RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000073208.5

H2-Q1-201, Transcript of Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene H2-Q1, Length 2,024 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Coa6Q8BGD8 79 aa6.62□□□□□ -1.35
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Spint4Q9D263 159 aa6.62□□□□□ -1.35
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Gm10318A0A1W2P728 225 aa6.6□□□□□ -1.35
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2310034C09RikQ9D746 214 aa6.6□□□□□ -1.35
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Gm11569B1AQB1 180 aa6.6□□□□□ -1.35
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Gm10337F7DEP7 55 aa6.6□□□□□ -1.35
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Krtap19-3Q925H6 87 aa6.6□□□□□ -1.35
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Krtap16-3Q8C1I6 86 aa6.59□□□□□ -1.35
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Krtap19-1Q925H2 87 aa6.59□□□□□ -1.36
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Atox1O08997 68 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Defb13Q8R2I4 64 aa6.57□□□□□ -1.36
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Chtf8P0CG14 533 aa6.55□□□□□ -1.36
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 H2al1bA0A087WP11 105 aa6.54□□□□□ -1.36
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 H2al1kJ3QP08 105 aa6.54□□□□□ -1.36
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 H2al1eQ810S6 105 aa6.54□□□□□ -1.36
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 H2al1mQ9DAD9 105 aa6.54□□□□□ -1.36
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 SspoQ8CG65 4998 aa6.52□□□□□ -1.37
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Defb38Q7TNV7 63 aa6.52□□□□□ -1.37
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Cdc42se1Q8BHL7 80 aa6.51□□□□□ -1.37
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Coa5Q99M07 74 aa6.5□□□□□ -1.37
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Rpl37Q9D823 97 aa6.48□□□□□ -1.37
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Krtap1-4Q3V2D6 188 aa6.47□□□□□ -1.37
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 1700042G07RikB1AUF7 90 aa6.45□□□□□ -1.38
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Gm10197F6QEY5 67 aa6.43□□□□□ -1.38
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Gm10160F6Y577 67 aa6.43□□□□□ -1.38
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2210017I01RikA0A0A6YVV1 95 aa6.42□□□□□ -1.38
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Gm26620Q9CY65 116 aa6.42□□□□□ -1.38
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Syne2Q6ZWQ0 6874 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Gm21798J3QNU5 87 aa6.4□□□□□ -1.39
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Gm10999F6Q4M4 69 aa6.34□□□□□ -1.39
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Sox16Q62247 57 aa6.33□□□□□ -1.4
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Lce1lQ9D1G7 135 aa6.33□□□□□ -1.4
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Q8BGJ3 129 aa6.31□□□□□ -1.4
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Phxr4P15974 95 aa6.3□□□□□ -1.4
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 4933415A04RikQ9D443 101 aa6.28□□□□□ -1.4
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Gm4491E0CX42 125 aa6.28□□□□□ -1.4
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2310079G19RikQ9D6L6 185 aa6.26□□□□□ -1.41
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Gm10643Q3URG9 111 aa6.24□□□□□ -1.41
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Fam229aB2KGE5 128 aa6.23□□□□□ -1.41
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Gm11596B1AQB0 205 aa6.21□□□□□ -1.41
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Gm20661K7N787 53 aa6.21□□□□□ -1.41
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Rnase13Q5GAM7 153 aa6.18□□□□□ -1.42
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Gm45618A0A1B0GSA0 219 aa6.18□□□□□ -1.42
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Defb1P56386 69 aa6.17□□□□□ -1.42
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Muc5bE9Q5I3 4800 aa6.16□□□□□ -1.42
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 4930507D05RikQ8C9C9 103 aa6.13□□□□□ -1.43
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Ndufb1P0DN34 57 aa6.09□□□□□ -1.43
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Krtap4-6Q3V4B7 195 aa6.09□□□□□ -1.43
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Mdn1A2ANY6 5589 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 SptssbQ925E8 76 aa6.06□□□□□ -1.44
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Krtap13-1Q8K198 168 aa6.04□□□□□ -1.44
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Limd2Q8BGB5 128 aa6.04□□□□□ -1.44
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Gm17416Q30KP4 66 aa6.03□□□□□ -1.44
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Sec61gP60060 68 aa6.02□□□□□ -1.45
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 B930094E09RikQ8C4T2 136 aa6.01□□□□□ -1.45
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Uqcr11Q9CPX8 56 aa6.01□□□□□ -1.45
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Lce1jD3YUU5 139 aa5.99□□□□□ -1.45
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Gm3646F6S692 53 aa5.99□□□□□ -1.45
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 9230102O04RikA2ASX7 82 aa5.95□□□□□ -1.46
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Krtap9-5A2A5X3 358 aa5.94□□□□□ -1.46
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Krtap19-2Q925I0 141 aa5.94□□□□□ -1.46
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Lce1hQ9D6R3 140 aa5.94□□□□□ -1.46
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Krtap1-5A2A590 122 aa5.93□□□□□ -1.46
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Cox6b2Q80ZN9 88 aa5.93□□□□□ -1.46
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Krtap31-2Q8CAY5 177 aa5.89□□□□□ -1.47
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Gm11564A2A4L9 201 aa5.86□□□□□ -1.47
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Gm11595B1AQA7 289 aa5.86□□□□□ -1.47
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Krtap4-8B1AQA8 209 aa5.86□□□□□ -1.47
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Krtap4-9B1AQA9 244 aa5.84□□□□□ -1.47
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Krtap3-1A2A591 98 aa5.82□□□□□ -1.48
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Gm39115A0A1B0GSH7 232 aa5.81□□□□□ -1.48
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Ndufs5Q99LY9 106 aa5.79□□□□□ -1.48
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Gm10382Q3V0T5 144 aa5.77□□□□□ -1.49
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Krtap12-1Q9Z287 130 aa5.75□□□□□ -1.49
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Gm17606F6ZL36 78 aa5.72□□□□□ -1.49
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Gm6358A0A087WPH4 74 aa5.71□□□□□ -1.5
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Gm11554B1AQB2 190 aa5.7□□□□□ -1.5
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Pla2g10Q9QXX3 151 aa5.67□□□□□ -1.5
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Fsip2A2ARZ3 6995 aa5.66□□□□□ -1.5
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Gm20537G3UYK7 97 aa5.65□□□□□ -1.51
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Prm2P07978 107 aa5.64□□□□□ -1.51
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Gm19426M0QWC7 77 aa5.6□□□□□ -1.51
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Gm9955Q8CEJ8 102 aa5.58□□□□□ -1.52
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Mt4P47945 62 aa5.56□□□□□ -1.52
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Gm29735A0A1B0GT06 219 aa5.55□□□□□ -1.52
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Krtap19-9aF8WH65 55 aa5.54□□□□□ -1.52
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Gm2431E9Q8S1 172 aa5.52□□□□□ -1.53
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Lce1bQ9D149 137 aa5.52□□□□□ -1.53
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 BC029722A0A0N4SW31 51 aa5.5□□□□□ -1.53
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Gm3880A0A1B0GSB3 72 aa5.49□□□□□ -1.53
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Lce1iQ9D6P5 149 aa5.48□□□□□ -1.53
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Krtap4-13Q9D7P3 165 aa5.48□□□□□ -1.53
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Krtap6-3A0A087WQL6 57 aa5.43□□□□□ -1.54
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Gm11567Q9D141 195 aa5.41□□□□□ -1.54
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Gm12216A0A1W2P827 62 aa5.38□□□□□ -1.55
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Lce1a2Q9D1K4 149 aa5.38□□□□□ -1.55
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Krtap9-3Q3V2C1 136 aa5.38□□□□□ -1.55
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Mt2P02798 61 aa5.35□□□□□ -1.55
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Lce1eQ9D139 143 aa5.35□□□□□ -1.55
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Lce1cQ9D1C5 147 aa5.34□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 61.1 ms