RNA–Protein interactions for RNA: YML013W

UBX2, Transcript of Bridging factor involved in ER-associated protein degradation (ERAD), yeast

Gene UBX2, Length 1,755 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UBX2	YML013W	TGL1	P34163	548 aa		5.67	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	UBP13	P38187	747 aa		5.67	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	EFM2	P38347	419 aa		5.67	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	RTS1	P38903	757 aa		5.67	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	PNT1	P38969	423 aa		5.67	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	SSN3	P39073	555 aa		5.67	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	YEL025C	P39991	1188 aa		5.67	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	SKP2	P42843	763 aa		5.67	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	VIK1	Q12045	647 aa		5.67	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	PSF3	Q12146	194 aa		5.67	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	YPR089W	O13585	888 aa		5.67	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	PHO5	P00635	467 aa		5.67	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	ITR2	P30606	609 aa		5.67	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	SIN4	P32259	974 aa		5.67	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	VPH2	P32341	215 aa		5.67	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	HIR2	P32480	875 aa		5.67	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	MDL2	P33311	773 aa		5.67	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	PXL1	P36166	706 aa		5.67	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	YHR131C	P38835	850 aa		5.67	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.67	□□□□□ -1.5	not detected
UBX2	YML013W	STL1	P39932	569 aa		5.67	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	EFM4	P40516	257 aa		5.67	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	SLS1	P42900	643 aa		5.67	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	STB2	P46679	850 aa		5.67	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	HOP2	P53187	214 aa		5.67	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	ERG5	P54781	538 aa		5.67	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	RKM2	Q03942	479 aa		5.67	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	RSM24	Q03976	319 aa		5.67	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	AIM32	Q04689	311 aa		5.67	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	FUS2	Q05670	677 aa		5.67	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	TAF10	Q12030	206 aa		5.67	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	FUS1	P11710	512 aa		5.66	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	RSR1	P13856	272 aa		5.66	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	HNM1	P19807	563 aa		5.66	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	SED4	P25365	1065 aa		5.66	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	MRE11	P32829	692 aa		5.66	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	UIP5	P36137	443 aa		5.66	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	YBR062C	P38239	180 aa		5.66	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	PIK1	P39104	1066 aa		5.66	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	SWD1	P39706	426 aa		5.66	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	MSN5	P52918	1224 aa		5.66	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	SGF73	P53165	657 aa		5.66	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	BSC5	P53755	489 aa		5.66	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	YPL107W	Q02873	248 aa		5.66	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	PPM1	Q04081	328 aa		5.66	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	ATG17	Q06410	417 aa		5.66	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	HMI1	Q12039	706 aa		5.66	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	PTC5	Q12511	572 aa		5.66	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	HIS3	P06633	220 aa		5.65	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	5.65	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	ADK2	P26364	225 aa		5.65	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	MGM1	P32266	881 aa		5.65	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	RPC34	P32910	317 aa		5.65	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	MRT4	P33201	236 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	SLA2	P33338	968 aa		5.65	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	MEF2	P39677	819 aa		5.65	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	MET18	P40469	1032 aa		5.65	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	SKP1	P52286	194 aa		5.65	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	PPT1	P53043	513 aa		5.65	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	YGR266W	P53326	701 aa		5.65	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	5.65	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	EOS1	P53938	366 aa		5.65	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	OAZ1	Q02803	292 aa		5.65	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	TAF9	Q05027	157 aa		5.65	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	PIG1	Q06216	648 aa		5.65	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	PHO92	Q06390	306 aa		5.65	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	NSE1	Q07913	336 aa		5.65	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	YIG1	Q08956	461 aa		5.65	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	ZRT2	Q12436	422 aa		5.65	□□□□□ -1.5
UBX2	YML013W	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.51
UBX2	YML013W	CKI1	P20485	582 aa		5.65	□□□□□ -1.51
UBX2	YML013W	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.51
UBX2	YML013W	RAD57	P25301	460 aa		5.65	□□□□□ -1.51
UBX2	YML013W	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.65	□□□□□ -1.51	not detected
UBX2	YML013W	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.51
UBX2	YML013W	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.51
UBX2	YML013W	YBR242W	P38331	238 aa		5.65	□□□□□ -1.51
UBX2	YML013W	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.51
UBX2	YML013W	VMA22	P38784	181 aa		5.65	□□□□□ -1.51
UBX2	YML013W	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.51

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