RNA–Protein interactions for RNA: YKL214C

YRA2, Transcript of Member of the REF (RNA and export factor binding proteins) family, yeast

Gene YRA2, Length 612 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YRA2	YKL214C	TY1A-PL	P0CX73	440 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	TY1A-JR1	P0CX74	440 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	TY1A-LR3	P0CX75	440 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	TY1A-ML2	P0CX76	440 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	CBS1	P14066	229 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	PHO91	P27514	894 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	AFG2	P32794	780 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	SAP190	P36123	1033 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	PXL1	P36166	706 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	SRO77	P38163	1010 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	YHL017W	P38745	532 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	NEM1	P38757	446 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	PIH1	P38768	344 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	LYS9	P38999	446 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	YEL076C	P39971	216 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	RCM1	P53972	490 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	ORC4	P54791	529 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	YAP6	Q03935	383 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	MGR3	Q04472	501 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	YPL277C	Q08989	487 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	RIM20	Q12033	661 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	VPS54	Q12071	889 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	TY1A-GR1	Q12085	440 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	TY3A-G	Q12173	290 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	CTF3	Q12748	733 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	TY1A-PR3	Q6Q5H1	440 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	TY1A-OL	Q92392	440 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	TY3A-I	Q99219	290 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	AFI1	Q99222	893 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	USO1	P25386	1790 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	PCK1	P10963	549 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	YCK1	P23291	538 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	RIT1	P23796	513 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	PRD1	P25375	712 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	CWH43	P25618	953 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	YCR051W	P25631	222 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	ERV1	P27882	189 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	HMX1	P32339	317 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	REG2	P38232	338 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	SLX1	P38324	304 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	WSS1	P38838	269 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	PNT1	P38969	423 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	MRX1	P40050	688 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	DOT5	P40553	215 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	CGR1	P53188	120 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	MRPL1	Q04599	285 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	MMR1	Q06324	491 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	ENT4	Q07872	247 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	RSB1	Q08417	382 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	KSS1	P14681	368 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	SIR1	P21691	654 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	SPS22	P25380	463 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	YCL002C	P25565	263 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	SRP101	P32916	621 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	SRB2	P34162	210 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	CTF13	P35203	478 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	HEL1	P36113	551 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	PEX32	P38292	413 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	SMF1	P38925	575 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	YDR089W	P38966	869 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	GIP4	P39732	760 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	IRC5	P43610	853 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	TCB2	P48231	1178 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	ECL1	P48235	211 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	MLC1	P53141	149 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	SDH1	Q00711	640 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	SMA1	Q02651	245 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	NGL3	Q03210	505 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	ABZ2	Q03266	374 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	RAD30	Q04049	632 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68

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