RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000073208.5

H2-Q1-201, Transcript of Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene H2-Q1, Length 2,024 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa28.64■■■□□ 2.18
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 NischQ80TM9 1593 aa28.15■■■□□ 2.1
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Abcc8B2RUS7 1588 aa27.34■■□□□ 1.97
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Abcc9P70170 1546 aa27.23■■□□□ 1.95
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 ScribQ80U72 1612 aa26.57■■□□□ 1.84
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 NacadQ5SWP3 1504 aa25.59■■□□□ 1.69
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Kdm5dQ62240 1548 aa25.59■■□□□ 1.69
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Sycp2Q9CUU3 1500 aa25.15■■□□□ 1.62
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Dcaf1Q80TR8 1506 aa25.04■■□□□ 1.6
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 BicraF8VPZ9 1578 aa24.91■■□□□ 1.58
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa24.74■■□□□ 1.55
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa24.5■■□□□ 1.51
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Baz1aO88379 1555 aa24.12■■□□□ 1.45
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Crybg2B7ZCC2 1516 aa24.04■■□□□ 1.44
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Rhox8Q6VSS7 320 aa24■■□□□ 1.43
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Ccdc180J3QNE4 1664 aa23.98■■□□□ 1.43
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa23.71■■□□□ 1.39
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Smarca2Q6DIC0 1577 aa23.61■■□□□ 1.37
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Ercc6F8VPZ5 1481 aa23.58■■□□□ 1.37
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa23.56■■□□□ 1.36
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa23.51■■□□□ 1.35
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Fam135aQ6NS59 1506 aa23.48■■□□□ 1.35
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Frmpd1A2AKB4 1549 aa23.37■■□□□ 1.33
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Wdr62Q3U3T8 1523 aa23.37■■□□□ 1.33
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Baz1bQ9Z277 1479 aa23.05■■□□□ 1.28
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Ubl4bQ9CQ84 188 aa23.04■■□□□ 1.28
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Unc13aQ4KUS2 1712 aa23.03■■□□□ 1.28
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Mrc2Q64449 1479 aa22.91■■□□□ 1.26
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 CftrP26361 1476 aa22.9■■□□□ 1.26
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Synj1Q8CHC4 1574 aa22.83■■□□□ 1.25
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa22.8■■□□□ 1.24
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Rtl1Q7M732 1744 aa22.65■■□□□ 1.22
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa22.59■■□□□ 1.21
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Dnajc5P60904 198 aa22.51■■□□□ 1.19
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Trim41Q5NCC3 630 aa22.5■■□□□ 1.19
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa22.46■■□□□ 1.19
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Cux2P70298 1426 aa22.45■■□□□ 1.18
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Kif15Q6P9L6 1387 aa22.39■■□□□ 1.17
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Kif21aQ9QXL2 1672 aa22.35■■□□□ 1.17
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Lamc3Q9R0B6 1581 aa22.26■■□□□ 1.15
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Cep164Q5DU05 1446 aa22.03■■□□□ 1.12
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Shroom2A2ALU4 1481 aa22■■□□□ 1.11
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Plb1Q3TTY0 1478 aa21.97■■□□□ 1.11
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 TnnQ80Z71 1560 aa21.94■■□□□ 1.1
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Il27Q8K3I6 234 aa21.9■■□□□ 1.1
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Top2bQ64511 1612 aa21.86■■□□□ 1.09
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Ccdc18Q640L5 1455 aa21.85■■□□□ 1.09
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Camsap1A2AHC3 1581 aa21.84■■□□□ 1.09
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Golga3P55937 1487 aa21.82■■□□□ 1.08
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Crocc2F6XLV1 1638 aa21.81■■□□□ 1.08
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Col17a1Q07563 1470 aa21.8■■□□□ 1.08
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Cngb1E1AZ71 1325 aa21.71■■□□□ 1.07
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Rusc2Q80U22 1514 aa21.69■■□□□ 1.06
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Ift140E9PY46 1464 aa21.67■■□□□ 1.06
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Duox2A2AQ99 1517 aa21.61■■□□□ 1.05
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Fmn1Q05860 1466 aa21.6■■□□□ 1.05
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Disp1Q3TDN0 1521 aa21.58■■□□□ 1.04
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Grin2bQ01097 1482 aa21.52■■□□□ 1.04
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Samd9lQ69Z37 1561 aa21.47■■□□□ 1.03
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Setd1bQ8CFT2 1985 aa21.47■■□□□ 1.03
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa21.37■■□□□ 1.01
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Efcab5A0JP43 1406 aa21.36■■□□□ 1.01
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Rad54l2Q99NG0 1466 aa21.35■■□□□ 1.01
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Magi3Q9EQJ9 1476 aa21.3■■□□□ 1
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Grin2aP35436 1464 aa21.27■■□□□ 1
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa21.26■□□□□ 0.99
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Adgrl3Q80TS3 1537 aa21.22■□□□□ 0.99
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Fgd6Q69ZL1 1399 aa21.21■□□□□ 0.99
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa21.2■□□□□ 0.98
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 PtprkP35822 1457 aa21.18■□□□□ 0.98
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 NrkQ9R0G8 1455 aa21.18■□□□□ 0.98
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Cep170Q6A065 1588 aa21.17■□□□□ 0.98
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa21.16■□□□□ 0.98
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Gm156Q58A37 223 aa21.14■□□□□ 0.98
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Pla2r1Q62028 1487 aa21.14■□□□□ 0.97
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa21.12■□□□□ 0.97
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Gpatch8A2A6A1 1505 aa21.09■□□□□ 0.97
H2-Q1-201ENSMUST00000073208 Chic1Q8CBW7 227 aa21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 39.3 ms