RNA–Protein interactions for RNA: YOL093W

TRM10, Transcript of tRNA methyltransferase, yeast

Gene TRM10, Length 882 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRM10	YOL093W	ERG11	P10614	530 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TRM10	YOL093W	PUT4	P15380	627 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TRM10	YOL093W	SPO16	P17122	198 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TRM10	YOL093W	RPO26	P20435	155 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TRM10	YOL093W	PET112	P33893	541 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TRM10	YOL093W	RPC37	P36121	282 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TRM10	YOL093W	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
TRM10	YOL093W	PCA1	P38360	1216 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TRM10	YOL093W	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
TRM10	YOL093W	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
TRM10	YOL093W	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
TRM10	YOL093W	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
TRM10	YOL093W	SNZ3	P43545	298 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TRM10	YOL093W	BRO1	P48582	844 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TRM10	YOL093W	YML6	P51998	286 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TRM10	YOL093W	SNZ2	P53824	298 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TRM10	YOL093W	RNT1	Q02555	471 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TRM10	YOL093W	MUB1	Q03162	620 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TRM10	YOL093W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
TRM10	YOL093W	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
TRM10	YOL093W	VTI1	Q04338	217 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TRM10	YOL093W	YDR222W	Q04925	415 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TRM10	YOL093W	AIM39	Q08223	395 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TRM10	YOL093W	NUR1	Q12066	484 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TRM10	YOL093W	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
TRM10	YOL093W	VPS5	Q92331	675 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TRM10	YOL093W	CHS1	P08004	1131 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	CIT2	P08679	460 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	KAR3	P17119	729 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	SNF5	P18480	905 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	AEP2	P22136	580 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	FRE1	P32791	686 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	RPL22B	P56628	122 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	GCN5	Q03330	439 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	URH1	Q04179	340 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	UFO1	Q04511	668 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	ECI1	Q05871	280 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	CDD1	Q06549	142 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	THI20	Q08224	551 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	NBP2	Q12163	236 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	MLS1	P30952	554 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	MRP4	P32902	394 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	TKL2	P33315	681 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	SRB2	P34162	210 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	HMT1	P38074	348 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	SWC5	P38326	303 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	LYS9	P38999	446 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	JHD1	P40034	492 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	TMN3	P40071	706 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	DSE1	P40077	573 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	HLJ1	P48353	224 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	STB4	P50104	949 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	MET13	P53128	600 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	GYL1	Q04322	720 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	PRM6	Q04705	352 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	SIL1	Q08199	421 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	THI21	Q08975	551 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	GPM2	Q12008	311 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	YLR422W	Q06409	1932 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	MAS1	P10507	462 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	CDC34	P14682	295 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	HCM1	P25364	564 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	ADK2	P26364	225 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	LTV1	P34078	463 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	AGP2	P38090	596 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	SLX1	P38324	304 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	POP4	P38336	279 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	END3	P39013	349 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	KHA1	P40309	873 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	RAD26	P40352	1085 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	GUF1	P46943	645 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	PFD1	P46988	109 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	VPS25	P47142	202 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	PEX31	P53203	462 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	ADA2	Q02336	434 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	TAF9	Q05027	157 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	AAD4	Q07747	329 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	TPO1	Q07824	586 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	GNT1	Q12096	491 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	EMP46	Q12396	444 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	BI2	P03873	423 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	BI4	P03879	638 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	TPK1	P06244	397 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TRM10	YOL093W	POL3	P15436	1097 aa		5.05	□□□□□ -1.6

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 109.4 ms