Protein–RNA interactions for Protein: Q9R078

Prkab1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab1Q9R078 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC44,86■■■■■ 4,77
Prkab1Q9R078 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC41,49■■■■■ 4,23
Prkab1Q9R078 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,88■■■■■ 4,13
Prkab1Q9R078 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC39,15■■■■□ 3,86
Prkab1Q9R078 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC38,89■■■■□ 3,82
Prkab1Q9R078 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,42■■■■□ 3,74
Prkab1Q9R078 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC38,3■■■■□ 3,72
Prkab1Q9R078 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,97■■■■□ 3,67
Prkab1Q9R078 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,85■■■■□ 3,65
Prkab1Q9R078 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,75■■■■□ 3,63
Prkab1Q9R078 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37,59■■■■□ 3,61
Prkab1Q9R078 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC37,42■■■■□ 3,58
Prkab1Q9R078 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,24■■■■□ 3,55
Prkab1Q9R078 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,16■■■■□ 3,54
Prkab1Q9R078 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,54■■■■□ 3,44
Prkab1Q9R078 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,38■■■■□ 3,41
Prkab1Q9R078 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC36,28■■■■□ 3,4
Prkab1Q9R078 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36,2■■■■□ 3,38
Prkab1Q9R078 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC36,15■■■■□ 3,38
Prkab1Q9R078 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,13■■■■□ 3,37
Prkab1Q9R078 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC36,06■■■■□ 3,36
Prkab1Q9R078 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,98■■■■□ 3,35
Prkab1Q9R078 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35,86■■■■□ 3,33
Prkab1Q9R078 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,71■■■■□ 3,31
Prkab1Q9R078 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,7■■■■□ 3,31
Prkab1Q9R078 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,68■■■■□ 3,3
Prkab1Q9R078 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,68■■■■□ 3,3
Prkab1Q9R078 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,57■■■■□ 3,28
Prkab1Q9R078 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,52■■■■□ 3,28
Prkab1Q9R078 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,5■■■■□ 3,27
Prkab1Q9R078 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,46■■■■□ 3,27
Prkab1Q9R078 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC35,43■■■■□ 3,26
Prkab1Q9R078 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35,42■■■■□ 3,26
Prkab1Q9R078 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC35,36■■■■□ 3,25
Prkab1Q9R078 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35,33■■■■□ 3,25
Prkab1Q9R078 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,32■■■■□ 3,24
Prkab1Q9R078 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,14■■■■□ 3,22
Prkab1Q9R078 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34,76■■■■□ 3,15
Prkab1Q9R078 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34,67■■■■□ 3,14
Prkab1Q9R078 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,57■■■■□ 3,12
Prkab1Q9R078 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC34,51■■■■□ 3,12
Prkab1Q9R078 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,49■■■■□ 3,11
Prkab1Q9R078 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC34,44■■■■□ 3,1
Prkab1Q9R078 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,39■■■■□ 3,1
Prkab1Q9R078 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,34■■■■□ 3,09
Prkab1Q9R078 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC34,31■■■■□ 3,08
Prkab1Q9R078 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,3■■■■□ 3,08
Prkab1Q9R078 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC34,26■■■■□ 3,08
Prkab1Q9R078 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,22■■■■□ 3,07
Prkab1Q9R078 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC34,09■■■■□ 3,05
Prkab1Q9R078 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34,07■■■■□ 3,05
Prkab1Q9R078 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3,03
Prkab1Q9R078 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,97■■■■□ 3,03
Prkab1Q9R078 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33,93■■■■□ 3,02
Prkab1Q9R078 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC33,91■■■■□ 3,02
Prkab1Q9R078 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33,81■■■■□ 3
Prkab1Q9R078 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,77■■■■□ 3
Prkab1Q9R078 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,77■■■■□ 3
Prkab1Q9R078 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,75■■■□□ 2,99
Prkab1Q9R078 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC33,69■■■□□ 2,98
Prkab1Q9R078 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC33,59■■■□□ 2,97
Prkab1Q9R078 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33,52■■■□□ 2,96
Prkab1Q9R078 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33,5■■■□□ 2,95
Prkab1Q9R078 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,49■■■□□ 2,95
Prkab1Q9R078 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,43■■■□□ 2,94
Prkab1Q9R078 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC33,42■■■□□ 2,94
Prkab1Q9R078 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,41■■■□□ 2,94
Prkab1Q9R078 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC33,34■■■□□ 2,93
Prkab1Q9R078 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC33,33■■■□□ 2,93
Prkab1Q9R078 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC33,31■■■□□ 2,92
Prkab1Q9R078 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,3■■■□□ 2,92
Prkab1Q9R078 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC33,3■■■□□ 2,92
Prkab1Q9R078 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,27■■■□□ 2,92
Prkab1Q9R078 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33,26■■■□□ 2,91
Prkab1Q9R078 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33,25■■■□□ 2,91
Prkab1Q9R078 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC33,25■■■□□ 2,91
Prkab1Q9R078 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,24■■■□□ 2,91
Prkab1Q9R078 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,18■■■□□ 2,9
Prkab1Q9R078 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,15■■■□□ 2,9
Prkab1Q9R078 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,11■■■□□ 2,89
Prkab1Q9R078 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,1■■■□□ 2,89
Prkab1Q9R078 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33,1■■■□□ 2,89
Prkab1Q9R078 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,09■■■□□ 2,89
Prkab1Q9R078 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC33,07■■■□□ 2,88
Prkab1Q9R078 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,06■■■□□ 2,88
Prkab1Q9R078 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,05■■■□□ 2,88
Prkab1Q9R078 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,98■■■□□ 2,87
Prkab1Q9R078 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,98■■■□□ 2,87
Prkab1Q9R078 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,96■■■□□ 2,87
Prkab1Q9R078 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC32,92■■■□□ 2,86
Prkab1Q9R078 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32,91■■■□□ 2,86
Prkab1Q9R078 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC32,9■■■□□ 2,86
Prkab1Q9R078 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32,85■■■□□ 2,85
Prkab1Q9R078 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,85■■■□□ 2,85
Prkab1Q9R078 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32,83■■■□□ 2,85
Prkab1Q9R078 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC32,81■■■□□ 2,84
Prkab1Q9R078 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,74■■■□□ 2,83
Prkab1Q9R078 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,72■■■□□ 2,83
Prkab1Q9R078 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC32,68■■■□□ 2,82
Prkab1Q9R078 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32,67■■■□□ 2,82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,8 ms