RNA–Protein interactions for RNA: YDR077W

SED1, Transcript of Major stress-induced structural GPI-cell wall glycoprotein, yeastyeast

Gene SED1, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SED1YDR077W TMA22P47089 198 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
SED1YDR077W PET117Q02771 107 aa9.6□□□□□ -0.87
SED1YDR077W RPN9Q04062 393 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
SED1YDR077W YDR109CQ04585 715 aa9.6□□□□□ -0.87
SED1YDR077W YCS4Q06156 1176 aa9.6□□□□□ -0.87
SED1YDR077W YOR387CQ08910 206 aa9.6□□□□□ -0.87
SED1YDR077W PMR1P13586 950 aa9.59□□□□□ -0.87
SED1YDR077W ARG1P22768 420 aa9.59□□□□□ -0.87
SED1YDR077W MIH1P23748 554 aa9.59□□□□□ -0.87
SED1YDR077W YSP3P25036 478 aa9.59□□□□□ -0.87
SED1YDR077W MCM5P29496 775 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SED1YDR077W ISF1P32488 338 aa9.59□□□□□ -0.87
SED1YDR077W APM3P38153 483 aa9.59□□□□□ -0.87
SED1YDR077W PEX28P38848 579 aa9.59□□□□□ -0.87
SED1YDR077W HOS4P40480 1083 aa9.59□□□□□ -0.87
SED1YDR077W BUD13P46947 266 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SED1YDR077W PEX8P53248 589 aa9.59□□□□□ -0.87
SED1YDR077W HPT1Q04178 221 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SED1YDR077W YDR338CQ05497 695 aa9.59□□□□□ -0.87
SED1YDR077W SYT1Q06836 1226 aa9.59□□□□□ -0.87
SED1YDR077W YMR030W-AQ3E760 96 aa9.59□□□□□ -0.87
SED1YDR077W ENO1P00924 437 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
SED1YDR077W PPH22P23595 377 aa9.58□□□□□ -0.88
SED1YDR077W SNT1P25357 1226 aa9.58□□□□□ -0.88
SED1YDR077W DCC1P25559 380 aa9.58□□□□□ -0.88
SED1YDR077W GCD11P32481 527 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
SED1YDR077W YSC84P32793 468 aa9.58□□□□□ -0.88
SED1YDR077W TFA2P36145 328 aa9.58□□□□□ -0.88
SED1YDR077W RIM2P38127 377 aa9.58□□□□□ -0.88
SED1YDR077W KTR7P40504 517 aa9.58□□□□□ -0.88
SED1YDR077W CHS6P40955 746 aa9.58□□□□□ -0.88
SED1YDR077W TEL2P53038 688 aa9.58□□□□□ -0.88
SED1YDR077W YTP1P53584 459 aa9.58□□□□□ -0.88
SED1YDR077W GTR1Q00582 310 aa9.58□□□□□ -0.88
SED1YDR077W NUP100Q02629 959 aa9.58□□□□□ -0.88
SED1YDR077W SPC24Q04477 213 aa9.58□□□□□ -0.88
SED1YDR077W CHS5Q12114 671 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
SED1YDR077W NOT5Q12514 560 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
SED1YDR077W RAD3P06839 778 aa9.57□□□□□ -0.88
SED1YDR077W SCH9P11792 824 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
SED1YDR077W MRPL8P22353 238 aa9.57□□□□□ -0.88
SED1YDR077W BEM1P29366 551 aa9.57□□□□□ -0.88
SED1YDR077W MVD1P32377 396 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
SED1YDR077W RRN3P36070 627 aa9.57□□□□□ -0.88
SED1YDR077W ERP5P38819 212 aa9.57□□□□□ -0.88
SED1YDR077W YHR182WP38870 785 aa9.57□□□□□ -0.88
SED1YDR077W SEO1P39709 593 aa9.57□□□□□ -0.88
SED1YDR077W SLX8P40072 274 aa9.57□□□□□ -0.88
SED1YDR077W RGI2P40188 164 aa9.57□□□□□ -0.88
SED1YDR077W LSB6P42951 607 aa9.57□□□□□ -0.88
SED1YDR077W ADE12P80210 433 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
SED1YDR077W REG1Q00816 1014 aa9.57□□□□□ -0.88
SED1YDR077W YMR206WQ03695 313 aa9.57□□□□□ -0.88
SED1YDR077W TVP15Q03860 143 aa9.57□□□□□ -0.88
SED1YDR077W GSF2Q04697 403 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
SED1YDR077W PEX15Q08215 383 aa9.57□□□□□ -0.88
SED1YDR077W HSF1P10961 833 aa9.56□□□□□ -0.88
SED1YDR077W SST2P11972 698 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
SED1YDR077W NSP1P14907 823 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
SED1YDR077W DAL81P21657 970 aa9.56□□□□□ -0.88
SED1YDR077W RBK1P25332 333 aa9.56□□□□□ -0.88
SED1YDR077W EMC1P25574 760 aa9.56□□□□□ -0.88
SED1YDR077W COQ8P27697 501 aa9.56□□□□□ -0.88
SED1YDR077W AEP1P32493 518 aa9.56□□□□□ -0.88
SED1YDR077W IMP3P32899 183 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
SED1YDR077W TOM20P35180 183 aa9.56□□□□□ -0.88
SED1YDR077W MAC1P35192 417 aa9.56□□□□□ -0.88
SED1YDR077W CTF13P35203 478 aa9.56□□□□□ -0.88
SED1YDR077W POL12P38121 705 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
SED1YDR077W RFC3P38629 340 aa9.56□□□□□ -0.88
SED1YDR077W MNN1P39106 762 aa9.56□□□□□ -0.88
SED1YDR077W YJR061WP40355 935 aa9.56□□□□□ -0.88
SED1YDR077W RNR4P49723 345 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
SED1YDR077W AMA1P50082 593 aa9.56□□□□□ -0.88
SED1YDR077W SAP4P53036 818 aa9.56□□□□□ -0.88
SED1YDR077W YPL014WQ02606 381 aa9.56□□□□□ -0.88
SED1YDR077W TFB2Q02939 513 aa9.56□□□□□ -0.88
SED1YDR077W PDB1P32473 366 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
SED1YDR077W HAT2P39984 401 aa9.55□□□□□ -0.88
SED1YDR077W MOB1P40484 314 aa9.55□□□□□ -0.88
SED1YDR077W SIP4P46954 829 aa9.55□□□□□ -0.88
SED1YDR077W MAD3P47074 515 aa9.55□□□□□ -0.88
SED1YDR077W MRM2P53123 320 aa9.55□□□□□ -0.88
SED1YDR077W RPL34AP87262 121 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
SED1YDR077W LEE1Q02799 301 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
SED1YDR077W RNY1Q02933 434 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
SED1YDR077W SEG1Q04279 960 aa9.55□□□□□ -0.88
SED1YDR077W GTB1Q04924 702 aa9.55□□□□□ -0.88
SED1YDR077W NDD1Q08887 554 aa9.55□□□□□ -0.88
SED1YDR077W RIB2Q12362 591 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
SED1YDR077W PEX11Q12462 236 aa9.55□□□□□ -0.88
SED1YDR077W EXO70P19658 623 aa9.54□□□□□ -0.88
SED1YDR077W VAC17P25591 423 aa9.54□□□□□ -0.88
SED1YDR077W ASK1P35734 292 aa9.54□□□□□ -0.88
SED1YDR077W YDR089WP38966 869 aa9.54□□□□□ -0.88
SED1YDR077W EXO1P39875 702 aa9.54□□□□□ -0.88
SED1YDR077W MGS1P40151 587 aa9.54□□□□□ -0.88
SED1YDR077W AXL1P40851 1208 aa9.54□□□□□ -0.88
SED1YDR077W UBP6P43593 499 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
SED1YDR077W FMN1Q03778 218 aa9.54□□□□□ -0.88
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