Protein–RNA interactions for Protein: P16330

Cnp, 2',3'-cyclic-nucleotide 3'-phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnpP16330 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC46,29■■■■■ 5
CnpP16330 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC42,88■■■■■ 4,45
CnpP16330 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,26■■■■■ 4,36
CnpP16330 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC40,24■■■■■ 4,03
CnpP16330 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC40,2■■■■■ 4,03
CnpP16330 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC39,34■■■■□ 3,89
CnpP16330 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,1■■■■□ 3,85
CnpP16330 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,08■■■■□ 3,85
CnpP16330 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38,86■■■■□ 3,81
CnpP16330 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,66■■■■□ 3,78
CnpP16330 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC38,6■■■■□ 3,77
CnpP16330 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,42■■■■□ 3,74
CnpP16330 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,14■■■■□ 3,7
CnpP16330 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,61■■■■□ 3,61
CnpP16330 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC37,56■■■■□ 3,6
CnpP16330 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,46■■■■□ 3,59
CnpP16330 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC37,27■■■■□ 3,56
CnpP16330 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC37,21■■■■□ 3,55
CnpP16330 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37,14■■■■□ 3,54
CnpP16330 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,03■■■■□ 3,52
CnpP16330 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,92■■■■□ 3,5
CnpP16330 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,83■■■■□ 3,49
CnpP16330 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36,8■■■■□ 3,48
CnpP16330 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,77■■■■□ 3,48
CnpP16330 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,73■■■■□ 3,47
CnpP16330 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,68■■■■□ 3,46
CnpP16330 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,67■■■■□ 3,46
CnpP16330 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC36,62■■■■□ 3,45
CnpP16330 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC36,57■■■■□ 3,44
CnpP16330 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,47■■■■□ 3,43
CnpP16330 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,36■■■■□ 3,41
CnpP16330 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36,35■■■■□ 3,41
CnpP16330 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC36,1■■■■□ 3,37
CnpP16330 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3,35
CnpP16330 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,86■■■■□ 3,33
CnpP16330 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35,85■■■■□ 3,33
CnpP16330 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,64■■■■□ 3,3
CnpP16330 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC35,62■■■■□ 3,29
CnpP16330 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC35,56■■■■□ 3,28
CnpP16330 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,54■■■■□ 3,28
CnpP16330 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35,46■■■■□ 3,27
CnpP16330 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35,45■■■■□ 3,27
CnpP16330 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC35,41■■■■□ 3,26
CnpP16330 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35,34■■■■□ 3,25
CnpP16330 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC35,25■■■■□ 3,23
CnpP16330 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC35,16■■■■□ 3,22
CnpP16330 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC35,13■■■■□ 3,21
CnpP16330 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,1■■■■□ 3,21
CnpP16330 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,97■■■■□ 3,19
CnpP16330 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,81■■■■□ 3,16
CnpP16330 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC34,71■■■■□ 3,15
CnpP16330 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,69■■■■□ 3,14
CnpP16330 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,67■■■■□ 3,14
CnpP16330 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34,66■■■■□ 3,14
CnpP16330 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC34,63■■■■□ 3,13
CnpP16330 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC34,61■■■■□ 3,13
CnpP16330 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC34,59■■■■□ 3,13
CnpP16330 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,58■■■■□ 3,13
CnpP16330 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,48■■■■□ 3,11
CnpP16330 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34,48■■■■□ 3,11
CnpP16330 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC34,46■■■■□ 3,11
CnpP16330 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC34,46■■■■□ 3,11
CnpP16330 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,39■■■■□ 3,1
CnpP16330 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC34,35■■■■□ 3,09
CnpP16330 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC34,33■■■■□ 3,09
CnpP16330 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34,3■■■■□ 3,08
CnpP16330 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC34,29■■■■□ 3,08
CnpP16330 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,27■■■■□ 3,08
CnpP16330 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34,19■■■■□ 3,06
CnpP16330 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,16■■■■□ 3,06
CnpP16330 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC34,16■■■■□ 3,06
CnpP16330 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,16■■■■□ 3,06
CnpP16330 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC34,13■■■■□ 3,05
CnpP16330 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC34,13■■■■□ 3,05
CnpP16330 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,1■■■■□ 3,05
CnpP16330 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,05■■■■□ 3,04
CnpP16330 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,04■■■■□ 3,04
CnpP16330 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,03■■■■□ 3,04
CnpP16330 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34,01■■■■□ 3,03
CnpP16330 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33,99■■■■□ 3,03
CnpP16330 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC33,91■■■■□ 3,02
CnpP16330 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,89■■■■□ 3,02
CnpP16330 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33,88■■■■□ 3,01
CnpP16330 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,85■■■■□ 3,01
CnpP16330 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,8■■■■□ 3
CnpP16330 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC33,74■■■□□ 2,99
CnpP16330 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,7■■■□□ 2,99
CnpP16330 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,68■■■□□ 2,98
CnpP16330 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33,67■■■□□ 2,98
CnpP16330 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,65■■■□□ 2,98
CnpP16330 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,59■■■□□ 2,97
CnpP16330 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,58■■■□□ 2,97
CnpP16330 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,56■■■□□ 2,96
CnpP16330 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC33,54■■■□□ 2,96
CnpP16330 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,53■■■□□ 2,96
CnpP16330 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC33,5■■■□□ 2,95
CnpP16330 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC33,5■■■□□ 2,95
CnpP16330 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,48■■■□□ 2,95
CnpP16330 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33,46■■■□□ 2,95
CnpP16330 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,38■■■□□ 2,93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41,6 ms