Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPU9

Kif1bp, KIF1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif1bpQ6ZPU9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC43.13■■■■■ 4.49
Kif1bpQ6ZPU9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
Kif1bpQ6ZPU9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
Kif1bpQ6ZPU9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
Kif1bpQ6ZPU9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Kif1bpQ6ZPU9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38.18■■■■□ 3.7
Kif1bpQ6ZPU9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
Kif1bpQ6ZPU9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
Kif1bpQ6ZPU9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
Kif1bpQ6ZPU9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Kif1bpQ6ZPU9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Kif1bpQ6ZPU9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
Kif1bpQ6ZPU9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Kif1bpQ6ZPU9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
Kif1bpQ6ZPU9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Kif1bpQ6ZPU9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
Kif1bpQ6ZPU9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
Kif1bpQ6ZPU9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Kif1bpQ6ZPU9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Kif1bpQ6ZPU9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Kif1bpQ6ZPU9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Kif1bpQ6ZPU9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Kif1bpQ6ZPU9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Kif1bpQ6ZPU9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Kif1bpQ6ZPU9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Kif1bpQ6ZPU9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
Kif1bpQ6ZPU9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Kif1bpQ6ZPU9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Kif1bpQ6ZPU9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Kif1bpQ6ZPU9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Kif1bpQ6ZPU9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Kif1bpQ6ZPU9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
Kif1bpQ6ZPU9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
Kif1bpQ6ZPU9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Kif1bpQ6ZPU9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Kif1bpQ6ZPU9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Kif1bpQ6ZPU9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Kif1bpQ6ZPU9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Kif1bpQ6ZPU9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Kif1bpQ6ZPU9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Kif1bpQ6ZPU9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Kif1bpQ6ZPU9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Kif1bpQ6ZPU9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Kif1bpQ6ZPU9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Kif1bpQ6ZPU9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Kif1bpQ6ZPU9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Kif1bpQ6ZPU9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Kif1bpQ6ZPU9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Kif1bpQ6ZPU9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Kif1bpQ6ZPU9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Kif1bpQ6ZPU9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Kif1bpQ6ZPU9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Kif1bpQ6ZPU9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Kif1bpQ6ZPU9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Kif1bpQ6ZPU9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Kif1bpQ6ZPU9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Kif1bpQ6ZPU9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Kif1bpQ6ZPU9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Kif1bpQ6ZPU9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Kif1bpQ6ZPU9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Kif1bpQ6ZPU9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Kif1bpQ6ZPU9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Kif1bpQ6ZPU9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Kif1bpQ6ZPU9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Kif1bpQ6ZPU9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Kif1bpQ6ZPU9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Kif1bpQ6ZPU9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Kif1bpQ6ZPU9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
Kif1bpQ6ZPU9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Kif1bpQ6ZPU9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Kif1bpQ6ZPU9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Kif1bpQ6ZPU9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Kif1bpQ6ZPU9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Kif1bpQ6ZPU9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Kif1bpQ6ZPU9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Kif1bpQ6ZPU9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Kif1bpQ6ZPU9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Kif1bpQ6ZPU9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Kif1bpQ6ZPU9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Kif1bpQ6ZPU9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Kif1bpQ6ZPU9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Kif1bpQ6ZPU9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Kif1bpQ6ZPU9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Kif1bpQ6ZPU9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Kif1bpQ6ZPU9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
Kif1bpQ6ZPU9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Kif1bpQ6ZPU9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Kif1bpQ6ZPU9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Kif1bpQ6ZPU9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Kif1bpQ6ZPU9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Kif1bpQ6ZPU9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Kif1bpQ6ZPU9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Kif1bpQ6ZPU9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Kif1bpQ6ZPU9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Kif1bpQ6ZPU9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Kif1bpQ6ZPU9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Kif1bpQ6ZPU9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Kif1bpQ6ZPU9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Kif1bpQ6ZPU9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Kif1bpQ6ZPU9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms