RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343028.8

TM7SF3-201, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TM7SF3, Length 2,709 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-201ENST00000343028 DUOX1Q9NRD9 1551 aa22.22■■□□□ 1.15
TM7SF3-201ENST00000343028 STAMQ92783 540 aa22.22■■□□□ 1.15
TM7SF3-201ENST00000343028 A0A087X0B3 334 aa22.21■■□□□ 1.15
TM7SF3-201ENST00000343028 TOM1O60784 492 aa22.21■■□□□ 1.15
TM7SF3-201ENST00000343028 TM4SF1P30408 202 aa22.21■■□□□ 1.15
TM7SF3-201ENST00000343028 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
TM7SF3-201ENST00000343028 MAN1B1Q9UKM7 699 aa22.21■■□□□ 1.15
TM7SF3-201ENST00000343028 LTBP4Q8N2S1 1624 aa22.21■■□□□ 1.15
TM7SF3-201ENST00000343028 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa22.21■■□□□ 1.15
TM7SF3-201ENST00000343028 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP22.21■■□□□ 1.15
TM7SF3-201ENST00000343028 KRT2P35908 639 aa22.21■■□□□ 1.15
TM7SF3-201ENST00000343028 PTPN14Q15678 1187 aa22.21■■□□□ 1.15
TM7SF3-201ENST00000343028 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP22.2■■□□□ 1.14
TM7SF3-201ENST00000343028 PHF20Q9BVI0 1012 aa22.2■■□□□ 1.14
TM7SF3-201ENST00000343028 TRIM75PA6NK02 468 aa22.2■■□□□ 1.14
TM7SF3-201ENST00000343028 UBAP1LF5GYI3 381 aa22.2■■□□□ 1.14
TM7SF3-201ENST00000343028 XBP1P17861 261 aa22.2■■□□□ 1.14
TM7SF3-201ENST00000343028 RFC4P35249 363 aa22.2■■□□□ 1.14
TM7SF3-201ENST00000343028 VPS72Q15906 364 aa22.2■■□□□ 1.14
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TM7SF3-201ENST00000343028 RGS22Q8NE09 1264 aa22.19■■□□□ 1.14
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TM7SF3-201ENST00000343028 SCN7AQ01118 1682 aa22.19■■□□□ 1.14
TM7SF3-201ENST00000343028 GSDMDP57764 484 aa22.19■■□□□ 1.14
TM7SF3-201ENST00000343028 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
TM7SF3-201ENST00000343028 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.14
TM7SF3-201ENST00000343028 USP21Q9UK80 565 aa22.19■■□□□ 1.14
TM7SF3-201ENST00000343028 V9GYY5 206 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
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TM7SF3-201ENST00000343028 TMTC3Q6ZXV5 915 aa22.18■■□□□ 1.14
TM7SF3-201ENST00000343028 SLC44A5Q8NCS7 719 aa22.18■■□□□ 1.14
TM7SF3-201ENST00000343028 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP22.18■■□□□ 1.14
TM7SF3-201ENST00000343028 COBLO75128 1261 aa22.18■■□□□ 1.14
TM7SF3-201ENST00000343028 USP5P45974 858 aa22.18■■□□□ 1.14
TM7SF3-201ENST00000343028 KLHL10Q6JEL2 608 aa22.18■■□□□ 1.14
TM7SF3-201ENST00000343028 CCDC112Q8NEF3 446 aa22.18■■□□□ 1.14
TM7SF3-201ENST00000343028 SMARCE1Q969G3 411 aa22.18■■□□□ 1.14
TM7SF3-201ENST00000343028 MTA3Q9BTC8 594 aa22.18■■□□□ 1.14
TM7SF3-201ENST00000343028 ANKRD2Q9GZV1 360 aa22.18■■□□□ 1.14
TM7SF3-201ENST00000343028 VWA3AA6NCI4 1184 aa22.17■■□□□ 1.14
TM7SF3-201ENST00000343028 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
TM7SF3-201ENST00000343028 FAM196AQ6ZSG2 479 aa22.17■■□□□ 1.14
TM7SF3-201ENST00000343028 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa22.17■■□□□ 1.14
TM7SF3-201ENST00000343028 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
TM7SF3-201ENST00000343028 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
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TM7SF3-201ENST00000343028 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP22.17■■□□□ 1.14
TM7SF3-201ENST00000343028 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
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TM7SF3-201ENST00000343028 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa22.17■■□□□ 1.14
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TM7SF3-201ENST00000343028 NPY5RQ15761 445 aa22.16■■□□□ 1.14
TM7SF3-201ENST00000343028 IMPACTQ9P2X3 320 aa22.16■■□□□ 1.14
TM7SF3-201ENST00000343028 CEP131Q9UPN4 1083 aa22.16■■□□□ 1.14
TM7SF3-201ENST00000343028 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa22.16■■□□□ 1.14
TM7SF3-201ENST00000343028 USP17L3A6NCW0 530 aa22.16■■□□□ 1.14
TM7SF3-201ENST00000343028 USP17L4A6NCW7 530 aa22.16■■□□□ 1.14
TM7SF3-201ENST00000343028 RASGRP2Q7LDG7 609 aa22.16■■□□□ 1.14
TM7SF3-201ENST00000343028 USP17L1Q7RTZ2 530 aa22.16■■□□□ 1.14
TM7SF3-201ENST00000343028 SEMA3EO15041 775 aa22.15■■□□□ 1.14
TM7SF3-201ENST00000343028 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
TM7SF3-201ENST00000343028 RCAN1P53805 252 aa22.15■■□□□ 1.14
TM7SF3-201ENST00000343028 STX17P56962 302 aa22.15■■□□□ 1.14
TM7SF3-201ENST00000343028 NLRP5P59047 1200 aa22.15■■□□□ 1.14
TM7SF3-201ENST00000343028 STAG2Q8N3U4 1231 aa22.15■■□□□ 1.14
TM7SF3-201ENST00000343028 RASGRP4Q8TDF6 673 aa22.15■■□□□ 1.14
TM7SF3-201ENST00000343028 CDC25AP30304 524 aa22.15■■□□□ 1.14
TM7SF3-201ENST00000343028 MCM7P33993 719 aa22.15■■□□□ 1.14
TM7SF3-201ENST00000343028 PTGDRQ13258 359 aa22.15■■□□□ 1.14
TM7SF3-201ENST00000343028 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
TM7SF3-201ENST00000343028 INTS13Q9NVM9 706 aa22.15■■□□□ 1.14
TM7SF3-201ENST00000343028 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
TM7SF3-201ENST00000343028 FGRP09769 529 aa22.15■■□□□ 1.14
TM7SF3-201ENST00000343028 RCSD1Q6JBY9 416 aa22.15■■□□□ 1.14
TM7SF3-201ENST00000343028 NYAP1Q6ZVC0 841 aa22.15■■□□□ 1.14
TM7SF3-201ENST00000343028 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa22.15■■□□□ 1.14
TM7SF3-201ENST00000343028 MED15Q96RN5 788 aa22.15■■□□□ 1.14
TM7SF3-201ENST00000343028 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa22.15■■□□□ 1.14
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TM7SF3-201ENST00000343028 LDHBP07195 334 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
TM7SF3-201ENST00000343028 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
TM7SF3-201ENST00000343028 BTAF1O14981 1849 aa22.14■■□□□ 1.13
TM7SF3-201ENST00000343028 TRAPPC3LQ5T215 181 aa22.14■■□□□ 1.13
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TM7SF3-201ENST00000343028 TTC38Q5R3I4 469 aa22.13■■□□□ 1.13
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TM7SF3-201ENST00000343028 CCDC150Q8NCX0 1101 aa22.13■■□□□ 1.13
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TM7SF3-201ENST00000343028 DDAH1O94760 285 aa22.13■■□□□ 1.13
TM7SF3-201ENST00000343028 CALM1P0DP23 149 aa22.13■■□□□ 1.13
TM7SF3-201ENST00000343028 CALM2P0DP24 149 aa22.13■■□□□ 1.13
TM7SF3-201ENST00000343028 CALM3P0DP25 149 aa22.13■■□□□ 1.13
TM7SF3-201ENST00000343028 DMTNQ08495 405 aa22.13■■□□□ 1.13
TM7SF3-201ENST00000343028 CNBD1Q8NA66 436 aa22.13■■□□□ 1.13
TM7SF3-201ENST00000343028 MKNK2Q9HBH9 465 aa22.13■■□□□ 1.13
TM7SF3-201ENST00000343028 BRMS1Q9HCU9 246 aa22.13■■□□□ 1.13
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