RNA–Protein interactions for RNA: YHR065C

RRP3, Transcript of Protein involved in rRNA processing, yeast

Gene RRP3, Length 1,506 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRP3	YHR065C	CCL1	P37366	393 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	HMT1	P38074	348 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	ASG7	P46993	209 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	YJL045W	P47052	634 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	EAR1	Q03212	550 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	THI20	Q08224	551 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	THI21	Q08975	551 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	GPM2	Q12008	311 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	YVC1	Q12324	675 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	DFG16	Q99234	619 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	SEY1	Q99287	776 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	CIT2	P08679	460 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	MSH1	P25846	959 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	CAB3	P36076	571 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	YBR284W	P38150	797 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	not detected
RRP3	YHR065C	APN2	P38207	520 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	RGD1	P38339	666 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	FLC2	P39719	783 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	OPT1	P40897	799 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	SLS1	P42900	643 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	TAF1	P46677	1066 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	PEX31	P53203	462 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	SHR3	Q02774	210 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	OMS1	Q06668	471 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	NBP2	Q12163	236 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	ADK2	P26364	225 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	PEP7	P32609	515 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	HSP78	P33416	811 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	HSL7	P38274	827 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	NEM1	P38757	446 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	SAW1	P39735	261 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	SMX2	P40204	77 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	BFA1	P47113	574 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	YJR079W	P47126	109 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	RFX1	P48743	811 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	ORC3	P54790	616 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	ADA2	Q02336	434 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	RKM2	Q03942	479 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	SND1	Q04007	877 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	TPO1	Q07824	586 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	ACM1	Q08981	209 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	AVL9	Q12500	764 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	APM4	Q99186	491 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	IZH4	Q99393	312 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	YLR422W	Q06409	1932 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	QCR6	P00127	147 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	HEM15	P16622	393 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	CBF1	P17106	351 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	DUG2	P38149	878 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	YBR053C	P38235	358 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	PPX1	P38698	397 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	MSR1	P38714	643 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	PEX7	P39108	375 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	AVT2	P39981	480 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	MND2	P40577	368 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	GUF1	P46943	645 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	SAE2	P46946	345 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	VPS25	P47142	202 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	COG6	P53959	839 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	YMR027W	Q04371	470 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	AIM32	Q04689	311 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	SFH1	Q06168	426 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected
RRP3	YHR065C	DDC1	Q08949	612 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	YLL056C	Q12177	298 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	RRD2	Q12461	358 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	IMA3	P0CW40	589 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	IMA4	P0CW41	589 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	POL3	P15436	1097 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	MRPL25	P23369	157 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	YCR015C	P25616	317 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	GPI10	P30777	616 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	RAD5	P32849	1169 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	OAF3	P36023	863 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	AIM18	P38884	321 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	FHL1	P39521	936 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	YAR028W	P39548	234 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	PRM9	P39551	298 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	CDC1	P40986	491 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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