RNA–Protein interactions for RNA: YHR148W

IMP3, Transcript of Component of the SSU processome, yeast

Gene IMP3, Length 552 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
IMP3	YHR148W	RAD16	P31244	790 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IMP3	YHR148W	AXL2	P38928	823 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IMP3	YHR148W	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
IMP3	YHR148W	XBP1	P40489	647 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IMP3	YHR148W	DJP1	P40564	432 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IMP3	YHR148W	IML2	P47031	731 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IMP3	YHR148W	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
IMP3	YHR148W	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
IMP3	YHR148W	TMA16	Q08687	178 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IMP3	YHR148W	BAG7	Q12128	409 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IMP3	YHR148W	YMR085W	P0CF18	432 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IMP3	YHR148W	NUP120	P35729	1037 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IMP3	YHR148W	PSD1	P39006	500 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IMP3	YHR148W	CDC1	P40986	491 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IMP3	YHR148W	YNL058C	P53947	316 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IMP3	YHR148W	REG1	Q00816	1014 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IMP3	YHR148W	SSP2	Q08646	371 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IMP3	YHR148W	SPO16	P17122	198 aa		4.79	□□□□□ -1.64
IMP3	YHR148W	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
IMP3	YHR148W	IRC7	P43623	340 aa		4.79	□□□□□ -1.64
IMP3	YHR148W	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
IMP3	YHR148W	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
IMP3	YHR148W	THI3	Q07471	609 aa		4.79	□□□□□ -1.64
IMP3	YHR148W	SLC1	P33333	303 aa		4.78	□□□□□ -1.64
IMP3	YHR148W	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
IMP3	YHR148W	PHM8	P40025	321 aa		4.78	□□□□□ -1.64
IMP3	YHR148W	LTP1	P40347	161 aa		4.78	□□□□□ -1.64
IMP3	YHR148W	SNO3	P43544	222 aa		4.78	□□□□□ -1.64
IMP3	YHR148W	ASE1	P50275	885 aa		4.78	□□□□□ -1.64
IMP3	YHR148W	YNR061C	P53747	219 aa		4.78	□□□□□ -1.64
IMP3	YHR148W	PFA4	Q12006	378 aa		4.78	□□□□□ -1.64
IMP3	YHR148W	VCX1	Q99385	411 aa		4.78	□□□□□ -1.64
IMP3	YHR148W	GAL4	P04386	881 aa		4.77	□□□□□ -1.65
IMP3	YHR148W	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
IMP3	YHR148W	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.77	□□□□□ -1.65	not detected
IMP3	YHR148W	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
IMP3	YHR148W	RRN3	P36070	627 aa		4.77	□□□□□ -1.65
IMP3	YHR148W	UME6	P39001	836 aa		4.77	□□□□□ -1.65
IMP3	YHR148W	SWA2	Q06677	668 aa		4.77	□□□□□ -1.65
IMP3	YHR148W	ERG8	P24521	451 aa		4.76	□□□□□ -1.65
IMP3	YHR148W	CNS1	P33313	385 aa		4.76	□□□□□ -1.65
IMP3	YHR148W	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
IMP3	YHR148W	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
IMP3	YHR148W	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
IMP3	YHR148W	SNO4	Q04902	237 aa		4.76	□□□□□ -1.65
IMP3	YHR148W	CRN1	Q06440	651 aa		4.76	□□□□□ -1.65
IMP3	YHR148W	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
IMP3	YHR148W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
IMP3	YHR148W	HSP32	Q08992	237 aa		4.76	□□□□□ -1.65
IMP3	YHR148W	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
IMP3	YHR148W	CRC1	Q12289	327 aa		4.76	□□□□□ -1.65
IMP3	YHR148W	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
IMP3	YHR148W	DPB3	P27344	201 aa		4.75	□□□□□ -1.65
IMP3	YHR148W	COQ3	P27680	312 aa		4.75	□□□□□ -1.65
IMP3	YHR148W	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
IMP3	YHR148W	UBP13	P38187	747 aa		4.75	□□□□□ -1.65
IMP3	YHR148W	YER010C	P40011	234 aa		4.75	□□□□□ -1.65
IMP3	YHR148W	SWP82	P43554	623 aa		4.75	□□□□□ -1.65
IMP3	YHR148W	ORC5	P50874	479 aa		4.75	□□□□□ -1.65
IMP3	YHR148W	PTP1	P25044	335 aa		4.74	□□□□□ -1.65
IMP3	YHR148W	SRB5	P32585	307 aa		4.74	□□□□□ -1.65
IMP3	YHR148W	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
IMP3	YHR148W	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
IMP3	YHR148W	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
IMP3	YHR148W	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
IMP3	YHR148W	FMP10	P40098	244 aa		4.74	□□□□□ -1.65
IMP3	YHR148W	RIC1	P40395	1056 aa		4.74	□□□□□ -1.65
IMP3	YHR148W	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
IMP3	YHR148W	NET1	P47035	1189 aa		4.74	□□□□□ -1.65
IMP3	YHR148W	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
IMP3	YHR148W	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
IMP3	YHR148W	PSK2	Q08217	1101 aa		4.74	□□□□□ -1.65
IMP3	YHR148W	YOL087C	Q99247	1116 aa		4.74	□□□□□ -1.65
IMP3	YHR148W	YLR302C	O13544	120 aa		4.73	□□□□□ -1.65
IMP3	YHR148W	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
IMP3	YHR148W	ARN1	P38731	627 aa		4.73	□□□□□ -1.65
IMP3	YHR148W	YJL107C	P42947	387 aa		4.73	□□□□□ -1.65
IMP3	YHR148W	VPS4	P52917	437 aa		4.73	□□□□□ -1.65
IMP3	YHR148W	MEP3	P53390	489 aa		4.73	□□□□□ -1.65
IMP3	YHR148W	STP1	Q00947	519 aa		4.73	□□□□□ -1.65
IMP3	YHR148W	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
IMP3	YHR148W	YOR019W	Q99248	730 aa		4.73	□□□□□ -1.65
IMP3	YHR148W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.72	□□□□□ -1.65
IMP3	YHR148W	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
IMP3	YHR148W	MSS51	P32335	436 aa		4.72	□□□□□ -1.65
IMP3	YHR148W	SSH4	P32343	579 aa		4.72	□□□□□ -1.65
IMP3	YHR148W	MRP20	P32387	263 aa		4.72	□□□□□ -1.65
IMP3	YHR148W	CBF2	P32504	956 aa		4.72	□□□□□ -1.65
IMP3	YHR148W	TFC3	P34111	1160 aa		4.72	□□□□□ -1.65
IMP3	YHR148W	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
IMP3	YHR148W	ASG1	P40467	964 aa		4.72	□□□□□ -1.65
IMP3	YHR148W	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
IMP3	YHR148W	PDR8	Q06149	701 aa		4.72	□□□□□ -1.65
IMP3	YHR148W	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
IMP3	YHR148W	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
IMP3	YHR148W	PET111	P08468	800 aa		4.71	□□□□□ -1.66
IMP3	YHR148W	GPA1	P08539	472 aa		4.71	□□□□□ -1.66
IMP3	YHR148W	MCM10	P32354	571 aa		4.71	□□□□□ -1.66
IMP3	YHR148W	OCT1	P35999	772 aa		4.71	□□□□□ -1.66
IMP3	YHR148W	YIL024C	P40543	189 aa		4.71	□□□□□ -1.66

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