RNA–Protein interactions for RNA: YJL011C

RPC17, Transcript of RNA polymerase III subunit C17, yeast

Gene RPC17, Length 486 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPC17	YJL011C	TAX4	P47030	604 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RPC17	YJL011C	UBX6	P47049	396 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RPC17	YJL011C	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RPC17	YJL011C	BAG7	Q12128	409 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RPC17	YJL011C	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
RPC17	YJL011C	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
RPC17	YJL011C	HOT13	P36078	116 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RPC17	YJL011C	YEL068C	P39977	110 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RPC17	YJL011C	CIR1	P42940	261 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RPC17	YJL011C	VPS4	P52917	437 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RPC17	YJL011C	YDR109C	Q04585	715 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RPC17	YJL011C	RCO1	Q04779	684 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RPC17	YJL011C	OSW1	Q08692	278 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RPC17	YJL011C	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
RPC17	YJL011C	SAN1	P22470	610 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RPC17	YJL011C	GSH1	P32477	678 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RPC17	YJL011C	PAH1	P32567	862 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RPC17	YJL011C	YJR061W	P40355	935 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RPC17	YJL011C	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
RPC17	YJL011C	YAT1	P80235	687 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RPC17	YJL011C	YKU80	Q04437	629 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RPC17	YJL011C	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
RPC17	YJL011C	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
RPC17	YJL011C	RRI2	Q12348	645 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RPC17	YJL011C	YOR019W	Q99248	730 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RPC17	YJL011C	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	CDC16	P09798	840 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	SRB5	P32585	307 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	LYS14	P40971	790 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	SIP4	P46954	829 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	ENT4	Q07872	247 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	YLR111W	Q12528	110 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	AAC3	P18238	307 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	PTC6	P25646	442 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	TFC3	P34111	1160 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	FTH1	P38310	465 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	ERV46	P39727	415 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	PHM8	P40025	321 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	SWP82	P43554	623 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	CRN1	Q06440	651 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	BSP1	Q06604	576 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	SWA2	Q06677	668 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	MAK32	P23060	363 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	ALY1	P36117	915 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	TMA108	P40462	946 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	YPR003C	P53394	754 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	BSC5	P53755	489 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	INN1	P53901	409 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	YSA1	Q01976	231 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	FCP1	Q03254	732 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	NUS1	Q12063	375 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	MBR1	P23493	339 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	PEX2	P32800	271 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	IME4	P41833	600 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	COG4	Q06096	861 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	NBP2	Q12163	236 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	FRE7	Q12333	620 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	SKM1	Q12469	655 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	SEM1	O94742	89 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	BI2	P03873	423 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	ERG11	P10614	530 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	IMP2'	P32351	346 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	UBP13	P38187	747 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	APD1	P38281	316 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	SLZ1	P40167	298 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	CDC1	P40986	491 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	AAD10	P47182	288 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	MUB1	Q03162	620 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	YOR389W	Q08912	624 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	ERP2	P39704	215 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	CIN1	P40987	1014 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RPC17	YJL011C	YPL071C	Q02864	156 aa		4.66	□□□□□ -1.66

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