RNA–Protein interactions for RNA: YHR064C

SSZ1, Transcript of Hsp70 protein that interacts with Zuo1p (a DnaJ homolog), yeastyeast

Gene SSZ1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSZ1YHR064C RME1P32338 300 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
SSZ1YHR064C PHA2P32452 334 aa5.41□□□□□ -1.54
SSZ1YHR064C PEX5P35056 612 aa5.41□□□□□ -1.54
SSZ1YHR064C RRN3P36070 627 aa5.41□□□□□ -1.54
SSZ1YHR064C MMS4P38257 691 aa5.41□□□□□ -1.54
SSZ1YHR064C PHO89P38361 574 aa5.41□□□□□ -1.54
SSZ1YHR064C GOS1P38736 223 aa5.41□□□□□ -1.54
SSZ1YHR064C CRP1P38845 465 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
SSZ1YHR064C LYS9P38999 446 aa5.41□□□□□ -1.54
SSZ1YHR064C NPT1P39683 429 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
SSZ1YHR064C UBP7P40453 1071 aa5.41□□□□□ -1.54
SSZ1YHR064C RRN7P40992 514 aa5.41□□□□□ -1.54
SSZ1YHR064C IML2P47031 731 aa5.41□□□□□ -1.54
SSZ1YHR064C EMC2P47133 292 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
SSZ1YHR064C RFX1P48743 811 aa5.41□□□□□ -1.54
SSZ1YHR064C RSM24Q03976 319 aa5.41□□□□□ -1.54
SSZ1YHR064C YMR226CQ05016 267 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
SSZ1YHR064C TPO1Q07824 586 aa5.41□□□□□ -1.54
SSZ1YHR064C AAD15Q08361 143 aa5.41□□□□□ -1.54
SSZ1YHR064C HOS1Q12214 470 aa5.41□□□□□ -1.54
SSZ1YHR064C HSH49Q99181 213 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
SSZ1YHR064C NHA1Q99271 985 aa5.41□□□□□ -1.54
SSZ1YHR064C ERR1P0CX10 437 aa5.41□□□□□ -1.54
SSZ1YHR064C ERR2P0CX11 437 aa5.41□□□□□ -1.54
SSZ1YHR064C ZIP1P31111 875 aa5.41□□□□□ -1.54
SSZ1YHR064C RPN2P32565 945 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
SSZ1YHR064C YBL086CP38177 466 aa5.41□□□□□ -1.54
SSZ1YHR064C ARN1P38731 627 aa5.41□□□□□ -1.54
SSZ1YHR064C ETP1P38748 585 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
SSZ1YHR064C EAF5P39995 279 aa5.41□□□□□ -1.54
SSZ1YHR064C SEC28P40509 296 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
SSZ1YHR064C ERR3P42222 437 aa5.41□□□□□ -1.54
SSZ1YHR064C AGP3P43548 558 aa5.41□□□□□ -1.54
SSZ1YHR064C YJR107WP47145 328 aa5.41□□□□□ -1.54
SSZ1YHR064C SFB2P53953 876 aa5.41□□□□□ -1.54
SSZ1YHR064C YPL062WQ02781 134 aa5.41□□□□□ -1.54
SSZ1YHR064C YMR209CQ03648 457 aa5.41□□□□□ -1.54
SSZ1YHR064C CLU1Q03690 1277 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
SSZ1YHR064C YET2Q04210 160 aa5.41□□□□□ -1.54
SSZ1YHR064C KRE28Q04431 385 aa5.41□□□□□ -1.54
SSZ1YHR064C DYN3Q04949 312 aa5.41□□□□□ -1.54
SSZ1YHR064C GGA1Q06336 557 aa5.41□□□□□ -1.54
SSZ1YHR064C YPR084WQ06821 456 aa5.41□□□□□ -1.54
SSZ1YHR064C YDL073WQ07454 984 aa5.41□□□□□ -1.54
SSZ1YHR064C YDL114WQ07530 308 aa5.41□□□□□ -1.54
SSZ1YHR064C GYP1Q08484 637 aa5.41□□□□□ -1.54
SSZ1YHR064C SEM1O94742 89 aa5.4□□□□□ -1.55
SSZ1YHR064C COR1P07256 457 aa5.4□□□□□ -1.55
SSZ1YHR064C ASP3-2P0CX77 362 aa5.4□□□□□ -1.55
SSZ1YHR064C ASP3-3P0CX78 362 aa5.4□□□□□ -1.55
SSZ1YHR064C ASP3-4P0CX79 362 aa5.4□□□□□ -1.55
SSZ1YHR064C ASP3-1P0CZ17 362 aa5.4□□□□□ -1.55
SSZ1YHR064C HSC82P15108 705 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.55
SSZ1YHR064C FAR1P21268 830 aa5.4□□□□□ -1.55
SSZ1YHR064C VPS34P22543 875 aa5.4□□□□□ -1.55
SSZ1YHR064C CSM1P25651 190 aa5.4□□□□□ -1.55
SSZ1YHR064C MET4P32389 672 aa5.4□□□□□ -1.55
SSZ1YHR064C RPT5P33297 434 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.55
SSZ1YHR064C WHI3P34761 661 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.55
SSZ1YHR064C GGA2P38817 585 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.55
SSZ1YHR064C IRR1P40541 1150 aa5.4□□□□□ -1.55
SSZ1YHR064C SPR3P41901 512 aa5.4□□□□□ -1.55
SSZ1YHR064C IRC5P43610 853 aa5.4□□□□□ -1.55
SSZ1YHR064C ZAP1P47043 880 aa5.4□□□□□ -1.55
SSZ1YHR064C CCT8P47079 568 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.55
SSZ1YHR064C ISM1P48526 1002 aa5.4□□□□□ -1.55
SSZ1YHR064C KXD1P53158 218 aa5.4□□□□□ -1.55
SSZ1YHR064C GET1P53192 235 aa5.4□□□□□ -1.55
SSZ1YHR064C ORM1P53224 222 aa5.4□□□□□ -1.55
SSZ1YHR064C CUS2P53830 285 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.55
SSZ1YHR064C YAF9P53930 226 aa5.4□□□□□ -1.55
SSZ1YHR064C KIN4Q01919 800 aa5.4□□□□□ -1.55
SSZ1YHR064C NAN1Q02931 896 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.55
SSZ1YHR064C AGE1Q04412 482 aa5.4□□□□□ -1.55
SSZ1YHR064C SSQ1Q05931 657 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.55
SSZ1YHR064C DUS3Q06053 668 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.55
SSZ1YHR064C UBX5Q06682 500 aa5.4□□□□□ -1.55
SSZ1YHR064C CBC2Q08920 208 aaKnown RBP RIP-Chip data5.4□□□□□ -1.55not detected
SSZ1YHR064C NSL1Q12143 216 aa5.4□□□□□ -1.55
SSZ1YHR064C FRT1Q99332 602 aa5.4□□□□□ -1.55
SSZ1YHR064C ATP6P00854 259 aa5.39□□□□□ -1.55
SSZ1YHR064C RHO2P06781 192 aa5.39□□□□□ -1.55
SSZ1YHR064C SNF4P12904 322 aa5.39□□□□□ -1.55
SSZ1YHR064C TKL1P23254 680 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
SSZ1YHR064C BUD23P25627 275 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
SSZ1YHR064C AEP1P32493 518 aa5.39□□□□□ -1.55
SSZ1YHR064C ATO2P32907 282 aa5.39□□□□□ -1.55
SSZ1YHR064C BUD2P33314 1104 aa5.39□□□□□ -1.55
SSZ1YHR064C MDJ1P35191 511 aa5.39□□□□□ -1.55
SSZ1YHR064C APN2P38207 520 aa5.39□□□□□ -1.55
SSZ1YHR064C ATG12P38316 186 aa5.39□□□□□ -1.55
SSZ1YHR064C SEC31P38968 1273 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
SSZ1YHR064C PCF11P39081 626 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
SSZ1YHR064C FAA2P39518 744 aa5.39□□□□□ -1.55
SSZ1YHR064C SIT1P39980 628 aa5.39□□□□□ -1.55
SSZ1YHR064C VHR1P40522 640 aa5.39□□□□□ -1.55
SSZ1YHR064C YRB1P41920 201 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
SSZ1YHR064C YJL132WP47014 750 aa5.39□□□□□ -1.55
SSZ1YHR064C JJJ3P47138 172 aa5.39□□□□□ -1.55
SSZ1YHR064C SLD5Q03406 294 aa5.39□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 10 ms