Protein–RNA interactions for Protein: P06151

Ldha, L-lactate dehydrogenase A chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LdhaP06151 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC43.77■■■■■ 4.6
LdhaP06151 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
LdhaP06151 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
LdhaP06151 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
LdhaP06151 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
LdhaP06151 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
LdhaP06151 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
LdhaP06151 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
LdhaP06151 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
LdhaP06151 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
LdhaP06151 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
LdhaP06151 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
LdhaP06151 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
LdhaP06151 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
LdhaP06151 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
LdhaP06151 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
LdhaP06151 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
LdhaP06151 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
LdhaP06151 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
LdhaP06151 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
LdhaP06151 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
LdhaP06151 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
LdhaP06151 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
LdhaP06151 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35.56■■■■□ 3.28
LdhaP06151 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
LdhaP06151 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
LdhaP06151 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
LdhaP06151 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
LdhaP06151 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
LdhaP06151 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
LdhaP06151 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
LdhaP06151 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
LdhaP06151 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
LdhaP06151 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
LdhaP06151 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
LdhaP06151 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
LdhaP06151 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
LdhaP06151 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
LdhaP06151 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
LdhaP06151 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
LdhaP06151 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
LdhaP06151 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
LdhaP06151 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
LdhaP06151 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
LdhaP06151 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
LdhaP06151 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
LdhaP06151 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
LdhaP06151 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
LdhaP06151 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
LdhaP06151 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
LdhaP06151 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
LdhaP06151 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
LdhaP06151 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
LdhaP06151 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
LdhaP06151 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
LdhaP06151 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
LdhaP06151 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
LdhaP06151 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
LdhaP06151 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
LdhaP06151 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
LdhaP06151 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
LdhaP06151 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
LdhaP06151 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
LdhaP06151 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
LdhaP06151 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
LdhaP06151 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
LdhaP06151 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
LdhaP06151 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
LdhaP06151 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
LdhaP06151 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
LdhaP06151 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
LdhaP06151 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
LdhaP06151 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
LdhaP06151 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
LdhaP06151 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
LdhaP06151 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
LdhaP06151 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
LdhaP06151 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
LdhaP06151 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
LdhaP06151 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
LdhaP06151 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
LdhaP06151 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
LdhaP06151 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
LdhaP06151 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
LdhaP06151 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
LdhaP06151 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
LdhaP06151 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC32.68■■■□□ 2.82
LdhaP06151 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
LdhaP06151 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
LdhaP06151 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
LdhaP06151 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
LdhaP06151 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
LdhaP06151 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
LdhaP06151 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
LdhaP06151 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
LdhaP06151 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
LdhaP06151 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
LdhaP06151 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
LdhaP06151 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
LdhaP06151 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms