RNA–Protein interactions for RNA: YML055W

SPC2, Transcript of Subunit of signal peptidase complex, yeast

Gene SPC2, Length 537 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPC2	YML055W	ATO2	P32907	282 aa		4.29	□□□□□ -1.72
SPC2	YML055W	YBR138C	P38277	524 aa		4.29	□□□□□ -1.72
SPC2	YML055W	PUG1	P40100	303 aa		4.29	□□□□□ -1.72
SPC2	YML055W	YPT11	P48559	417 aa		4.29	□□□□□ -1.72
SPC2	YML055W	SCS3	P53012	380 aa		4.29	□□□□□ -1.72
SPC2	YML055W	YNL144C	P53907	740 aa		4.29	□□□□□ -1.72
SPC2	YML055W	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	4.29	□□□□□ -1.72
SPC2	YML055W	UBX3	Q12229	455 aa		4.29	□□□□□ -1.72
SPC2	YML055W	YML003W	P0CF16	290 aa		4.28	□□□□□ -1.72
SPC2	YML055W	CLB4	P24871	460 aa		4.28	□□□□□ -1.72
SPC2	YML055W	ZAP1	P47043	880 aa		4.28	□□□□□ -1.72
SPC2	YML055W	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.28	□□□□□ -1.72
SPC2	YML055W	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	4.28	□□□□□ -1.72
SPC2	YML055W	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	4.28	□□□□□ -1.72
SPC2	YML055W	BOP3	P53958	396 aa		4.28	□□□□□ -1.72
SPC2	YML055W	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	4.28	□□□□□ -1.72
SPC2	YML055W	NUP53	Q03790	475 aa		4.28	□□□□□ -1.72
SPC2	YML055W	PIG1	Q06216	648 aa		4.28	□□□□□ -1.72
SPC2	YML055W	VAM6	Q07468	1049 aa		4.28	□□□□□ -1.72
SPC2	YML055W	MCH4	Q08268	501 aa		4.28	□□□□□ -1.72
SPC2	YML055W	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
SPC2	YML055W	PCT1	P13259	424 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SPC2	YML055W	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
SPC2	YML055W	ASG1	P40467	964 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SPC2	YML055W	TDA9	Q04545	1251 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SPC2	YML055W	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.27	□□□□□ -1.73	not detected
SPC2	YML055W	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
SPC2	YML055W	SPO16	P17122	198 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SPC2	YML055W	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
SPC2	YML055W	NUP120	P35729	1037 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SPC2	YML055W	NPR3	P38742	1146 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SPC2	YML055W	VPS41	P38959	992 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SPC2	YML055W	ACA1	P39970	489 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SPC2	YML055W	YIL152W	P40455	235 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SPC2	YML055W	ERR3	P42222	437 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SPC2	YML055W	STB2	P46679	850 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SPC2	YML055W	UBP8	P50102	471 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SPC2	YML055W	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
SPC2	YML055W	SWF1	Q04629	336 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SPC2	YML055W	SNA4	Q07549	140 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SPC2	YML055W	SRL1	Q08673	210 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SPC2	YML055W	DSE3	Q08729	430 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SPC2	YML055W	BUD7	Q08754	746 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SPC2	YML055W	SWT1	Q12104	458 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SPC2	YML055W	YSP3	P25036	478 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SPC2	YML055W	GEX2	P36173	615 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SPC2	YML055W	EXO84	P38261	753 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SPC2	YML055W	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
SPC2	YML055W	GSH2	Q08220	491 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SPC2	YML055W	YOL057W	Q08225	711 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SPC2	YML055W	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
SPC2	YML055W	MSM1	P22438	575 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SPC2	YML055W	YCR006C	P25350	157 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SPC2	YML055W	YCL049C	P25577	312 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SPC2	YML055W	MRPL36	P36531	177 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SPC2	YML055W	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
SPC2	YML055W	MEP2	P41948	499 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SPC2	YML055W	UBX4	P54730	416 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SPC2	YML055W	CAC2	Q04199	468 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SPC2	YML055W	STP3	Q05937	343 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SPC2	YML055W	MLH2	Q07980	695 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SPC2	YML055W	GPA1	P08539	472 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SPC2	YML055W	VPS25	P47142	202 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SPC2	YML055W	YLR455W	Q06188	304 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SPC2	YML055W	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
SPC2	YML055W	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
SPC2	YML055W	SWA2	Q06677	668 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SPC2	YML055W	YLR049C	Q12110	428 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SPC2	YML055W	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SPC2	YML055W	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SPC2	YML055W	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SPC2	YML055W	PCL6	P40038	420 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SPC2	YML055W	PSF2	P40359	213 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SPC2	YML055W	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SPC2	YML055W	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SPC2	YML055W	CIA1	Q05583	330 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SPC2	YML055W	ECI1	Q05871	280 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SPC2	YML055W	POS5	Q06892	414 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SPC2	YML055W	FRE3	Q08905	711 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SPC2	YML055W	YFL068W	P0CX99	160 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SPC2	YML055W	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SPC2	YML055W	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SPC2	YML055W	MTF2	P10849	440 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SPC2	YML055W	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
SPC2	YML055W	ASE1	P50275	885 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SPC2	YML055W	MRPL13	Q02204	264 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SPC2	YML055W	BLS1	Q06071	122 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SPC2	YML055W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SPC2	YML055W	NUC1	P08466	329 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SPC2	YML055W	YCR043C	P25361	127 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SPC2	YML055W	LHS1	P36016	881 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SPC2	YML055W	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SPC2	YML055W	UBP13	P38187	747 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SPC2	YML055W	MRX1	P40050	688 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SPC2	YML055W	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SPC2	YML055W	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SPC2	YML055W	YLR281C	Q05863	155 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SPC2	YML055W	CRN1	Q06440	651 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SPC2	YML055W	YLR112W	Q12130	139 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SPC2	YML055W	COX17	Q12287	69 aa		4.19	□□□□□ -1.74

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 11.6 ms