CSI1	YMR025W	SUL2	Q12325	893 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CSI1	YMR025W	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CSI1	YMR025W	SIR1	P21691	654 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CSI1	YMR025W	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
CSI1	YMR025W	YSP3	P25036	478 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CSI1	YMR025W	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
CSI1	YMR025W	ATG21	Q02887	496 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CSI1	YMR025W	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
CSI1	YMR025W	FCP1	Q03254	732 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CSI1	YMR025W	CHO1	P08456	276 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CSI1	YMR025W	DOS2	P54858	310 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CSI1	YMR025W	PFA5	Q03289	374 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CSI1	YMR025W	RSF1	Q05043	376 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CSI1	YMR025W	PET122	P10355	254 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CSI1	YMR025W	RIT1	P23796	513 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CSI1	YMR025W	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76

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