RNA–Protein interactions for RNA: YMR017W

SPO20, Transcript of Meiosis-specific subunit of the t-SNARE complex, yeast

Gene SPO20, Length 1,194 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPO20	YMR017W	CIR1	P42940	261 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SPO20	YMR017W	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
SPO20	YMR017W	STP3	Q05937	343 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SPO20	YMR017W	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
SPO20	YMR017W	YPL191C	Q08930	360 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SPO20	YMR017W	RTC1	Q08281	1341 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SPO20	YMR017W	BI2	P03873	423 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SPO20	YMR017W	MBR1	P23493	339 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SPO20	YMR017W	XRS2	P33301	854 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SPO20	YMR017W	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
SPO20	YMR017W	EXO84	P38261	753 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SPO20	YMR017W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
SPO20	YMR017W	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
SPO20	YMR017W	ATP23	P53722	227 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SPO20	YMR017W	THI7	Q05998	598 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SPO20	YMR017W	BSP1	Q06604	576 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SPO20	YMR017W	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
SPO20	YMR017W	VAM6	Q07468	1049 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SPO20	YMR017W	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
SPO20	YMR017W	SSM4	P40318	1319 aa		5	□□□□□ -1.61
SPO20	YMR017W	COX1	P00401	534 aa		5	□□□□□ -1.61
SPO20	YMR017W	NUP1	P20676	1076 aa		5	□□□□□ -1.61
SPO20	YMR017W	RAD16	P31244	790 aa		5	□□□□□ -1.61
SPO20	YMR017W	BEM3	P32873	1128 aa		5	□□□□□ -1.61
SPO20	YMR017W	PSY4	P38193	441 aa		5	□□□□□ -1.61
SPO20	YMR017W	BUD16	P39988	312 aa		5	□□□□□ -1.61
SPO20	YMR017W	YAT1	P80235	687 aa		5	□□□□□ -1.61
SPO20	YMR017W	TFC6	Q06339	672 aa		5	□□□□□ -1.61
SPO20	YMR017W	RAD34	Q06665	692 aa		5	□□□□□ -1.61
SPO20	YMR017W	IRC3	Q06683	689 aa		5	□□□□□ -1.61
SPO20	YMR017W	COX17	Q12287	69 aa		5	□□□□□ -1.61
SPO20	YMR017W	TPK1	P06244	397 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPO20	YMR017W	LAC1	P28496	418 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPO20	YMR017W	NUP120	P35729	1037 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPO20	YMR017W	UBX6	P47049	396 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPO20	YMR017W	CTF18	P49956	741 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPO20	YMR017W	YPL071C	Q02864	156 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPO20	YMR017W	ORM2	Q06144	216 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPO20	YMR017W	YLR111W	Q12528	110 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPO20	YMR017W	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SPO20	YMR017W	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SPO20	YMR017W	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SPO20	YMR017W	APN1	P22936	367 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPO20	YMR017W	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SPO20	YMR017W	DPB3	P27344	201 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPO20	YMR017W	HES1	P35843	434 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPO20	YMR017W	FTH1	P38310	465 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPO20	YMR017W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SPO20	YMR017W	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SPO20	YMR017W	YNL058C	P53947	316 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPO20	YMR017W	RIM13	Q03792	727 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPO20	YMR017W	SEG1	Q04279	960 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPO20	YMR017W	YOR389W	Q08912	624 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPO20	YMR017W	FRE7	Q12333	620 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPO20	YMR017W	PCD1	Q12524	340 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPO20	YMR017W	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SPO20	YMR017W	IML2	P47031	731 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPO20	YMR017W	BNA1	P47096	177 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPO20	YMR017W	COG1	P53079	417 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPO20	YMR017W	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SPO20	YMR017W	YML131W	Q03102	365 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPO20	YMR017W	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SPO20	YMR017W	TPO3	Q06451	622 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPO20	YMR017W	ATG23	Q06671	453 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPO20	YMR017W	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SPO20	YMR017W	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPO20	YMR017W	YML003W	P0CF16	290 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPO20	YMR017W	TY2A-F	P0CX61	438 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPO20	YMR017W	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPO20	YMR017W	SPO16	P17122	198 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPO20	YMR017W	TY2A-C	P25383	438 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPO20	YMR017W	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SPO20	YMR017W	GSH1	P32477	678 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPO20	YMR017W	DJP1	P40564	432 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPO20	YMR017W	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SPO20	YMR017W	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPO20	YMR017W	YDR109C	Q04585	715 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPO20	YMR017W	SWT1	Q12104	458 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPO20	YMR017W	TY2A-B	Q12260	438 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPO20	YMR017W	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPO20	YMR017W	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPO20	YMR017W	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPO20	YMR017W	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPO20	YMR017W	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SPO20	YMR017W	MAK32	P23060	363 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPO20	YMR017W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SPO20	YMR017W	PTC6	P25646	442 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPO20	YMR017W	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SPO20	YMR017W	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SPO20	YMR017W	UME6	P39001	836 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPO20	YMR017W	UBP7	P40453	1071 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPO20	YMR017W	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SPO20	YMR017W	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SPO20	YMR017W	VID22	Q05934	901 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPO20	YMR017W	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SPO20	YMR017W	BAG7	Q12128	409 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPO20	YMR017W	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SPO20	YMR017W	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.94	□□□□□ -1.62	not detected
SPO20	YMR017W	SLC1	P33333	303 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPO20	YMR017W	GEX2	P36173	615 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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