RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000107060.7

Eftud2-202, Transcript of 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Eftud2, Length 3,339 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Serp1Q9Z1W5 66 aa8.89□□□□□ -0.99
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Bean1Q9EQG5 255 aa8.87□□□□□ -0.99
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Stard9Q80TF6 4561 aa8.87□□□□□ -0.99
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Anapc11Q9CPX9 84 aa8.86□□□□□ -0.99
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pet100P0DJE0 76 aa8.85□□□□□ -0.99
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pkhd1E9PZ36 4059 aa8.84□□□□□ -0.99
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Atox1O08997 68 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
Eftud2-202ENSMUST00000107060 OxtP35454 125 aa8.82□□□□□ -1
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Lrp1bQ9JI18 4599 aa8.81□□□□□ -1
Eftud2-202ENSMUST00000107060 1700074P13RikQ9D9G7 251 aa8.81□□□□□ -1
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Igkv3-3A0A140T8Q0 119 aa8.8□□□□□ -1
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Brk1Q91VR8 75 aa8.79□□□□□ -1
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Krtap13O88375 197 aa8.79□□□□□ -1
Eftud2-202ENSMUST00000107060 H2al1aQ5M8Q2 105 aa8.78□□□□□ -1
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Coa5Q99M07 74 aa8.76□□□□□ -1.01
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cdc42se1Q8BHL7 80 aa8.74□□□□□ -1.01
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Dync1h1Q9JHU4 4644 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Fat1A0A1L1SQU7 4645 aa8.73□□□□□ -1.01
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Fat2Q5F226 4351 aa8.71□□□□□ -1.02
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Chtf8P0CG14 533 aa8.69□□□□□ -1.02
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm2696A0A1W2P709 240 aa8.68□□□□□ -1.02
Eftud2-202ENSMUST00000107060 A530084C06RikQ3UTW2 186 aa8.68□□□□□ -1.02
Eftud2-202ENSMUST00000107060 SacsQ9JLC8 4582 aa8.68□□□□□ -1.02
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Krtap10-10A0A1W2P7T6 217 aa8.67□□□□□ -1.02
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Dph3Q8K0W9 82 aa8.67□□□□□ -1.02
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Defb12Q8K4N3 78 aa8.66□□□□□ -1.02
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm10267M0QWD8 85 aa8.64□□□□□ -1.03
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cypt15B1AXS0 87 aa8.62□□□□□ -1.03
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pkhd1l1Q80ZA4 4249 aa8.6□□□□□ -1.03
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Spaca4Q80ZQ0 127 aa8.59□□□□□ -1.03
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm10197F6QEY5 67 aa8.59□□□□□ -1.04
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm10160F6Y577 67 aa8.57□□□□□ -1.04
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ryr3A2AGL3 4863 aa8.5□□□□□ -1.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Wfdc3Q14AE4 130 aa8.5□□□□□ -1.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm10643Q3URG9 111 aa8.5□□□□□ -1.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mrpl55Q9CZ83 127 aa8.49□□□□□ -1.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Phxr4P15974 95 aa8.48□□□□□ -1.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Defb13Q8R2I4 64 aa8.47□□□□□ -1.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rps29P62274 56 aa8.46□□□□□ -1.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Vps13bQ80TY5 3993 aa8.46□□□□□ -1.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm10337F7DEP7 55 aa8.44□□□□□ -1.06
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Krtap3-2Q9D638 99 aa8.43□□□□□ -1.06
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Krtap3-3Q9D7P0 99 aa8.43□□□□□ -1.06
Eftud2-202ENSMUST00000107060 H2al1bA0A087WP11 105 aa8.42□□□□□ -1.06
Eftud2-202ENSMUST00000107060 H2al1kJ3QP08 105 aa8.42□□□□□ -1.06
Eftud2-202ENSMUST00000107060 H2al1eQ810S6 105 aa8.42□□□□□ -1.06
Eftud2-202ENSMUST00000107060 H2al1mQ9DAD9 105 aa8.42□□□□□ -1.06
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm21798J3QNU5 87 aa8.42□□□□□ -1.06
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ryr2E9Q401 4966 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Defb38Q7TNV7 63 aa8.4□□□□□ -1.07
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm11939A2A592 99 aa8.33□□□□□ -1.08
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm20661K7N787 53 aa8.32□□□□□ -1.08
Eftud2-202ENSMUST00000107060 A930033H14RikG5E8X6 103 aa8.31□□□□□ -1.08
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Kmt2cQ8BRH4 4903 aa8.31□□□□□ -1.08
Eftud2-202ENSMUST00000107060 RetnlbQ99P86 105 aa8.3□□□□□ -1.08
Eftud2-202ENSMUST00000107060 4933415A04RikQ9D443 101 aa8.3□□□□□ -1.08
Eftud2-202ENSMUST00000107060 2310079G19RikQ9D6L6 185 aa8.29□□□□□ -1.08
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm26620Q9CY65 116 aa8.28□□□□□ -1.08
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Sox16Q62247 57 aa8.24□□□□□ -1.09
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm10999F6Q4M4 69 aa8.23□□□□□ -1.09
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Krtap19-5O08632 62 aa8.21□□□□□ -1.09
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Lrp1Q91ZX7 4545 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
Eftud2-202ENSMUST00000107060 2310034C09RikQ9D746 214 aa8.2□□□□□ -1.1
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Q8BGJ3 129 aa8.19□□□□□ -1.1
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Fat3Q8BNA6 4555 aa8.17□□□□□ -1.1
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Dnah8Q91XQ0 4731 aa8.16□□□□□ -1.1
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Uqcr11Q9CPX8 56 aa8.16□□□□□ -1.1
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ryr1E9PZQ0 5035 aa8.16□□□□□ -1.1
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ndufb1P0DN34 57 aa8.15□□□□□ -1.1
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Limd2Q8BGB5 128 aa8.14□□□□□ -1.11
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm4491E0CX42 125 aa8.11□□□□□ -1.11
Eftud2-202ENSMUST00000107060 4930507D05RikQ8C9C9 103 aa8.08□□□□□ -1.12
Eftud2-202ENSMUST00000107060 D6Ertd527eA0A0N4SWI3 464 aa8.07□□□□□ -1.12
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm5767A0A0J9YTU8 78 aa8.04□□□□□ -1.12
Eftud2-202ENSMUST00000107060 SptssbQ925E8 76 aa8.03□□□□□ -1.12
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Abca13Q5SSE9 5034 aa7.98□□□□□ -1.13
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm9736A0A1W2P7N1 277 aa7.96□□□□□ -1.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Defb1P56386 69 aa7.95□□□□□ -1.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mycbp2Q7TPH6 4711 aa7.94□□□□□ -1.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Dnhd1D3Z2X2 4750 aa7.91□□□□□ -1.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm3646F6S692 53 aa7.9□□□□□ -1.15
Eftud2-202ENSMUST00000107060 9230102O04RikA2ASX7 82 aa7.86□□□□□ -1.15
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm5965D3Z724 196 aa7.85□□□□□ -1.15
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rpl37Q9D823 97 aa7.84□□□□□ -1.15
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cox6b2Q80ZN9 88 aa7.83□□□□□ -1.16
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Birc6O88738 4882 aa7.75□□□□□ -1.17
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rnase13Q5GAM7 153 aa7.73□□□□□ -1.17
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Krtap15-1Q9QZU5 150 aa7.73□□□□□ -1.17
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm17416Q30KP4 66 aa7.73□□□□□ -1.17
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Herc2Q4U2R1 4836 aa7.69□□□□□ -1.18
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Kiaa1109A2AAE1 5005 aa7.67□□□□□ -1.18
Eftud2-202ENSMUST00000107060 1700042G07RikB1AUF7 90 aa7.65□□□□□ -1.18
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Sec61gP60060 68 aa7.61□□□□□ -1.19
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm9821Q8K076 103 aa7.59□□□□□ -1.19
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ndufs5Q99LY9 106 aa7.57□□□□□ -1.2
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm20537G3UYK7 97 aa7.57□□□□□ -1.2
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Krtap3-1A2A591 98 aa7.56□□□□□ -1.2
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pla2g10Q9QXX3 151 aa7.56□□□□□ -1.2
Eftud2-202ENSMUST00000107060 HydinQ80W93 5154 aa7.53□□□□□ -1.2
Eftud2-202ENSMUST00000107060 2210017I01RikA0A0A6YVV1 95 aa7.52□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 75.6 ms