RNA–Protein interactions for RNA: YLL055W

YCT1, Transcript of High-affinity cysteine-specific transporter, yeast

Gene YCT1, Length 1,596 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YCT1	YLL055W	DBF20	P32328	564 aa		3.46	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	FLO5	P38894	1075 aa		3.46	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	PHM8	P40025	321 aa		3.46	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	CDC1	P40986	491 aa		3.46	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	YER190C-B	P0CX94	160 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	MTF2	P10849	440 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	EXO84	P38261	753 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	MPS1	P54199	764 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	VTC3	Q02725	835 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	MRPL1	Q04599	285 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	PDR8	Q06149	701 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	HER1	Q12276	1246 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	COX17	Q12287	69 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	RRI1	Q12468	440 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	PCT1	P13259	424 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	CNA1	P23287	553 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	YSP3	P25036	478 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	ASK1	P35734	292 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	GEX2	P36173	615 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	ASG1	P40467	964 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	3.45	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	TPK1	P06244	397 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	RAD16	P31244	790 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	XRS2	P33301	854 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	OCT1	P35999	772 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	SAP185	P40856	1058 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	SMK1	P41808	388 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	COG1	P53079	417 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	3.43	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	YCR006C	P25350	157 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	MGM1	P32266	881 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	SCO2	P38072	301 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	IFA38	P38286	347 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	ASE1	P50275	885 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	YNL144C	P53907	740 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	3.43	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	YPL068C	Q02749	293 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	ATG16	Q03818	150 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	3.43	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	SWA2	Q06677	668 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	MCH4	Q08268	501 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	ATX2	Q12067	313 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	PCD1	Q12524	340 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	TY2A-F	P0CX61	438 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	TY2A-C	P25383	438 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	IES5	P40060	125 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	RTS3	P53289	263 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	PIG1	Q06216	648 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	PSR2	Q07949	397 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	TMA16	Q08687	178 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	TY2A-B	Q12260	438 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.42	□□□□□ -1.86	not detected
YCT1	YLL055W	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	YPT11	P48559	417 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	CTF18	P49956	741 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	TFC6	Q06339	672 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	CRN1	Q06440	651 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	YLR049C	Q12110	428 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	UBP13	P38187	747 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	VPS41	P38959	992 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	YIR016W	P40572	265 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	MDV1	P47025	714 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	UBP8	P50102	471 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	CIR2	Q08822	631 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	SSM4	P40318	1319 aa		3.4	□□□□□ -1.86
YCT1	YLL055W	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	GPA1	P08539	472 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	TFC3	P34111	1160 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87

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