RNA–Protein interactions for RNA: YHL004W

MRP4, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene MRP4, Length 1,185 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRP4	YHL004W	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	CBK1	P53894	756 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	YNL058C	P53947	316 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	SEC5	P89102	971 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	ECM9	Q02202	377 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	TMN2	Q04562	672 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	YLH47	Q06493	454 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	NUR1	Q12066	484 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	FBP1	P09201	348 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	PDX1	P16451	410 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	RPC53	P25441	422 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	SPC110	P32380	944 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	AFR1	P33304	620 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	TGL1	P34163	548 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	MTH1	P35198	433 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	SAP190	P36123	1033 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	APM3	P38153	483 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	GAA1	P39012	614 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	YNR061C	P53747	219 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	TIM10	P87108	93 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	CIK1	Q01649	594 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	ATP25	Q03153	612 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	ARA2	Q04212	335 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	HLR1	Q04429	423 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	AIM33	Q04516	312 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	FUS2	Q05670	677 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	SPH1	Q06160	661 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	SUE1	Q06524	206 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	MET7	Q08645	548 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	ARP7	Q12406	477 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	ARP6	Q12509	438 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	HOP1	P20050	605 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	DPH2	P32461	534 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	RPD3	P32561	433 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	NPL6	P32832	435 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	RIC1	P40395	1056 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	ERG5	P54781	538 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	ORC4	P54791	529 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	SSL2	Q00578	843 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	MUK1	Q02866	612 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	WAR1	Q03631	944 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	YDL073W	Q07454	984 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	TLG2	Q08144	397 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	YLR464W	P0CX17	216 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	MET8	P15807	274 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	OM45	P16547	393 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	MDL1	P33310	695 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	STE13	P33894	931 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	EMC3	P36039	253 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	FTH1	P38310	465 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	SIP3	P38717	1229 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	NDT80	P38830	627 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	YEL076C	P39971	216 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	HMF1	P40037	129 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	PSF2	P40359	213 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	VID30	P53076	958 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	VPS75	P53853	264 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	RBA50	Q04418	439 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	ADY4	Q05955	493 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	VHS3	Q08438	674 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	AFT2	Q08957	416 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	PLP2	Q12017	286 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	TY3A-G	Q12173	290 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	TY3A-I	Q99219	290 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	CLN3	P13365	580 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MRP4	YHL004W	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MRP4	YHL004W	UTR4	P32626	227 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MRP4	YHL004W	CTM1	P38818	585 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MRP4	YHL004W	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MRP4	YHL004W	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MRP4	YHL004W	TOK1	P40310	691 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MRP4	YHL004W	YJL068C	P40363	299 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MRP4	YHL004W	ALY2	P47029	1046 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MRP4	YHL004W	YJL055W	P47044	245 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MRP4	YHL004W	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MRP4	YHL004W	PGA2	P53903	129 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MRP4	YHL004W	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MRP4	YHL004W	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MRP4	YHL004W	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.52	□□□□□ -1.69	not detected
MRP4	YHL004W	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MRP4	YHL004W	CIA1	Q05583	330 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MRP4	YHL004W	VID22	Q05934	901 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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