Protein–RNA interactions for Protein: Q60664

Lrmp, Lymphoid-restricted membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LrmpQ60664 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC43.88■■■■■ 4.62
LrmpQ60664 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
LrmpQ60664 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
LrmpQ60664 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
LrmpQ60664 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
LrmpQ60664 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
LrmpQ60664 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
LrmpQ60664 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
LrmpQ60664 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
LrmpQ60664 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
LrmpQ60664 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
LrmpQ60664 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
LrmpQ60664 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
LrmpQ60664 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
LrmpQ60664 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
LrmpQ60664 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
LrmpQ60664 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
LrmpQ60664 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
LrmpQ60664 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
LrmpQ60664 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
LrmpQ60664 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
LrmpQ60664 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
LrmpQ60664 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
LrmpQ60664 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
LrmpQ60664 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
LrmpQ60664 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35.66■■■■□ 3.3
LrmpQ60664 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
LrmpQ60664 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
LrmpQ60664 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
LrmpQ60664 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
LrmpQ60664 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
LrmpQ60664 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
LrmpQ60664 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
LrmpQ60664 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
LrmpQ60664 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
LrmpQ60664 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
LrmpQ60664 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
LrmpQ60664 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
LrmpQ60664 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
LrmpQ60664 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
LrmpQ60664 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
LrmpQ60664 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
LrmpQ60664 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
LrmpQ60664 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
LrmpQ60664 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
LrmpQ60664 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
LrmpQ60664 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
LrmpQ60664 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
LrmpQ60664 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
LrmpQ60664 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
LrmpQ60664 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
LrmpQ60664 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
LrmpQ60664 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
LrmpQ60664 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
LrmpQ60664 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
LrmpQ60664 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
LrmpQ60664 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
LrmpQ60664 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
LrmpQ60664 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33.78■■■■□ 3
LrmpQ60664 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
LrmpQ60664 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
LrmpQ60664 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
LrmpQ60664 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
LrmpQ60664 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
LrmpQ60664 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
LrmpQ60664 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
LrmpQ60664 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
LrmpQ60664 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
LrmpQ60664 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
LrmpQ60664 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.95
LrmpQ60664 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
LrmpQ60664 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
LrmpQ60664 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
LrmpQ60664 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
LrmpQ60664 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
LrmpQ60664 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33.2■■■□□ 2.9
LrmpQ60664 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
LrmpQ60664 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
LrmpQ60664 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
LrmpQ60664 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
LrmpQ60664 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
LrmpQ60664 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
LrmpQ60664 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
LrmpQ60664 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
LrmpQ60664 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
LrmpQ60664 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
LrmpQ60664 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC32.81■■■□□ 2.84
LrmpQ60664 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
LrmpQ60664 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32.76■■■□□ 2.83
LrmpQ60664 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
LrmpQ60664 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
LrmpQ60664 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
LrmpQ60664 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
LrmpQ60664 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
LrmpQ60664 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
LrmpQ60664 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
LrmpQ60664 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
LrmpQ60664 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
LrmpQ60664 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
LrmpQ60664 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms