RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000026474.4

Gli1-201, Transcript of Zinc finger protein GLI1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gli1, Length 4,057 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1-201ENSMUST00000026474 Tpm3-rs7D3Z2H9 248 aa16.64■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Sp8Q8BMJ8 486 aa16.64■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 1700018B08RikQ9DA83 213 aa16.64■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 C4bP01029 1738 aa16.64■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Pcsk7Q61139 770 aa16.64■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Senp6Q6P7W0 1132 aa16.64■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Arhgef6Q8K4I3 771 aa16.64■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Gpr108Q91WD0 569 aa16.64■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Flvcr1B2RXV4 560 aa16.64■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 CnpP16330 420 aa16.64■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Kif1bpQ6ZPU9 617 aa16.64■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Dusp9Q7TNL7 452 aa16.64■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Trmt2aQ8BNV1 574 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Slc18a1Q8R090 521 aa16.64■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Mrps25Q9D125 171 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 MthfslL7N466 203 aa16.63■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Eef2kO08796 724 aa16.63■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 LdhaP06151 332 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Gadd45bP22339 160 aa16.63■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Txnrd3Q99MD6 652 aa16.63■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Rnf123Q5XPI3 1314 aa16.63■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Sept2P42208 361 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Armc2Q3URY6 854 aa16.63■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Cyp26c1B2RXA7 518 aa16.63■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Gtpbp6Q3U6U5 514 aa16.63■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Tmc4Q7TQ65 694 aa16.63■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Samm50Q8BGH2 469 aa16.63■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Vps53Q8CCB4 832 aa16.63■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Tmem47Q9JJG6 181 aa16.63■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Jag1Q9QXX0 1218 aa16.63■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Aox1O54754 1333 aa16.63■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 LrmpQ60664 539 aa16.62■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 WaplQ65Z40 1200 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Gpcpd1Q8C0L9 675 aa16.62■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Nup88Q8CEC0 753 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 CerkQ8K4Q7 531 aa16.62■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Myh4Q5SX39 1939 aa16.62■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Gm36210A0A1B0GS00 229 aa16.62■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 A430078G23RikE9Q7Y4 484 aa16.62■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Ftl1P29391 183 aa16.62■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Ttll1Q91V51 423 aa16.62■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Mex3cQ05A36 652 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Kctd1Q5M956 257 aa16.62■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Igf2bp2Q5SF07 592 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Prpf4bQ61136 1007 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Srgap1Q91Z69 1062 aa16.62■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Glipr1l2Q9CQ35 332 aa16.62■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Vil1Q62468 827 aa16.61■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Tor1aip2Q8BYU6 502 aa16.61■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Dcdc2bF7BCK0 340 aa16.61■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Kif4P33174 1231 aa16.61■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Foxp1P58462 705 aa16.61■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Leo1Q5XJE5 667 aa16.61■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Bst2Q8R2Q8 172 aa16.61■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Mical1Q8VDP3 1048 aa16.61■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Iqca1Q9CUL5 857 aa16.61■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Hip1rQ9JKY5 1068 aa16.61■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Kif3aP28741 701 aa16.6■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Map3k9Q3U1V8 1077 aa16.6■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Tbc1d9bQ5SVR0 1263 aa16.6■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Lrrcc1Q69ZB0 1026 aa16.6■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Usp33Q8R5K2 909 aa16.6■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Tfap4Q9JIZ5 338 aa16.6■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Znf653Q6YND2 615 aa16.6■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Gripap1Q8VD04 806 aa16.6■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 VmacQ8BP01 174 aa16.6■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Znf609Q8BZ47 1413 aa16.6■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 TrdnE9Q9K5 693 aa16.6■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Sipa1l3G3X9J0 1776 aa16.6■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Scg2Q03517 617 aa16.6■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Psmd1Q3TXS7 953 aa16.6■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Ube2oQ6ZPJ3 1288 aa16.6■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 SltmQ8CH25 1031 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Fez1Q8K0X8 392 aa16.6■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Gpaa1Q9WTK3 621 aa16.6■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 CfhP06909 1234 aa16.59■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Wnt10bP48614 389 aa16.59■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Tmed8Q3UHI4 326 aa16.59■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Mapk4Q6P5G0 583 aa16.59■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Trex1Q91XB0 314 aa16.59■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Borcs6Q9D6W8 360 aa16.59■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Cep63Q3UPP8 700 aa16.59■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Ppp2r5bQ6PD28 497 aa16.59■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Tmem59lQ7TNI2 337 aa16.59■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Hook1Q8BIL5 728 aa16.59■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Riox2Q8CD15 465 aa16.59■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Esyt1Q3U7R1 1092 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Pls1Q3V0K9 630 aa16.59■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Prkab1Q9R078 270 aa16.58■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Stk39Q9Z1W9 556 aa16.58■□□□□ 0.25
Gli1-201ENSMUST00000026474 Rps12P63323 132 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
Gli1-201ENSMUST00000026474 Oog3Q3UWY1 500 aa16.58■□□□□ 0.24
Gli1-201ENSMUST00000026474 Prr7Q3V0I2 269 aa16.58■□□□□ 0.24
Gli1-201ENSMUST00000026474 Stxbp2Q64324 593 aa16.58■□□□□ 0.24
Gli1-201ENSMUST00000026474 Vmn1r199Q8R280 367 aa16.58■□□□□ 0.24
Gli1-201ENSMUST00000026474 Scnn1aQ61180 699 aa16.58■□□□□ 0.24
Gli1-201ENSMUST00000026474 Shtn1Q8K2Q9 631 aa16.58■□□□□ 0.24
Gli1-201ENSMUST00000026474 Trim11Q99PQ2 467 aa16.58■□□□□ 0.24
Gli1-201ENSMUST00000026474 Acot3Q9QYR7 432 aa16.58■□□□□ 0.24
Gli1-201ENSMUST00000026474 Greb1lB9EJV3 1913 aa16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 16.1 ms